本发明涉及一种用于药柱整形的装夹防护装置。三爪卡盘夹持药柱进行加工时，在卡盘夹爪侧安装夹爪端密封防护装置，用于防止药柱加工过程中产生的药屑、粉尘从卡盘夹爪端进入三爪卡盘；在卡盘内腔圆筒段安装中心隔离筒，用于隔离药柱与三爪卡盘，杜绝药柱加工碎屑和粉尘进入三爪卡盘内部零件缝隙内；在卡盘法兰侧安装法兰端密封防护装置，用于防止药柱加工过程中产生的药屑、粉尘从三爪卡盘法兰端进入三爪卡盘。本发明在固体火箭发动机包覆药柱整形加工过程中，装夹防护装置不会对药柱产生附加扰动力，也不会改变其原有姿态，阻止药柱加工碎屑进入卡盘内部从而有效防止卡盘内部腐蚀，提高药柱加工时的清洁度和安全性。