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公开(公告)号:CN116904569B
公开(公告)日:2023-12-15
申请号:CN202311181331.5
申请日:2023-09-13
申请人: 北京齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6869
摘要: 本申请公开了一种信号处理方法、装置、电子设备、介质和产品,该方法包括:获取基于纳米孔测序采集的多组第一电信号集,其中,每组第一电信号集包括每个采集时刻下的电信号值;针对每组第一电信号集,对所述第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值进行信号增强,得到第二电信号集;基于多组第一电信号集,以及与每组第一电信号集对应的第二电信号集,确定目标电信号集。以提升对纳米孔测序所采集的信号的后续处理的精确性。
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公开(公告)号:CN116881634A
公开(公告)日:2023-10-13
申请号:CN202311141730.9
申请日:2023-09-06
申请人: 北京齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: G06F18/10 , G06F18/214 , G06N20/00
摘要: 本发明公开一种用于清洗纳米孔信号数据的方法、设备和存储介质。本发明从通道维度进行第一步清洗,然后通过信号本身维度进一步清洗,通过两步清洗能够大大提升数据清洗效果,从而实现对于纳米孔信号质量的量化分析。
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公开(公告)号:CN117113063B
公开(公告)日:2024-02-02
申请号:CN202311352700.2
申请日:2023-10-19
申请人: 北京齐碳科技有限公司 , 广州齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: G06F18/213 , G06N3/044 , G06N3/0455 , G06N3/0464
摘要: 本发明公开了一种用于纳米孔信号的编解码系统,包括:编码器和解码器,其中的编码器包括:分窗单元、移位单元和至少两个编码单元;分窗单元将纳米孔信号分割为M个信号段后输出至编码单元,编码单元中至少包括:第一自查询权值计算器;第一自查询权值计算器中包括:至少一个第一注意力模块;第一注意力模块对每个信号段分别进行注意力计算,将M个信号段的注意力计算结果组合成一个注意力计算结果作为信号特征输出;每两个相邻的编码单元之间设置有一个移位单元,用于对信号特征按照预设的平移值进行数据循环平移,将平移后的信号特征重新分割为M个信号段后输出至编码单元。应用本发明可以提高编解码的准确率,提高计算速度、降低内存消耗。
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公开(公告)号:CN116904569A
公开(公告)日:2023-10-20
申请号:CN202311181331.5
申请日:2023-09-13
申请人: 北京齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6869
摘要: 本申请公开了一种信号处理方法、装置、电子设备、介质和产品,该方法包括:获取基于纳米孔测序采集的多组第一电信号集,其中,每组第一电信号集包括每个采集时刻下的电信号值;针对每组第一电信号集,对所述第一电信号集中每个采集时刻下的电信号值进行信号增强,得到第二电信号集;基于多组第一电信号集,以及与每组第一电信号集对应的第二电信号集,确定目标电信号集。以提升对纳米孔测序所采集的信号的后续处理的精确性。
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公开(公告)号:CN116884503B
公开(公告)日:2023-12-26
申请号:CN202311146735.0
申请日:2023-09-06
申请人: 北京齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: G16B40/10 , G16B40/20 , G16B30/00 , G06F18/24 , G06F18/25 , G06N3/0455 , G06N3/0464 , G06N3/08
摘要: 本申请涉及纳米孔测序领域,具体涉及用于对表征聚合物的第一向量化表示序列进行处理的方法和装置、对后验矩阵进行处理的处理方法和装置、计算设备、计算机可读存储介质和计算机程序产品。用于对表征聚合物的第一向量化表示序列进行处理的方法包括:将第一向量化表示序列输入第一机器学习模型,得到第一机器学习模型输出的权重向量,权重向量与第一向量化表示序列的长度相同,并且包括多个预测易位值,每个预测易位值指示聚合物相对于纳米孔测序的观测位点在相应时间步移动了多少个聚合物单元;以及将第一向量化表示序列与权重向量进行整合,得到表征聚合物的第二向量化表示序列。
