本发明涉及一种抑制山羊副流感病毒3型（CPIV3）复制的靶标位点序列及其在制备抗山羊副流感病毒3型药物中的应用。所述抑制山羊副流感病毒3型复制的靶标位点序列位于干扰素调节基因2（IRF2）的3’UTR中，其核苷酸序列如SEQ ID NO:19所示，受bta‑miR‑222序列直接靶定，从而降解IRF2的mRNA，降低IRF2蛋白的表达量，提高Ⅰ型干扰素表达水平，抑制CPIV3增殖。该靶标位点序列为研发新的治疗因CPIV3引发的疾病的抗病毒药物提供了一个新的药物靶点。此外还可应用于评价bta‑miR‑222调节IRF2转录水平，以及培育抗山羊副流感病毒3型转基因羊方面。