本发明公开了一种具有波浪补偿功能的无人化运输船舶，包括上层船体和下层船体，所述上层船体底部安装有多个下层船体，所述的下层船体与上层船体之间安装有波浪补偿系统，所述的波浪补偿系统包括主动波浪补偿系统和被动波浪补偿系统，其中，被动波浪补偿系统安装在上层船体下方，主动波浪补偿系统安装在被动波浪补偿系统和下层船体之间。本发明采用主动波浪补偿系统与被动波浪补偿系统相结合的补偿方式对甲板平台进行整体波浪补充，在不同海况应用不同的波浪补偿系统，可最大程度节省能源消耗，并通过导轨减小船舶在航行过程中海浪对补偿系统的剪切力，从而保证下层船体与上层船体之间的刚性要求。