公开(公告)号：US20140309128A1

公开(公告)日：2014-10-16

申请号：US14210199

申请日：2014-03-13

Applicant: Bio-Rad Laboratories, Inc.

Inventor： John Regan ,  Samantha Cooper ,  Austin So ,  Ryan Koehler ,  Luz Montesclaros

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6858 ,  C12Q2545/114 ,  C12Q2561/101 ,  C12Q2563/159

Abstract: Provided herein are methods, compositions, and kits for detecting alleles using a single probe or a single primer set. Also, provided herein are methods, compositions, and kits for detecting allelic variants using a single probe or a single primer set. Also, provided herein are methods, compositions, and kits for determining a polymerization error rate.

Abstract translation: 本文提供了使用单个探针或单一引物组检测等位基因的方法，组合物和试剂盒。 此外，本文提供的是使用单个探针或单个引物组检测等位基因变体的方法，组合物和试剂盒。 此外，本文提供了用于确定聚合误差率的方法，组合物和试剂盒。

公开(公告)号：US09422602B2

公开(公告)日：2016-08-23

申请号：US13968365

申请日：2013-08-15

Applicant: Bio-Rad Laboratories, Inc.

Inventor： Austin So

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6851 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6876 ,  Y10T436/143333

Abstract: Described herein are methods, systems, compositions and kits to enable determination of a level of degradation of nucleic acids in a sample. For example, the determination of the amount of degradation of RNA in a sample can be accomplished by labeling one or both of the intact 5′- and/or 3′-ends of an mRNA molecule by taking advantage of the unique diol moiety present at these structures. Labeled nucleotides can then be partitioned into droplets and the amount of degradation can be determined by detecting label present in the partitions and making quantitative or qualitative comparisons with a reference sample. In some cases, the degree of degradation is also determined by factoring in the total concentration or quantity of RNA in the sample.

Abstract translation: 本文描述了能够确定样品中核酸降解水平的方法，系统，组合物和试剂盒。 例如，样品中RNA的降解量的测定可以通过利用存在于mRNA分子中的独特的二醇部分来标记mRNA分子的完整的5'-和/或3'末端的一个或两个来完成 这些结构。 标记的核苷酸然后可以分成液滴，并且可以通过检测存在于分区中的标记并与参考样品进行定量或定性比较来确定降解量。 在某些情况下，降解程度也通过考虑样品中RNA的总浓度或数量来确定。

公开(公告)号：US20140051595A1

公开(公告)日：2014-02-20

申请号：US13968365

申请日：2013-08-15

Applicant: Bio-Rad Laboratories, Inc.

Inventor： Austin So

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6851 ,  C12Q1/68 ,  C12Q1/6876 ,  Y10T436/143333

Abstract: Described herein are methods, systems, compositions and kits to enable determination of a level of degradation of nucleic acids in a sample. For example, the determination of the amount of degradation of RNA in a sample can be accomplished by labeling one or both of the intact 5′- and/or 3′-ends of an mRNA molecule by taking advantage of the unique diol moiety present at these structures. Labeled nucleotides can then be partitioned into droplets and the amount of degradation can be determined by detecting label present in the partitions and making quantitative or qualitative comparisons with a reference sample. In some cases, the degree of degradation is also determined by factoring in the total concentration or quantity of RNA in the sample.

Abstract translation: 本文描述了能够确定样品中核酸降解水平的方法，系统，组合物和试剂盒。 例如，样品中RNA的降解量的测定可以通过利用存在于mRNA分子中的独特的二醇部分来标记mRNA分子的完整的5'-和/或3'末端的一个或两个来完成 这些结构。 标记的核苷酸然后可以分成液滴，并且可以通过检测存在于分区中的标记并与参考样品进行定量或定性比较来确定降解量。 在某些情况下，降解程度也通过考虑样品中RNA的总浓度或数量来确定。

公开(公告)号：US09347095B2

公开(公告)日：2016-05-24

申请号：US14210199

申请日：2014-03-13

Applicant: Bio-Rad Laboratories, Inc.

Inventor： John Regan ,  Samantha Cooper ,  Austin So ,  Ryan Koehler ,  Luz Montesclaros

IPC: C12P19/34 ,  C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6858 ,  C12Q2545/114 ,  C12Q2561/101 ,  C12Q2563/159

Abstract: Provided herein are methods, compositions, and kits for detecting alleles using a single probe or a single primer set. Also, provided herein are methods, compositions, and kits for detecting allelic variants using a single probe or a single primer set. Also, provided herein are methods, compositions, and kits for determining a polymerization error rate.

Abstract translation: 本文提供了使用单个探针或单一引物组检测等位基因的方法，组合物和试剂盒。 此外，本文提供的是使用单个探针或单个引物组检测等位基因变体的方法，组合物和试剂盒。 此外，本文提供了用于确定聚合误差率的方法，组合物和试剂盒。