公开(公告)号：CN113903399A

公开(公告)日：2022-01-07

申请号：CN202110988176.2

申请日：2021-08-26

申请人： 中国农业大学

发明人： 薛勇 ,  王立扬 ,  赵新杰 ,  沈群

IPC分类号： G16B40/00 ,  G16B35/20 ,  C12P21/06

摘要： 本发明提供一种高通量筛选食源性降压肽的方法，包括步骤：1)收集已知具有降压潜力的多肽数据作为正样本；2)从蛋白质数据库中随机提取同等数量的多肽作为负样本，3)采用伪氨基酸组成法提取多肽序列特征；4)建立降压肽protBERT深度迁移学习模型；5)采用五倍交叉验证法评价深度学习模型；6)提取食品中蛋白质，采用蛋白酶水解酶水解所得蛋白质，制备水解肽；7)测定所得的食源性水解肽的氨基酸序列，输入深度学习模型进行降压功能预测。本发明提出的方法，采用protBERT深度迁移学习模型的方法构建降压肽预测模型，并通过Accuracy和ROC两个指标对深度学习模型进行评价，有效地保证模型稳定性的同时并能直观显示模型的鉴别分析能力。

公开(公告)号：CN117912595A

公开(公告)日：2024-04-19

申请号：CN202311648348.7

申请日：2023-12-04

申请人： 中国农业大学

发明人： 薛勇 ,  张译匀 ,  王立扬 ,  包鑫

IPC分类号： G16C20/70 ,  G16C10/00 ,  G16C20/50 ,  G16C20/30 ,  G06N20/00

摘要： 本发明提供一种机器学习辅助筛选及制备DPP‑4抑制肽的方法，包括以下步骤：构建训练集；提取多肽序列特征：特征提取方法为伪氨基酸组成；建立机器学习模型；预测集的准备：将蛋白质水解，关注长度为3‑15个氨基酸的肽段，所述蛋白质水解的方式为用碱性蛋白酶水解或虚拟水解；用机器学习模型对预测集中的肽进行DPP‑4活性预测；评估肽的活性、毒性和人体肠道吸收性；制备DPP‑4抑制肽；采用DPP‑4活性抑制实验和分子对接以及分子动力学模拟验证DPP‑4抑制肽。本方法不仅简化了DPP‑4抑制肽的发现，使其成为一种低成本、高效的预测方法，而且还具有实际应用价值。具体来说，可以辅助生物活性肽的精准制备，并快速确定其主要生产条件，助力行业规模化、标准化生产活性肽。