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公开(公告)号：CN116808962A
公开(公告)日：2023-09-29
申请号：CN202310626104.2
申请日：2023-05-30
申请人： 南京师范大学 , 江西新瑞丰生化股份有限公司
摘要： 本发明涉及生物材料技术，公开了一种水凝胶分子印迹反结构光子晶体微球及其制备方法和应用。该反结构光子晶体微球的制备方法包括以下步骤：通过微流控方法制备正结构光子晶体微球；将赤霉素作为印迹分子与含有水凝胶和光引发剂的混合溶液进行混合形成预凝胶混合物，将所述正结构光子晶体微球浸泡于所述预凝胶混合物中得到预凝胶体系；在紫外辐照下将所述预凝胶体系进行固化I后，经剥离得到固化微球；将所述固化微球与蚀刻剂混合进行反应、清洗。该光子晶体微球能够特异高效地识别吸附赤霉素，通过反射峰的偏移值完成定量测定，对赤霉素的检测灵敏度高、检测条件要求低。
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公开(公告)号：CN118294661A
公开(公告)日：2024-07-05
申请号：CN202410726479.0
申请日：2024-06-06
申请人： 南京师范大学
IPC分类号： G01N33/569 , G01N33/543 , G01N33/58 , B01L3/00 , C12N15/115
摘要： 本发明涉及微生物筛选技术，公开了一种基于双乳液体系的高通量筛选微生物菌株的方法及其应用。该方法包括：建立微生物突变体库，构建微流控双乳液芯片；利用微流控双乳液芯片对微生物突变体库中的菌株进行包埋形成双乳液液滴，液滴的内相含有微生物突变体库菌株的培养液与具有生物相容性的溶液的混合物、中间相含有能够特异性结合目标产物的靶标结合元件、外相为含有表面活性剂的氟化油；将双乳液液滴固化成核壳微球后进行培养，利用微球中靶标结合元件与目标产物结合形成指示信号，以对微球进行微流控分选。该高通量筛选方法保证了菌株生长的环境，筛选信号稳定准确，大大提高了筛选的精确性，且适用于小分子有机物的检测。
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公开(公告)号：CN116837019A
公开(公告)日：2023-10-03
申请号：CN202310866641.4
申请日：2023-07-14
申请人： 南京师范大学
IPC分类号： C12N15/80 , C12N15/31 , C12N15/11 , C12N1/15 , C12P27/00 , G16B50/30 , G16B25/00 , C12R1/645
摘要： 本发明公开了一种基于模型指导提高赤霉素GA3产量的方法及应用，属于系统生物学领域，该方法通过首次构建得的藤仓赤霉菌基因组规模代谢网络模型，获得藤仓赤霉菌的优化培养条件与遗传改造靶点，将优化培养条件用于发酵生产赤霉素GA3，能够显著提高赤霉素GA3产量，通过过表达遗传改造靶点，构建基因工程菌，经发酵，能使赤霉素GA3产量提高75.0％。本发明的藤仓赤霉菌基因组规模代谢网络模型可用于指导藤仓赤霉菌的发酵生产，解决传统正交试验方法周期长、成本高、存在不确定性和随机性的问题。
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公开(公告)号：CN118109451A
公开(公告)日：2024-05-31
申请号：CN202410538025.0
申请日：2024-04-30
申请人： 南京师范大学
摘要： 本发明涉及生物工程技术，公开了一种基于电喷雾技术的高通量筛选微生物菌株的方法和应用。该方法包括：建立微生物突变体库，构建微流控芯片；在电场作用下利用微流控芯片对所述微生物突变体库中的菌株进行包埋形成核壳结构液滴，其中，所述核壳结构液滴的外相含有凝胶剂、内相含有所述微生物突变体库菌株的培养液与生物相容剂的混合物；将所述液滴与含固化剂的收集液接触固化形成微球，将所述微球经培养后进行微流控分选；其中，所述凝胶剂与所述固化剂相接触能够发生交联固化反应。该方法能够精确控制液滴的尺寸和形貌，对包封的菌株损伤较小，提升微生物菌株筛选的精确性。
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公开(公告)号：CN118240661A
公开(公告)日：2024-06-25
申请号：CN202410676942.5
申请日：2024-05-29
申请人： 南京师范大学
摘要： 本发明涉及微生物筛选技术，公开了一种电喷单乳液高通量筛选微生物菌株的方法及其应用。该方法包括：建立微生物突变体库，获得所述微生物突变体库的培养液；将所述培养液与含有凝胶剂的溶液混合得到分散液，将所述分散液进行电喷形成单分散液滴；将所述单分散液滴与含交联剂的收集液接触固化形成微球，将所述微球经培养后进行微流控分选；其中，所述凝胶剂与所述交联剂相接触能够发生交联固化反应。该方法无需使用油相生成单包裹液滴，荧光染色和筛选过程更加简便，有效提高对菌株筛选的有效性和准确性。
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公开(公告)号：CN116478844A
