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公开(公告)号：CN114678074B
公开(公告)日：2024-10-18
申请号：CN202210373179.X
申请日：2022-04-11
申请人： 大连大学
IPC分类号： G16B50/30
摘要： 本发明公开了一种隐藏寻址的DNA存储编码设计方法，包括：首先要将信息转换为二进制数据，并将数据分组、组内分段。其次，在每组数据中通过喷泉编码方式将数据异或并转化为DNA序列。然后，将每组数据中满足约束条件的DNA片段保留。最后，从每组数据中选出能够代表此序列的索引片段及7个配合索引解码的DNA片段，依次连接并输出。本发明因为在组内的数据片段异或，转化为满足约束条件的DNA片段使得DNA序列的局部GC含量更稳定，提高了序列的测序正确性。同时选取的用于隐藏索引的DNA片段为数据异或产生，所以相似性较低，可以避免序列拼接过程中因为索引相似度过高导致的拼接错误。
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公开(公告)号：CN118733803A
公开(公告)日：2024-10-01
申请号：CN202410768995.X
申请日：2024-06-14
申请人： 大连大学
IPC分类号： G06F16/51 , G06F16/583 , G06F11/10 , G16B50/30 , G16B35/20
摘要： 本发明公开了基于奇偶编码和局部均值迭代的鲁棒DNA图像存储方法及系统，涉及DNA存储技术领域；根据二进制不同位置的数据对像素具有不同权重的影响，将数据分为高影响数据和低影响数据，利用rs纠错码对高影响数据进行保护。将加入纠错码的数据转为二进制数据，十六位为一组，每组的1‑4和9‑13根据奇编码规则进行映射，其余根据四种偶编码规则进行映射。根据生化约束和易错相邻碱基进行筛选，拼接在设定长度的DNA序列中，并在DNA序列固定位置添加标识位。在解码时判断标识位的位置，对标识位发生偏移或者错误的序列保存索引。通过图像大小和序列长度进行筛选错误索引序列，获得丢失序列索引并保存。根据丢失和错误的序列索引，计算在图像中的特定位置。
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公开(公告)号：CN117155361A
公开(公告)日：2023-12-01
申请号：CN202311193455.5
申请日：2023-09-15
申请人： 大连大学
摘要： 本发明公开了一种基于自复位DNA开关电路的信息处理方法，包括：构建切刻内切酶辅助的分子构象自复位策略；在所述分子构象自复位策略基础上构建具有自复位功能和级联特性的DNA开关元件；在所述DNA开关元件的基础上设计具有信号选择功能的识别模块、具有扇入和扇出功能的翻译模块；通过集成多个功能模块得到自复位DNA开关电路，在决策模块中，进行双逻辑并行运算，完成信息处理。该方法借助切刻内切酶实现开关元件的自动复位和可重用，减少了DNA开关电路设计的复杂度。同时，通过利用功能底物构建了多种功能模块，丰富了信号传递策略，提升了信息处理能力。
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公开(公告)号：CN116883222A
公开(公告)日：2023-10-13
申请号：CN202310236294.7
申请日：2023-03-13
申请人： 大连大学
IPC分类号： G06T1/00 , G06N3/0464 , G06N3/08
摘要： 本发明公开了基于多尺度自动编码器的抗JPEG压缩鲁棒性图像水印方法，水印消息处理器生成两种尺寸的水印消息特征图；使用编码器将水印消息特征图嵌入载体图像以生成水印图像；噪声层将水印图像作为输入，在噪声层中使用发明的抗JPEG压缩鲁棒性训练方法生成噪声图像作为输出；解码器对上述噪声图像进行降采样恢复水印信息；编码器与解码器中的多尺度下采样卷积层进行参数共享减少编码器对水印消息特征图的冗余信息嵌入，并且解码器可以在编码器的指导下准确找到潜空间，故既提高了图像质量，又提高了提取精度。
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公开(公告)号：CN111292808B
公开(公告)日：2023-04-28
申请号：CN202010092155.8
申请日：2020-02-14
申请人： 大连大学
摘要： 本发明公开了基于改进哈里斯鹰算法的DNA存储编码优化方法，其具体为：为了尽可能多的构造满足组合约束条件的DNA编码序列，首先要初始化一定数量的随机DNA序列作为初始种群，对种群的适应度值(汉明距离之和)进行计算排序。其次，对于初始群体使用改进后的哈里斯鹰算法的不同策略进行更新，其中加入的非线性收敛因子可以维持算法探索与开发过程的平稳过渡，结合随机反向学习策略有助于种群避免陷入局部最优，同时由精英选择机制挑选出更新的适应度较高的DNA编码序列。然后，通过组合约束条件对每次更新的序列进行筛选判断是否加入备选解集合。最后，输出最优DNA编码序列集合。该方法明显提高了DNA约束编码序列集合的下界。
