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公开(公告)号:CN113837036B
公开(公告)日:2024-08-02
申请号:CN202111054279.8
申请日:2021-09-09
申请人: 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: G06F18/213 , G06F18/24 , G06N3/0442 , G06N3/0464 , G06N3/048 , G06N3/08
摘要: 本申请实施例公开了一种生物聚合物的表征方法、装置、设备及计算机存储介质,能够通过预设的神经网络模型,对目标生物聚合物的第一电信号进行局部特征提取和时序特征提取,得到关联局部特征和时序特征的组合特征信息;并根据该组合特征信息,表征目标生物聚合物。这样可以在生物聚合物表征过程中,通过预设的神经网络模型,得到兼顾局部特征和时序特征的组合特征信息,用于识别目标生物聚合物的结构单元序列或修饰信息,使得表征结果更为准确。
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公开(公告)号:CN113773373B
公开(公告)日:2024-02-06
申请号:CN202111186297.1
申请日:2021-10-12
申请人: 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: C07K14/195 , C12N15/31 , C07K19/00 , G01N27/447 , G01N33/487 , C12Q1/6869
摘要: 本发明属于靶分析物特性的表征技术领域,具体提供了一种孔蛋白单体的突变体、包含其的蛋白孔、以及其检测靶分析物的应用,其中所述孔蛋白单体的突变体的氨基酸包括SEQ ID NO:1所示的序列或与其具有至少99%、98%、97%、96%、95%、90%、80%、70%、60%或50%同一性的序列,并且所述孔蛋白单体的突变体的氨基酸包括在对应SEQ ID NO:1的S79、S80、和F81的一个或多个位置处的突变。
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公开(公告)号:CN116904569B
公开(公告)日:2023-12-15
申请号:CN202311181331.5
申请日:2023-09-13
申请人: 北京齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6869
摘要: 本申请公开了一种信号处理方法、装置、电子设备、介质和产品,该方法包括:获取基于纳米孔测序采集的多组第一电信号集,其中,每组第一电信号集包括每个采集时刻下的电信号值;针对每组第一电信号集,对所述第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值进行信号增强,得到第二电信号集;基于多组第一电信号集,以及与每组第一电信号集对应的第二电信号集,确定目标电信号集。以提升对纳米孔测序所采集的信号的后续处理的精确性。
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公开(公告)号:CN116881634A
公开(公告)日:2023-10-13
申请号:CN202311141730.9
申请日:2023-09-06
申请人: 北京齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: G06F18/10 , G06F18/214 , G06N20/00
摘要: 本发明公开一种用于清洗纳米孔信号数据的方法、设备和存储介质。本发明从通道维度进行第一步清洗,然后通过信号本身维度进一步清洗,通过两步清洗能够大大提升数据清洗效果,从而实现对于纳米孔信号质量的量化分析。
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公开(公告)号:CN116497102A
公开(公告)日:2023-07-28
申请号:CN202211624612.9
申请日:2022-12-16
申请人: 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12Q1/6876 , C12N9/14
摘要: 本发明提供了一种用于表征目标多核苷酸的衔接体、方法及其用途。本发明提供了用于表征目标多核苷酸的衔接体,衔接体包含DNA解旋酶的结合区域,结合区域包含修饰的RNA多核苷酸,用于结合DNA解旋酶。本发明还提供了表征目标多核苷酸的方法,所述方法使用所述的衔接体。本发明提供了能够与DNA结合的修饰的RNA,其可以用于纳米孔RNA测序的衔接体制备,使用该衔接体能极大丰富了RNA测序的多样性,并为纳米孔RNA测序的进一步发展提供了很好的基础。
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公开(公告)号:CN115960182A
