本发明公开了一种区间分路不良故障下的车次追踪自动纠正方法，包括：当列车运行至半自动闭塞分区两端的任一区间时，根据区间所属车站进路排列情况或者区间方向箭头状态确定区间方向；根据区间方向，并结合车次传递模型，进行列车车次的追踪，将列车车次与相应的车次单元关联，当区间方向箭头状态表明半自动闭塞分区无列车时，清除半自动闭塞分区与列车车次的关联关系；其中，车次单元为车次传递模型最小单位，车次传递模型中车次单元按照列车运行方向顺序排列。该方法在不影响行车的情况下，通过优化车次追踪逻辑，自动修正分路不良场景下车次追踪结果，保证了半自动闭塞分区内车次的唯一性，提升了行车安全。