本申请提供了一种高速磁浮列车制动系统和方法，该系统中的牵引切断单元将牵引切断指令发送至短接制动控制单元。短接制动控制单元根据牵引切断指令发送开关控制信号至定子开关站控制单元。定子开关站控制单元根据开关控制信号控制馈线柜的第一支路中的真空接触器断开，控制短接制动柜的第二支路中的真空断路器闭合。第二支路和长定子直线电机中的长定子绕组组成短接制动回路。当第一支路中的真空接触器断开，第二支路中的真空断路器闭合时，短接制动回路和高速磁浮列车相互作用，产生制动力，用于高速磁浮列车的制动。本申请提供的高速磁浮列车制动系统可以代替失效的涡流制动方式进行制动，提高了高速磁浮列车制动的安全可靠性。