公开(公告)日:2023-04-14
申请号:CN202111186286.3
申请日:2021-10-12
申请人: 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: C07K14/195 , C12N15/31 , C12Q1/6869
摘要: 本发明属于靶分析物特性的表征技术领域,具体提供了一种孔蛋白单体的突变体、包含其的蛋白孔、以及其检测靶分析物的应用,其中所述孔蛋白单体的突变体的氨基酸包括SEQ ID NO:1所示的序列或与其具有至少99%、98%、97%、96%、95%、90%、80%、70%、60%或50%同一性的序列,并且所述孔蛋白单体的突变体的氨基酸包括在对应SEQ ID NO:1的K67、D71、S72、和Y74的一个或多个位置处的突变。
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公开(公告)号:CN114751363A
公开(公告)日:2022-07-15
申请号:CN202210664631.8
申请日:2022-06-14
申请人: 成都齐碳科技有限公司
摘要: 本申请实施例提供了一种孔阵列层结构、预涂方法、成膜方法及相关装置,孔阵列层结构用于和衬底形成成膜空间,成膜空间用于形成膜层,孔阵列层结构包括基板,基板中的阵列排布有多个孔单元,孔单元贯穿基板,孔单元包括沿基板厚度方向叠加设置的第一孔部及第二孔部,第二孔部被配置为和衬底连接,第一孔部在垂直于基板厚度方向的平面上的投影具有第一孔部轮廓,第二孔部在垂直于基板厚度方向的平面上的投影具有第二孔部轮廓,第一孔部轮廓环绕于第二孔部轮廓外侧,多个孔单元的第二孔部之间彼此不连通,并且多个孔单元的第一孔部之间彼此不连通。
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公开(公告)号:CN113552332B
公开(公告)日:2022-04-22
申请号:CN202111104038.X
申请日:2021-09-22
申请人: 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: G01N33/487 , G01N27/00 , B01L3/00 , B82Y15/00 , C12Q1/6869
摘要: 本申请公开了一种用于感测包含在液体中的分析物的装置和设备,本申请提供的装置包括液流结构件和感测组件,液流结构件具有测量腔、出口腔和纳米通道,测量腔用于接收待感测分析物,并且待感测分析物在沿第一方向进入测量腔时,可产生可感测的电信号,出口腔与测量腔流体连通,纳米通道包含连通测量腔的第一开口和连通出口腔的第二开口,以流体连通测量腔和出口腔,其中,纳米通道的第一开口与第二开口在第一方向上的高度差小于20μm;感测组件与测量腔耦合,以感测所述电信号。本申请提供的装置测量判读准确率高。
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公开(公告)号:CN114005489A
公开(公告)日:2022-02-01
申请号:CN202111616129.1
申请日:2021-12-28
申请人: 成都齐碳科技有限公司
摘要: 本发明提供了基于三代测序数据检测点突变的分析方法和装置。本发明的分析方法包括:1)提取包含待检测的点突变的第一序列子集;2)从第一序列子集中提取种子序列,获得第二序列子集;3)获得具有期望质量的原始数据集;4)使用第二序列子集的种子序列对,获得N个包含目的序列的数据集;5)对N个包含目的序列的数据集进行点突变检测分析;6)对N个检测结果中的每个点突变的结果分配权重W;7)根据公式计算点突变结果及其频率。本发明还提供了一种基于三代测序数据检测点突变的装置。使用本发明的方法,不仅从数据特征上有效地规避随机indel或较高测序错误导致的比对率不高引起的假阴性的问题,同时能更有效地控制假阳性的结果。
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公开(公告)号:CN113896776A
公开(公告)日:2022-01-07
申请号:CN202111186249.2
申请日:2021-10-12
申请人: 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: C07K14/195 , C12N15/31 , C12Q1/6869
摘要: 本发明属于靶分析物特性的表征技术领域,具体提供了一种孔蛋白单体的突变体、包含其的蛋白孔、以及其检测靶分析物的应用,其中所述孔蛋白单体的突变体的氨基酸包括SEQ ID NO:1所示的序列或与其具有至少99%、98%、97%、96%、95%、90%、80%、70%、60%或50%同一性的序列,并且所述孔蛋白单体的突变体的氨基酸包括在对应SEQ ID NO:1的T75、和F76的一个或两个位置处的突变。
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