本发明涉及船用发动机技术领域，公开一种船用高速发动机，包括机架组件、输出端箱体、自由端箱体、气缸组件、动力传递组件、正时机构、齿轮组件、燃油系统、润滑系统、冷却系统、增压系统、呼吸系统和控制系统。机架组件与输出端箱体、自由端箱体连接，三者共同用于承载其它零部件与系统。机架组件主要承载了气缸组件、动力传递组件、正时机构和增压系统。输出端箱体主要承载了共轨燃油系统的高压燃油泵、增压系统的空冷器以及输出端齿轮组件、起动马达。自由端箱体主要承载了润滑系统的滑油泵、滑油换热器、冷却系统的部分以及自由端齿轮组件。该船用高速发动机整体结构紧凑，可实现更大的功率输出，同时船用高速发动机的集成化程度更高。