公开(公告)日：2023-07-25
申请号：CN202310429309.1
申请日：2023-04-19
申请人： 南京师范大学
摘要： 本发明涉及遗传工程领域，公开了一种合成樱花素的重组菌株及其构建方法和发酵合成樱花素的方法及应用。该重组菌株由出发菌株经遗传改造获得，相比于所述出发菌株，所述重组菌株游离表达有下述(a)‑(c)所述的基因中的至少一者：(a)由启动子PHIS5调控的腺苷同型半胱氨酸酶的编码基因；(b)由启动子PTEF调控的5‑甲基四氢蝶酰三谷氨酸‑同型半胱氨酸甲基转移酶的编码基因；(c)由启动子PPOT1调控的S‑腺苷甲硫氨酸合成酶的编码基因。发酵合成樱花素的方法包括：将该重组菌株接种至含有柚皮素的发酵培养基中进行发酵。该重组菌株能够提高柚皮素生物合成樱花素的甲基化效率，有效提高樱花素的产量。
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公开(公告)号：CN115011490A
公开(公告)日：2022-09-06
申请号：CN202210678501.X
申请日：2022-06-15
申请人： 南京师范大学
IPC分类号： C12N1/14 , C12N13/00 , C12N15/01 , C12P7/6432 , C12R1/645
摘要： 本发明提供了一种制备高产EPA裂殖壶菌的方法，利用常压室温等离子体(ARTP)诱变技术进行诱变育种、2‑脱氧葡萄糖(2‑DG)平板筛选技术、摇瓶发酵及GC定量分析技术选育EPA高产菌株最终获得两株高产突变株，其中一株裂殖壶菌EPA产量提高了23.32％，另外一株裂殖壶菌提高了41.27％，经济效果显著。
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公开(公告)号：CN116092572A
公开(公告)日：2023-05-09
申请号：CN202310121949.6
申请日：2023-02-16
申请人： 南京师范大学
摘要： 本申请公开了一种解淀粉芽孢杆菌基因组规模代谢网络模型、构建方法和应用，属于系统生物学领域。所述方法包括：首先根据Uniport数据库中解淀粉芽孢杆菌的蛋白质组测序结果，自动构建解淀粉芽孢杆菌粗模型；其次根据文献数据库、代谢通路图和生化数据库，对粗模型进行手动精炼并添加乙偶姻的合成反应，构建出基因组规模代谢网络模型；再次将基因组规模代谢网络模型转换为计算机可读的数学模型；最后利用通量平衡分析方法对所述数学模型进行分析，并与文献中的实验值进行比较。本申请方法具有构建时间短、操作简单和准确率高的优点，能够系统地预测解淀粉芽孢杆菌生长的营养条件，为提高乙偶姻的产量及工业化生产提供可行依据。
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公开(公告)号：CN118755750A
公开(公告)日：2024-10-11
申请号：CN202411239470.3
申请日：2024-09-05
申请人： 南京师范大学
IPC分类号： C12N15/80 , C12N15/113 , C12N9/22 , G01N30/02 , C12Q1/6869 , C12Q1/6895 , C12P7/42 , C12N1/15 , C12R1/645
摘要： 本发明涉及微生物基因改造技术，公开了一种微生物基因改造靶点的鉴定方法及其应用。该鉴定方法包括以下步骤：将外源Cas效应蛋白表达框整合到原始菌株中得到改造工程菌，合成靶向原始菌株的基因组编码区的sgRNA文库；将所述sgRNA文库导入所述改造工程菌中获得多个突变菌株；将多个所述突变菌株进行发酵筛选得到目标产物产量高于原始菌株的突变菌株作为目标菌株；对目标菌株进行基因测序，鉴定提高原始菌株合成目标产物能力的基因组靶点。该靶点鉴定方法能够方便、快捷地鉴定出微生物的新靶点，获得高产目标产物的突变菌株，为微生物菌株的代谢工程改造提供了新的平台。
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公开(公告)号：CN118294661B
公开(公告)日：2024-09-10
申请号：CN202410726479.0
申请日：2024-06-06
申请人： 南京师范大学
IPC分类号： G01N33/569 , G01N33/543 , G01N33/58 , B01L3/00 , C12N15/115
摘要： 本发明涉及微生物筛选技术，公开了一种基于双乳液体系的高通量筛选微生物菌株的方法及其应用。该方法包括：建立微生物突变体库，构建微流控双乳液芯片；利用微流控双乳液芯片对微生物突变体库中的菌株进行包埋形成双乳液液滴，液滴的内相含有微生物突变体库菌株的培养液与具有生物相容性的溶液的混合物、中间相含有能够特异性结合目标产物的靶标结合元件、外相为含有表面活性剂的氟化油；将双乳液液滴固化成核壳微球后进行培养，利用微球中靶标结合元件与目标产物结合形成指示信号，以对微球进行微流控分选。该高通量筛选方法保证了菌株生长的环境，筛选信号稳定准确，大大提高了筛选的精确性，且适用于小分子有机物的检测。
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