本发明公开了一种基于开盖自毁的设备安全控制系统及方法，其中，该系统包括触发机构和自毁单元；其中，自毁单元包括DC/DC模块、高性能电池、稳压模块、FPGA、加断电控制电路、防短接检测电路和加解密模块；当外部的盖板被恶意拆解时，触发机构工作，高性能电池通过稳压模块转换为3.3v电压、2.5v电压、1.5v电压，并输出给FPGA；同时FPGA检测到自毁检测信息，FPGA将销毁指令发送给加解密模块；加解密模块收到销毁指令后清除存储的信息；FPGA发送完销毁指令后再清除其自身存储的信息。本发明当设备遭到恶意拆解时，能够启动自毁程序，销毁设备内部存储的关键内容和关键信息，防止窃密者通过直接破解内部存储芯片而获得设备中存储的信息。