本发明公开了一种能够显著抑制结直肠癌发生的乳酸乳球菌乳酸亚种(Lactococcus lactis subsp.lactis)及其用途，属于微生物技术领域。本发明提供的乳酸乳球菌乳酸亚种VM5，其保藏编号为GDMCC No.60256，能耐受胃酸和胆盐，能够显著地减轻结直肠癌模型小鼠结直肠部位的炎症反应，通过调节结直肠组织中Notch1信号通路及VEGFR2分子的表达，减少模型小鼠结、直肠部位的肿瘤数量。此外，乳酸乳球菌乳酸亚种VM5还可以改善肠道菌群结构和肠道内短链脂肪酸水平。所述的乳酸乳球菌乳酸亚种VM5用于制备抑制结直肠癌发生的发酵食品，具有非常广泛的应用前景。