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公开(公告)号：CN118150750A
公开(公告)日：2024-06-07
申请号：CN202410169112.3
申请日：2024-02-06
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海市内分泌代谢病研究所
摘要： 本发明公开了一种基于脂质组学评价鱼油降脂疗效的方法，包括采集受试者血清样本；采用甲醇/甲基叔丁基醚/水体系提取样本中的脂质组；采用超高效液相色谱串联高分辨质谱仪器采集脂质组学质谱数据；用WGCNA将数据分成共丰度簇，选择13作为软阈值幂β拟合网络的无标度拓扑结构；采用混合动态树切割法产生若干脂质模块；当以甘油脂类为主成分的脂质模块明显减少时，表示鱼油降脂疗效良好。本发明通过血清样本中脂质组学检测即可判断鱼油对2型糖尿病合并高甘油三酯患者的降脂疗效，具有重要医用价值。
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公开(公告)号：CN118039186A
公开(公告)日：2024-05-14
申请号：CN202410169110.4
申请日：2024-02-06
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海市内分泌代谢病研究所 , 深圳华大生命科学研究院
摘要： 本发明公开了基于肠道菌群甘油三酯指数的鱼油降脂疗效预测模型及其构建方法，包括筛选外部队列，收集表型数据；获取OCEAN队列的鱼油干预治疗病历数据，采集基线和若干随访点的外周血和粪便样本；提取粪便样本中肠道微生物DNA，宏基因组测序获得人体肠道微生物基因组；测试OCEAN队列基线和若干随访点的TG数据，以表型数据作为数据集，矫正年龄、性别和BMI并鉴定与TG显著相关的肠道微生物，构建GMTGI，以OCEAN队列评估GMTGI与鱼油降TG疗效的关系，基于ROC曲线确定患者基线GMTGI高于0.712，提示鱼油对患者降脂疗效好。本发明通过GMTGI值直接预测鱼油降脂疗效，为临床提供重要的参考价值。
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公开(公告)号：CN117191975A
公开(公告)日：2023-12-08
申请号：CN202311041767.4
申请日：2023-08-18
申请人： 上海市内分泌代谢病研究所 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
摘要： 本发明公开了单不饱和脂肪酸联合标志物在制备诊断糖尿病的检测产品中的应用，单不饱和脂肪酸联合标志物由FA14:1、FA15:1、FA16:1、FA17:1、FA18:1、FA19:1、FA20:1、FA21:1、FA22:1、FA24:1、FA25:1和FA26:1组成，检测受试者血清中单不饱和脂肪酸联合标志物的浓度水平后进行ROC曲线统计，通过ROC曲线下面积判断该联合标志物对2型糖尿病风险的预测价值；当ROC曲线下面积＞0.7时，提示该联合标志物对2型糖尿病风险具有良好的预测效果，用于辅助糖尿病的早期临床诊断灵敏度高、成本低且重复性好，与传统临床诊断标志物空腹血糖和餐后血糖具有协同作用。
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公开(公告)号：CN116855601A
公开(公告)日：2023-10-10
申请号：CN202310891341.1
申请日：2023-07-20
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海市内分泌代谢病研究所
IPC分类号： C12Q1/6883 , C12Q1/6869 , G16B20/30
摘要： 本发明属于糖尿病风险预测技术领域，具体涉及一种全血转录组信息在制备试剂盒中的应用以及用于预测非肥胖2型糖尿病风险和血糖代谢异常的全血转录标志物，所述全血转录标志物为通过TWMR研究获得的基因转录本RAB1A和GCC‑PAX4。
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公开(公告)号：CN118016153A
公开(公告)日：2024-05-10
申请号：CN202410149160.6
申请日：2024-02-02
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海市内分泌代谢病研究所
摘要： 本发明公开了基于孟德尔随机化分析FADS1和FADS2表达与认知功能因果关系的方法，包括：采用MR分析确定Ω‑3脂肪酸在FADS区域内外对认知功能的因果效应；组织和细胞类型特异性MR分析评估FADS1和FADS2的表达对认知功能的组织和细胞类型依赖效应，包括获取Ω‑3脂肪酸样本的GWAS数据等，筛选与Ω‑3脂肪酸特征在全基因组范围内呈显著性相关的SNPs，进行Ω‑3脂肪酸对认知功能的MR、LDSC、组织和细胞类型特异性和敏感性MR以及遗传共定位等孟德尔随机化分析，得到FADS1和FADS2表达与认知功能因果关系，确定其为潜在的靶基因，具有重要的生物医学价值。
