本申请公开了一种两挡变速车辆的换挡控制方法及系统，方法包括：基于换挡电机的电流，以确定两挡锁止点；在加速踏板开度及车速信号表明到达目标挡位的换挡点时，整车控制器触发起动发电一体机的电机降低扭矩到第一门限值，变速器控制器调用换挡程序以调节换挡角度；变速器控制器监测在换挡角度达到所述空挡点时，整车控制器控制起动发电一体机的电机进入转速运行模式，以调节起动发电一体机的电机转速至目标转速，变速器控制器调用挂挡程序，以控制换挡电机运转，使得换挡角度到达目标挡位的锁止点，整车控制器调用动力恢复程序，控制起动发电一体机的电机进入扭矩运行模式，以增加扭矩至预设的第二门限值，完成换挡。