本发明公开了一种预防航空涡轴发动机涡轮超转破裂的保护方法和系统，预防航空涡轴发动机涡轮超转破裂的保护方法，包括：分析发动机动力涡轮轴断裂或相关连接失效时的参数变化趋势；根据参数变化趋势确定显著试验数据特征；根据显著试验数据特征确定故障条件；检测故障条件是否达到阈值；当故障条件达到设定阈值时，采取保护措施和指示故障信息。本发明通过分析动力涡轮轴发生断裂或相关连接失效的参数变化趋势，得出显著试验数据特征，提出“高转速低扭矩”的保护方法，将燃气发生器转速和扭矩或扭矩下降斜率作为判断条件，当同时满足故障条件时，对发动机紧急自动停车保护，预防动力涡轮破坏性超转，响应迅速，提高试验安全。