本申请涉及船舶技术领域，尤其是涉及一种双燃料集装箱船总布置结构，双燃料集装箱船总布置结构包括：船舶船体，船舶船体包括主甲板；主甲板的下方形成有多个彼此独立的舱室；多个舱室中的至少一个为甲醇燃料储存舱；甲醇燃料日用舱，设置于主甲板的上方，甲醇燃料日用舱与甲醇燃料储存舱连通；甲醇燃料主机，设置于主甲板的下方，甲醇燃料日用舱与甲醇燃料主机连接。本申请提供的双燃料集装箱船总布置结构，可使用甲醇燃料作为船用燃料，可实现船舶主机无烟运行，而且甲醇可在常温下液态储存，不需要低温和隔热环境，建造非常简单，船东初期投资成本极大降低，也不会引起船舶重量增加，而且通过合理布局因而能够有效确保船舶的载货量。