公开(公告)号：US20110275102A1

公开(公告)日：2011-11-10

申请号：US13021048

申请日：2011-02-04

申请人： Dario Alessi ,  Mirjana Andjelkovic ,  Philip Cohen ,  Peter David Cron ,  Darren Cross ,  Brian A. Hemmings

发明人： Dario Alessi ,  Mirjana Andjelkovic ,  Philip Cohen ,  Peter David Cron ,  Darren Cross ,  Brian A. Hemmings

IPC分类号： C12Q1/48 ,  C12N9/12 ,  C07K7/06

CPC分类号： C07K14/47 ,  A61K38/00 ,  C12N9/12 ,  C12N9/1205 ,  C12Q1/42 ,  C12Q1/48

摘要： The invention concerns RAC-PK and fragments thereof, as well as activators and inhibitors of RAC-PK for use as medicaments, particularly in the treatment of diseases concerned with abnormalities in processes modulated by insulin, such as cellular proliferation, insulin deficiency and/or excess blood sugar levels. Moreover, the invention provides RAC-PK for use in screening potential mimics or modulators thereof. A method for screening for agents capable of affecting the activity of GSK3 is also disclosed. The invention further provides a screening kit comprising the RAC-PK as an active principle, and a method for screening compounds which are candidate mimics or modulators of RAC-PK activity comprising detecting specific interactions between the candidate compounds and RAC-PK. There is also provided a process for activating RAC-PK comprising treatment thereof with a phosphatase inhibitor.

摘要翻译： 本发明涉及RAC-PK及其片段，以及用作药物的RAC-PK的活化剂和抑制剂，特别是用于治疗与胰岛素调节的过程有关的疾病如细胞增殖，胰岛素缺乏和/或 血糖过高。 此外，本发明提供了用于筛选潜在模拟物或其调节剂的RAC-PK。 还公开了能够影响GSK3活性的试剂的筛选方法。 本发明进一步提供了包含作为活性成分的RAC-PK的筛选试剂盒，以及筛选作为RAC-PK活性的候选模拟物或调节剂的化合物的方法，包括检测候选化合物与RAC-PK之间的特异性相互作用。 还提供了用于激活RAC-PK的方法，其包括用磷酸酶抑制剂处理它。

公开(公告)号：US20110256553A1

公开(公告)日：2011-10-20

申请号：US12763005

申请日：2010-04-19

申请人： R. Jeremy Nichols ,  Dario Alessi ,  Nicolas Dzamko

发明人： R. Jeremy Nichols ,  Dario Alessi ,  Nicolas Dzamko

IPC分类号： G01N33/53 ,  C12Q1/48 ,  C07K16/00

CPC分类号： C07K16/40 ,  G01N33/5052

摘要： A method for assessing the effect of a test compound on LRRK2 in a cell-based system, the method comprising the steps of a) assessing the effect of exposing the cell-based system comprising LRRK2 to the test compound on the phosphorylation state of Ser910 and/or Ser935 of the LRRK2; and/or b) assessing the effect of exposing the cell-based system comprising LRRK2 to the test compound on the binding of the LRRK2 to a 14-3-3 polypeptide. The method is considered to be useful in assessing the effect of putative LRRK2 inhibitors in cell based systems, including in vivo systems.

摘要翻译： 一种用于评估测试化合物对基于细胞的系统中LRRK2的影响的方法，所述方法包括以下步骤：a）评估将包含LRRK2的基于细胞的系统暴露于测试化合物对Ser910的磷酸化状态的影响，以及 /或LRRK2的Ser935; 和/或b）评估将包含LRRK2的基于细胞的系统暴露于测试化合物对LRRK2与14-3-3多肽的结合的影响。 该方法被认为可用于评估推定的LRRK2抑制剂在基于细胞的系统（包括体内系统）中的作用。

公开(公告)号：US07792665B2

公开(公告)日：2010-09-07

申请号：US10517225

申请日：2003-06-09

申请人： Dario Alessi ,  Ricardo Biondi ,  David Komander ,  Daan Van Aalten

发明人： Dario Alessi ,  Ricardo Biondi ,  David Komander ,  Daan Van Aalten

IPC分类号： G01N31/00 ,  G06F19/00 ,  G06G7/48

CPC分类号： C07D498/22 ,  C12Q1/485 ,  C22C43/00

摘要： A method for selecting a compound for modulating the activity of phosphoinositide dependent protein kinase 1 (PDKI) is provided. The method may comprise modelling a three dimensional structure of a plurality of molecules in a computer, comparing with the three dimensional structure of the compounds with that of a reference structure such as at least part of a protein kinase catalytic domain of PDK1, and selecting the compound based on a predicted interacting ability of the molecules to the protein kinase catalytic domain. Also a method for selecting a compound for modulating the activity of hydrophobic pocket containing protein kinase is provided. In this method, the reference structures may be one or more of a phosphate binding pocket of PDK1, a hydrophobic pocket of PDK1, and αC helix or region interacting therewith of PDK1.