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公开(公告)号:CN116881634B
公开(公告)日:2023-12-26
申请号:CN202311141730.9
申请日:2023-09-06
申请人: 北京齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: G06F18/10 , G06F18/214 , G06N20/00
摘要: 本发明公开一种用于清洗纳米孔信号数据的方法、设备和存储介质。本发明从通道维度进行第一步清洗,然后通过信号本身维度进一步清洗,通过两步清洗能够大大提升数据清洗效果,从而实现对于纳米孔信号质量的量化分析。
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公开(公告)号:CN117113063A
公开(公告)日:2023-11-24
申请号:CN202311352700.2
申请日:2023-10-19
申请人: 北京齐碳科技有限公司 , 广州齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: G06F18/213 , G06N3/044 , G06N3/0455 , G06N3/0464
摘要: 本发明公开了一种用于纳米孔信号的编码器、解码器、编解码系统和方法,其中的编码器包括:分窗单元、移位单元和至少两个编码单元;分窗单元将纳米孔信号分割为M个信号段后输出至编码单元,编码单元中至少包括:第一自查询权值计算器;第一自查询权值计算器中包括:至少一个第一注意力模块;第一注意力模块对每个信号段分别进行注意力计算,将M个信号段的注意力计算结果组合成一个注意力计算结果作为信号特征输出;每两个相邻的编码单元之间设置有一个移位单元,用于对信号特征按照预设的平移值进行数据循环平移,将平移后的信号特征重新分割为M个信号段后输出至编码单元。应用本发明可以提高编解码的准确率,提高计算速度、降低内存消耗。
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公开(公告)号:CN116884503A
公开(公告)日:2023-10-13
申请号:CN202311146735.0
申请日:2023-09-06
申请人: 北京齐碳科技有限公司 , 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: G16B40/10 , G16B40/20 , G16B30/00 , G06F18/24 , G06F18/25 , G06N3/0455 , G06N3/0464 , G06N3/08
摘要: 本申请涉及纳米孔测序领域,具体涉及用于对表征聚合物的第一向量化表示序列进行处理的方法和装置、对后验矩阵进行处理的处理方法和装置、计算设备、计算机可读存储介质和计算机程序产品。用于对表征聚合物的第一向量化表示序列进行处理的方法包括:将第一向量化表示序列输入第一机器学习模型,得到第一机器学习模型输出的权重向量,权重向量与第一向量化表示序列的长度相同,并且包括多个预测易位值,每个预测易位值指示聚合物相对于纳米孔测序的观测位点在相应时间步移动了多少个聚合物单元;以及将第一向量化表示序列与权重向量进行整合,得到表征聚合物的第二向量化表示序列。
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公开(公告)号:CN113837036B
公开(公告)日:2024-08-02
申请号:CN202111054279.8
申请日:2021-09-09
申请人: 成都齐碳科技有限公司
IPC分类号: G06F18/213 , G06F18/24 , G06N3/0442 , G06N3/0464 , G06N3/048 , G06N3/08
摘要: 本申请实施例公开了一种生物聚合物的表征方法、装置、设备及计算机存储介质,能够通过预设的神经网络模型,对目标生物聚合物的第一电信号进行局部特征提取和时序特征提取,得到关联局部特征和时序特征的组合特征信息;并根据该组合特征信息,表征目标生物聚合物。这样可以在生物聚合物表征过程中,通过预设的神经网络模型,得到兼顾局部特征和时序特征的组合特征信息,用于识别目标生物聚合物的结构单元序列或修饰信息,使得表征结果更为准确。
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公开(公告)号:CN113837036A
公开(公告)日:2021-12-24
申请号:CN202111054279.8
申请日:2021-09-09
申请人: 成都齐碳科技有限公司
摘要: 本申请实施例公开了一种生物聚合物的表征方法、装置、设备及计算机存储介质,能够通过预设的神经网络模型,对目标生物聚合物的第一电信号进行局部特征提取和时序特征提取,得到关联局部特征和时序特征的组合特征信息;并根据该组合特征信息,表征目标生物聚合物。这样可以在生物聚合物表征过程中,通过预设的神经网络模型,得到兼顾局部特征和时序特征的组合特征信息,用于识别目标生物聚合物的结构单元序列或修饰信息,使得表征结果更为准确。
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