一种分离岛式暗挖车站桩间堵水方法，包括以下步骤：(1)暗挖地铁车站施工至围护桩节点，进行侧壁堵水结构施工；(2)开挖过程中记录堵水控制桩的浇注情况，若堵水控制桩有渗漏点则注浆进行补强，确保侧壁堵水结构不出现明显渗漏点；(3)根据暗挖施工步序进行主体结构施工，并将车站开挖至水位以上一定距离，然后配制浇注浆液；(4)对基底特定深度土体进行注浆，浇筑形成具有多个小盆形注浆室的封底结构，并与侧壁堵水结构叠合形成整体封闭结构，阻隔地下水；(5)堵水效果检查。本发明解决了分离岛式暗挖车站桩间的止水问题，克服了暗挖车站作业空间受限的困难，确保施工工期和减少安全隐患，间接性的节约了施工成本。