本发明公开了一种电推进系统在轨氙气剩余量估算方法，包括：获取电推进系统氙气瓶的压力；判断获取的电推进系统氙气瓶的压力与预设压力之间的关系；当获取的电推进系统氙气瓶的压力≤预设压力时，基于对比态理论，计算得到电推进系统氙气瓶及管路内的氙气剩余量；当获取的电推进系统氙气瓶的压力＞预设压力时，根据电推进系统初始氙气加注量以及各个工作过程氙气消耗量，计算得到电推进系统氙气瓶及管路内的氙气剩余量。通过本发明可以有效评估氙气剩余情况，进而评估航天器寿命情况。