公开(公告)号：WO2013152505A1

公开(公告)日：2013-10-17

申请号：PCT/CN2012/074007

申请日：2012-04-13

Applicant: 深圳华大基因科技服务有限公司 ,  吴耿雄 ,  黄伟华 ,  谢寅龙 ,  唐静波 ,  王俊 ,  汪建 ,  杨焕明

Inventor： 吴耿雄 ,  黄伟华 ,  谢寅龙 ,  唐静波 ,  王俊 ,  汪建 ,  杨焕明

IPC: G06F19/20

CPC classification number: G06F19/22 ,  G06F19/20

Abstract: 提供了一种转录组的组装方法，包括如下步骤：将测序的样本转录组读序构建为德布鲁因图；对德布鲁因图进行过滤和线性化处理，形成连续的叠连群；获取该叠连群之间的联系，进行对联系数据的过滤；将没有分叉的连续序列进行线性化处理；输出重叠群序列；将读序和末端配对读序与输出的重叠群序列进行比对，获得读序和重叠群之间的信息；建立重叠群之间的连接，构建以重叠群为点，连接为边的图；对获得的图进行预处理和划分，获得独立的子图；根据子图输出转录本。还提供了一种基于该方法的转录组组装系统。