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公开(公告)号：CN115549886A
公开(公告)日：2022-12-30
申请号：CN202211136199.1
申请日：2022-09-19
申请人： 大连大学
摘要： 本发明公开了一种基于改进类提升变换和跨平面之字形变换的图像加密方法，包括以下步骤：根据外部密钥信息获取超混沌系统的控制参数；通过超混沌系统的控制参数获得混沌序列；通过混沌序列与明文图像信息获得跨平面之字形变换的控制参数；将所述明文图像与所述混沌序列一并输入到改进类提升变换中，得到密文图像；所述改进类提升变换包括类提升正变换、跨平面之字形变换、类提升逆变换。本发明实现不同平面的置换操作，从而具有更大的平均邻域灰度差，达到更好的置乱效果，将跨平面之字形变换与改进类提升变换相结合，从而达到更好的加密效果。
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公开(公告)号：CN115407655A
公开(公告)日：2022-11-29
申请号：CN202211026723.X
申请日：2022-08-25
申请人： 大连大学
摘要： 本发明公开了一种基于DNA链置换的延迟酶促反应超灵敏Brink控制的实现方法，包括：用单分子和双分子化学反应来描述酶促反应过程，引入时间延迟因素，得到具有时间延迟的酶促反应过程模型；构建基于CRNs的Brink控制器；获取所述Brink控制器输出与稳态条件下系统输出之间的静态映射表达式，进而得到保证控制器性能的解析条件；利用DNA链置换反应实现Brink控制器的构建；通过DNA链置换机制，并基于延迟物质和补偿机制获取时间延迟表示方式，将所述时间延迟表示方式应用到酶促反应过程模型的DNA实现上；同时，结合构建后的Brink控制器，实现对重写后酶促反应过程模型的控制。本发明在结构上不涉及减法运算，减少了实现所需抽象化学反应的数量，大大简化了DNA实现的复杂度。
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公开(公告)号：CN114678074A
公开(公告)日：2022-06-28
申请号：CN202210373179.X
申请日：2022-04-11
申请人： 大连大学
IPC分类号： G16B50/30
摘要： 本发明公开了一种隐藏寻址的DNA存储编码设计方法，包括：首先要将信息转换为二进制数据，并将数据分组、组内分段。其次，在每组数据中通过喷泉编码方式将数据异或并转化为DNA序列。然后，将每组数据中满足约束条件的DNA片段保留。最后，从每组数据中选出能够代表此序列的索引片段及7个配合索引解码的DNA片段，依次连接并输出。本发明因为在组内的数据片段异或，转化为满足约束条件的DNA片段使得DNA序列的局部GC含量更稳定，提高了序列的测序正确性。同时选取的用于隐藏索引的DNA片段为数据异或产生，所以相似性较低，可以避免序列拼接过程中因为索引相似度过高导致的拼接错误。
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公开(公告)号：CN114428461A
公开(公告)日：2022-05-03
申请号：CN202210108926.7
申请日：2022-01-28
申请人： 大连大学
IPC分类号： G05B13/04
摘要： 本发明公开了一种基于CRNs的改进Smith预估控制方法，包括：将Smith预估补偿、反馈补偿控制策略和生化反应网络理论结合，进行CRNs结构设计；结合Padé近似表示方法对时滞因素进行处理；通过催化、降解和湮灭三种基本反应构建出基于CRNs的延迟蛋白质翻译过程模型。本发明以基因表达为背景，构建出基于CRNs的延迟蛋白质翻译过程模型，并将共翻译mRNA的降解反应看作是蛋白质输出的一个扰动来源，通过上述控制方法能更好地抑制mRNA降解对蛋白质输出的影响。
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公开(公告)号：CN108710780B
公开(公告)日：2022-03-15
申请号：CN201810298304.9
申请日：2018-04-04
申请人： 大连大学
摘要： 本发明涉及一种基于链置换调控E6核酶功能的DNA网络构造方法。该方法依据E6核酶的发卡状二级结构和催化核心保守域序列，通过链置换技术，实现E6核酶功能的调控；利用E6核酶的底物结合臂，添加RNA修饰的DNA底物，形成分支环状结构，构造DNA逻辑计算单元；通过改造DNA逻辑计算单元构造DNA逻辑门；最后连接DNA逻辑门，形成DNA网络。该方法不破坏E6核酶的序列完整性，DNA逻辑计算单元具有结构稳定、可定制、模块化、低泄漏、抗干扰的特点，可以广泛应用于生物计算、DNA纳米结构。
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