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公开(公告)号：CN117030894A
公开(公告)日：2023-11-10
申请号：CN202311041768.9
申请日：2023-08-18
申请人： 上海市内分泌代谢病研究所 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
摘要： 本发明公开了奇数链脂肪酸联合标志物在制备诊断糖尿病的检测产品中的应用，奇数链脂肪酸联合标志物由FA13:0、FA15:0、FA15:1、FA17:0、FA19:0、FA19:1、FA19:2、FA21:0、FA23:0、FA25:0、FA25:2和FA25:3组成，检测血清中奇数链脂肪酸联合标志物的浓度水平后进行ROC曲线统计，通过ROC曲线下面积判断该联合标志物对2型糖尿病风险的预测价值；当ROC曲线下面积＞0.7时，提示该联合标志物对2型糖尿病风险具有良好的预测效果，用于辅助糖尿病的早期临床诊断灵敏度高、成本低且重复性好，与传统临床诊断标志物空腹血糖和餐后血糖具有协同作用。
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公开(公告)号：CN118588320A
公开(公告)日：2024-09-03
申请号：CN202410169156.6
申请日：2024-02-06
申请人： 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海市内分泌代谢病研究所 , 深圳华大生命科学研究院
摘要： 本发明公开了基于肠道微生物特征的鱼油降脂疗效预测模型及其构建方法，包括：获取T2D合并HTG患者的鱼油干预治疗病历数据，采集粪便样本和外周血样本；提取粪便样本中肠道微生物DNA，采用鸟枪法宏基因组测序获得肠道微生物基因组数据，经统计分析获取与患者鱼油干预治疗相关的微生物特征参数；检测患者干预前后TG数据估算TG响应组和无响应组之间的肠道微生物变量差异；构建肠道微生物基线变量的预测模型，采用重复迭代特征法获取最佳AUC值，提取对TG响应分组贡献最大的肠道微生物特征和最佳的随机森林模型TG响应概率阈值。本发明基于肠道微生物特征构建的预测模型可有效判别鱼油对T2D合并HTG患者降脂疗效高低。
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公开(公告)号：CN117110468A
公开(公告)日：2023-11-24
申请号：CN202311041761.7
申请日：2023-08-18
申请人： 上海市内分泌代谢病研究所 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
摘要： 本发明公开了极长链脂肪酸联合标志物在制备诊断糖尿病的检测产品中的应用，极长链脂肪酸联合标志物选自FA20:0、FA20:4、FA21:0、FA22:0、FA22:3、FA22:4、FA23:0、FA24:0、FA24:2、FA24:4、FA24:5、FA25:0、FA25:2、FA25:3、FA26:0、FA26:1、FA26:2、FA26:3，检测受试者血清中极长链脂肪酸联合标志物的浓度水平后进行ROC曲线统计，通过ROC曲线下面积判断该联合标志物对2型糖尿病风险的预测价值，用于辅助糖尿病的早期临床诊断灵敏度高、成本低且重复性好，与传统临床诊断标志物空腹血糖和餐后血糖具有协同作用。
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公开(公告)号：CN117030893A
公开(公告)日：2023-11-10
申请号：CN202311041764.0
申请日：2023-08-18
申请人： 上海市内分泌代谢病研究所 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
摘要： 本发明公开了长链脂肪酸分类标志物组合在制备诊断糖尿病的检测产品中的应用，其中长链脂肪酸分类标志物组合由oSFA、eSFA、oMUFA、eMUFA、oPUFA和ePUFA中至少两种以上组成，先检测受试者血清中长链脂肪酸分类标志物组合的浓度水平，然后进行ROC曲线统计，通过ROC曲线下面积判断分类标志物组合对2型糖尿病风险的预测价值；当ROC曲线下面积＞0.7时，提示分类标志物组合对2型糖尿病风险具有良好的预测效果，用于辅助糖尿病的早期临床诊断检测灵敏度高、成本低且重复性好，与传统临床诊断标志物空腹血糖和餐后血糖具有协同作用。
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