摘要翻译： 提供了选择用于调节磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1（PDK1）的活性的化合物的方法。 该方法可以包括对计算机中的多个分子的三维结构进行建模，与化合物的三维结构与参考结构的三维结构（例如PDK1的蛋白激酶催化结构域的至少一部分）相比较，并且选择 基于预测的分子与蛋白激酶催化结构域的相互作用能力的化合物。 还提供了选择用于调节含有蛋白激酶的疏水口袋的活性的化合物的方法。 在该方法中，参考结构可以是PDK1的磷酸结合口袋，PDK1的疏水口袋和αC螺旋或与PDK1相互作用的区域中的一种或多种。

公开(公告)号：US20070036793A1

公开(公告)日：2007-02-15

申请号：US10565058

申请日：2004-07-16

申请人： David Hardie ,  Dario Alessi ,  Jerome Boudeau

发明人： David Hardie ,  Dario Alessi ,  Jerome Boudeau

IPC分类号： A61K39/395 ,  G01N33/53 ,  C12P21/06 ,  C12N9/12

CPC分类号： C12N9/1205 ,  C07K14/82

摘要： A method for identifying a compound for use in modulating, for example promoting, the activation or phosphorylation of AMPK (AMP-activated protein kinase) or AMPK subfamily member in a cell, the method comprising the steps of (1) determining whether a test compound modulates, for example promotes, the protein kinase activity of LKB1 and (2) selecting a compound which modulates, for example promotes, the protein kinase activity of LKB1. The protein kinase activity may be tested using AMPK or an AMPK subfamily member, or a peptide encompassing the T-loop region of AMPK or an AMPK subfamily member. The LKB1 may be in a preparation or complex with STRAD and/or M025, which has much greater kinase activity than LKB1 in the absence of these accessory proteins. The LKB1, STRAD or M025 may be recombinant. The AMPK subfamily member may be AMPKα1, AMPKα2, NUAK1, NUAK2, BRSK1, BRSK2, SIK, QIK, QSK, MARK1, MARK2, MARK3, MARK4 or MELK.

摘要翻译： 一种用于鉴定用于调节例如促进细胞中AMPK（AMP-活化蛋白激酶）或AMPK亚族成员的活化或磷酸化的化合物的方法，所述方法包括以下步骤：（1）确定测试化合物 调节，例如促进LKB1的蛋白激酶活性，和（2）选择调节，例如促进LKB1的蛋白激酶活性的化合物。 可以使用AMPK或AMPK亚族成员或包含AMPK的T环区域或AMPK亚族成员的肽来测试蛋白激酶活性。 LKB1可能与STRAD和/或M025的制备或复合物相比，在没有这些辅助蛋白质的情况下，其具有比LKB1大得多的激酶活性。 LKB1，STRAD或M025可以是重组的。 AMPK亚族成员可以是AMPKalpha1，AMPKalpha2，NUAK1，NUAK2，BRSK1，BRSK2，SIK，QIK，QSK，MARK1，MARK2，MARK3，MARK4或MELK。

公开(公告)号：US08367349B2

公开(公告)日：2013-02-05

申请号：US12828674

申请日：2010-07-01

申请人： Nicolas Dzamko ,  Dario Alessi ,  R. Jeremy Nichols

发明人： Nicolas Dzamko ,  Dario Alessi ,  R. Jeremy Nichols

IPC分类号： G01N33/566

CPC分类号： C12Q1/485 ,  C07K16/40 ,  C07K2317/30 ,  C07K2317/34 ,  G01N33/5008 ,  G01N33/573 ,  G01N2333/912 ,  G01N2440/14 ,  G01N2500/00 ,  G01N2800/2835

摘要： A method for assessing the effect of a test compound on LRRK2 in a cell-based system, the method comprising the steps of a) assessing the effect of exposing the cell-based system comprising LRRK2 to the test compound on the phosphorylation state of Ser910 and/or Ser935 of the LRRK2; and/or b) assessing the effect of exposing the cell-based system comprising LRRK2 to the test compound on the binding of the LRRK2 to a 14-3-3 polypeptide. The method may comprise or further comprise the step of assessing the effect of exposing the cell-based system comprising LRRK2 to the test compound on the subcellular location of LRRK2. The method is considered to be useful in assessing the effect of putative LRRK2 inhibitors in cell based systems, including in vivo systems.

