本发明公开了一种基于自适应归一化的细粒度鱼类疫病识别融合算法，包括开展数据采集工作，形成细粒度鱼类疫病识别数据集；将数据集中二维图像输入到CNN网络中，利用CNN网络对鱼类图像进行特征提取，得到二维数据特征图；将二维数据特征图输入到Vision Transformer网络，通过嵌入层得到带有位置编码信息的特征数据一维向量信息；将带有位置编码信息的特征数据一维向量信息输入到Transformer编码层中，进行编码模块操作，将数据通过全连接输出带有类别特征的数字向量。本发明模型的泛化能力高，鲁棒性好，有效解决鱼类疫病识别准确率低，人工识别效率低的问题。