本发明公开了一种基于电磁导引双侧轨道的相对式智能吹扫系统，包括供风系统、移动吹扫系统、以及排风除尘系统；所述移动吹扫系统包括底部移动吹扫机器人和顶部移动吹扫机器人，前者包括电磁导引AGV小车，沿着检查坑车辆轨道两侧预设的电磁导引金属线缆行驶。本发明快速而高效地清除车辆的灰尘，改善了吹扫库内的作业环境，实现了轨道交通车辆车底、车侧、车顶立体全方位吹扫，且电磁导引方式，引线隐蔽，不易污染和破损，导引原理简单而可靠，便于控制和通讯，对声光无干扰，制造成本较低，当吹扫车辆型号、编组长度发生变化时，可根据车辆吹扫需求扩充或更改吹扫路径，具有定位准确，灵活性较高，拆装方便的优点。