摘要翻译： 一种用于评估测试化合物对基于细胞的系统中LRRK2的影响的方法，所述方法包括以下步骤：a）评估将包含LRRK2的基于细胞的系统暴露于测试化合物对Ser910的磷酸化状态的影响，以及 /或LRRK2的Ser935; 和/或b）评估将包含LRRK2的基于细胞的系统暴露于测试化合物对LRRK2与14-3-3多肽的结合的影响。 该方法可以包括或进一步包括评估将包含LRRK2的基于细胞的系统暴露于LRRK2的亚细胞位置上的测试化合物的效果的步骤。 该方法被认为可用于评估推定的LRRK2抑制剂在基于细胞的系统（包括体内系统）中的作用。

公开(公告)号：US20110256062A1

公开(公告)日：2011-10-20

申请号：US12828674

申请日：2010-07-01

申请人： Nicolas Dzamko ,  Dario Alessi ,  R. Jeremy Nichols

发明人： Nicolas Dzamko ,  Dario Alessi ,  R. Jeremy Nichols

IPC分类号： A61K49/00 ,  A61P25/28 ,  G01N33/53 ,  C07K16/00

CPC分类号： C12Q1/485 ,  C07K16/40 ,  C07K2317/30 ,  C07K2317/34 ,  G01N33/5008 ,  G01N33/573 ,  G01N2333/912 ,  G01N2440/14 ,  G01N2500/00 ,  G01N2800/2835

摘要： A method for assessing the effect of a test compound on LRRK2 in a cell-based system, the method comprising the steps of a) assessing the effect of exposing the cell-based system comprising LRRK2 to the test compound on the phosphorylation state of Ser910 and/or Ser935 of the LRRK2; and/or b) assessing the effect of exposing the cell-based system comprising LRRK2 to the test compound on the binding of the LRRK2 to a 14-3-3 polypeptide. The method may comprise or further comprise the step of assessing the effect of exposing the cell-based system comprising LRRK2 to the test compound on the subcellular location of LRRK2. The method is considered to be useful in assessing the effect of putative LRRK2 inhibitors in cell based systems, including in vivo systems.

摘要翻译： 一种用于评估测试化合物对基于细胞的系统中LRRK2的影响的方法，所述方法包括以下步骤：a）评估将包含LRRK2的基于细胞的系统暴露于测试化合物对Ser910的磷酸化状态的影响，以及 /或LRRK2的Ser935; 和/或b）评估将包含LRRK2的基于细胞的系统暴露于测试化合物对LRRK2与14-3-3多肽的结合的影响。 该方法可以包括或进一步包括评估将包含LRRK2的基于细胞的系统暴露于LRRK2的亚细胞位置上的测试化合物的影响的步骤。 该方法被认为可用于评估推定的LRRK2抑制剂在基于细胞的系统（包括体内系统）中的作用。

公开(公告)号：US20070196883A1

公开(公告)日：2007-08-23

申请号：US11671265

申请日：2007-02-05

申请人： Dario Alessi ,  Anudharan Balendran ,  Maria Deak ,  Richard Currie ,  Peter Downes ,  Antonio Casamayor

发明人： Dario Alessi ,  Anudharan Balendran ,  Maria Deak ,  Richard Currie ,  Peter Downes ,  Antonio Casamayor

IPC分类号： C12Q1/48 ,  C07H21/04 ,  C12P21/06 ,  C12N9/12

CPC分类号： C12N9/12

摘要： The present invention relates to methods of altering the substrate specificity of PDK1, methods of identifying compounds which modulate the activity of PDK1 and methods of using PDK1 having altered substrate specificity.

摘要翻译： 本发明涉及改变PDK1底物特异性的方法，鉴定调节PDK1活性的化合物的方法和使用具有改变的底物特异性的PDK1的方法。

公开(公告)号：US20070054328A1

公开(公告)日：2007-03-08

申请号：US10573508

申请日：2004-09-27

申请人： Wendy Kimber ,  Dario Alessi

发明人： Wendy Kimber ,  Dario Alessi

IPC分类号： G01N33/574 ,  A61K38/55

CPC分类号： G01N33/6893 ,  C12Q1/42 ,  G01N2500/00

摘要： A method for identifying a compound for modulating the cellular activity or location of PTPL1, comprising the step of identifying a compound that modulates the interaction of PTPL1 with TAPP; or which modulates or mimics the interaction of TAPP with Ptdlns(3, 4)P2; or which modulates the cellular location of TAPP. A method of treating a patient with diabetes or in need of inhibition of apoptosis, for example in the treatment of ischaemic disease, wound healing or nerve regeneration, wherein the patient is administered an effective amount of a compound that inhibits the interaction of PtdIns(3, 4)P2 with TAPP or that inhibits the interaction of TAPP with PTPL1. A method of treating a patient in need of promotion of apoptosis, for example in treating cancer or in the resolution of inflammation, wherein the patient is administered an effective amount of a compound that promotes the interaction of TAPP with PtdIns(3, 4)P2 or that mimics the effect of PtdIns(3, 4)P2 on TAPP, or that promotes the interaction of TAPP with PTPL1.

摘要翻译： 鉴定用于调节PTPL1的细胞活性或位置的化合物的方法，包括鉴定调节PTPL1与TAPP的相互作用的化合物的步骤; 或其调节或模拟TAPP与Ptdlns（3,4）P <2的相互作用; 或调节TAPP的细胞位置。 一种治疗患有糖尿病或需要抑制细胞凋亡的患者的方法，例如治疗缺血性疾病，伤口愈合或神经再生，其中给予患者有效量的抑制PtdIns（3 ，4）使用TAPP的P 或抑制TAPP与PTPL1的相互作用。 一种治疗需要促进细胞凋亡的患者的方法，例如治疗癌症或解决炎症，其中给予患者有效量的促进TAPP与PtdIns（3,4）P的相互作用的化合物 或者模拟TAPP上PtdIns（3,4）P 的作用，或促进TAPP与PTPL1的相互作用。

公开(公告)号：US20050032185A1

公开(公告)日：2005-02-10

申请号：US10689576

申请日：2003-10-20

申请人： Dario Alessi

发明人： Dario Alessi

IPC分类号： C12N15/09 ,  C07K16/40 ,  C12N1/15 ,  C12N1/19 ,  C12N1/21 ,  C12N5/10 ,  C12N9/00 ,  C12N9/12 ,  C12N15/54 ,  C12Q1/48 ,  C12Q1/68 ,  C07H21/04

CPC分类号： C12N9/1205 ,  C07K2319/00

摘要： The present invention provides for a substantially pure human or rabbit 3-phosphoinositide-dependent protein kinase.

摘要翻译： 本发明提供基本上纯的人或兔3-磷酸肌醇依赖性蛋白激酶。

公开(公告)号：US20100068742A1

公开(公告)日：2010-03-18

申请号：US12553932

申请日：2009-09-03

申请人： Dario Alessi ,  R. Jeremy Nichols

发明人： Dario Alessi ,  R. Jeremy Nichols

IPC分类号： C12Q1/48 ,  C07K7/06 ,  C07K14/00 ,  C07H21/04 ,  C07K16/00

CPC分类号： C12Q1/485 ,  C12N9/12 ,  G01N2800/2835

摘要： A method for identifying a compound expected to be useful in modulating, for example inhibiting, LRRK2 protein kinase activity, the method comprising the steps of (1) determining whether a test compound modulates, for example inhibits, the protein kinase activity of a LRRK2 polypeptide on a substrate polypeptide and (2) selecting a compound which modulates, for example inhibits, the said LRRK2 polypeptide protein kinase activity, wherein the substrate polypeptide comprises the sequence (W/F/R/K)(W/F/R/K)(R/K)(F/W/H/R)(Y/W/R)(S/T)(L/V/I) (R/K)(R/K)(A/Y) or (W/R)(X)(X)(F/Y/H/T)(Y/W/R)(T)(X)(R/T)(R)(X), where X represents any amino acid. Such a compound may be useful in treating Parkinson's Disease or Parkinsonism. The substrate polypeptide may consist or comprise the sequence RLGWWRFYTLRRARQGNTKQ.

摘要翻译： 鉴定预期可用于调节例如抑制LRRK2蛋白激酶活性的化合物的方法，所述方法包括以下步骤：（1）测定测试化合物是否调节例如抑制LRRK2多肽的蛋白激酶活性 （2）选择调节例如抑制所述LRRK2多肽蛋白激酶活性的化合物，其中所述底物多肽包含序列（W / F / R / K）（W / F / R / K ）（R / K）（F / W / H / R）（Y / W / R）（S / T）（L / V / I）（R / K）（R / K）（A / Y） （W / R）（X）（X）（F / Y / H / T）（Y / W / R）（T）（X）（R / T）（R）（X） 酸。 这种化合物可用于治疗帕金森病或帕金森综合征。 底物多肽可以包含或包含序列RLGWWRFYTLRRARQGNTKQ。