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公开(公告)号：CN118360286A
公开(公告)日：2024-07-19
申请号：CN202410569048.8
申请日：2024-05-09
申请人： 中国农业科学院植物保护研究所
摘要： 本发明涉及一种多碱基编辑器及其应用。其中，多碱基编辑器的碱基序列如SEQ ID No.1或SEQ ID No.2所示，其可以实现C和G的同时编辑或A和G的同时编辑。
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公开(公告)号：CN111100852B
公开(公告)日：2021-04-13
申请号：CN202010048142.0
申请日：2020-01-16
申请人： 中国农业科学院植物保护研究所
摘要： 本发明提供了OsALS1的定向突变及农作物内源基因定向进化的方法。OsALS1的氨基酸序列为将序列78发生第一突变、第二突变和第三突变中的至少一种，第一突变为P171F、P171S和P171L中的一种，第二突变为L158F，第三突变为R190H。方法包括如下步骤：选定农作物的内源基因为靶基因；基于靶基因设计若干靶核苷酸序列，得到若干定向进化克隆序列并分别克隆到含有gRNA的质粒上，得到定向进化gRNA质粒库；将所述定向进化gRNA库中的相关序列与Cas9表达盒整合到同一载体上，转化所述农作物中，得到所述农作物的突变库；从所述农作物的突变库中筛选与所述靶基因相关的所需性状。
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公开(公告)号：CN107177625A
公开(公告)日：2017-09-19
申请号：CN201710383003.1
申请日：2017-05-26
申请人： 中国农业科学院植物保护研究所
CPC分类号： C12N15/8205 , C12N15/8241
摘要： 本申请涉及一套用于水稻基因组碱基定点替换的人工系统及定点突变方法。该人工系统包括：第I调节元件，其包括能够编码如氨基酸序列I的核苷酸序列；其中所述氨基酸序列I选自SEQ ID Nos.1‑6中的一种；第II调节元件，其包括依次从5’端到3’端的第II‑1核苷酸序列和第II‑2核苷酸序列；所述第II‑1核苷酸序列包括靶核苷酸序列，所述第II‑2核苷酸序列包括来源于化脓链球菌的sgRNA核酸序列，第II‑1核苷酸序列与第II‑2核苷酸序列转录融合，其产物能引导第I调控元件编码的蛋白至目标生物基因组中待突变的靶位点处，并将靶位点处的C诱导突变为T、A和G中的一种；或G突变为A、T和C中的一种。
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公开(公告)号：CN115747243A
公开(公告)日：2023-03-07
申请号：CN202210927081.4
申请日：2022-08-03
申请人： 中国农业科学院植物保护研究所
摘要： 本发明公开了一种植物病原细菌基因组编辑工具的开发及应用。本发明提供了DNA分子Ⅰ，其中具有元件甲、元件乙和元件丙；元件甲为用于表达ligD基因和Ku基因的表达盒；元件乙为用于表达Cas12a基因的表达盒；所述元件丙中具有插入位点以及用于编码crRNA骨架的DNA区段；所述插入位点供用于编码crRNA的特异结合区的DNA区段插入；crRNA的特异结合区特异性结合靶标序列。本发明通过将ligD/Ku蛋白与CRISPR/FnCas12a系统融合构建一套适用于植物病原细菌的基因组编辑工具，该方法为植物病原细菌的遗传学分析工具箱增添新的利器，对研究寄主植物和病原菌的分子互作机理研究具有重大价值。
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公开(公告)号：CN112126637B
公开(公告)日：2021-02-09
申请号：CN202011308944.7
申请日：2020-11-20
申请人： 中国农业科学院植物保护研究所
摘要： 本发明公开了腺苷脱氨酶及其相关生物材料与应用。该腺苷脱氨酶是氨基酸序列是序列表中序列2的第1‑167位的蛋白质，其名称为TadA9。TadA9与SpCas9(D10A)、SpCas9‑NG(D10A)、ScCas9(D10A)和SpRY(D10A)融合后介导的腺嘌呤碱基编辑技术的编辑效率显著高于TadA7.10和TadA‑R突变体介导的腺嘌呤碱基编辑技术，并且可以扩展其编辑活性窗口，提高了腺嘌呤碱基编辑技术的效率和扩宽了其应用范围。本发明可以提高腺嘌呤碱基编辑的效率且能够精确地介导靶位点的碱基突变，并且能够在水稻甚至其它植物细胞中广泛适用。
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公开(公告)号：CN112852791B
公开(公告)日：2022-05-24
申请号：CN202110061201.2
申请日：2020-11-20
申请人： 中国农业科学院植物保护研究所
摘要： 本发明公开了腺嘌呤碱基编辑器及其相关生物材料与应用。该腺嘌呤碱基编辑器是一种融合蛋白质，该融合蛋白质是含有Cas蛋白和腺苷脱氨酶的蛋白质，所述腺苷脱氨酶是氨基酸序列是序列表中序列2的第1‑167位的蛋白质，即TadA9。TadA9与SpCas9(D10A)、SpCas9‑NG(D10A)、ScCas9(D10A)和SpRY(D10A)融合后介导的腺嘌呤碱基编辑技术的编辑效率显著高于TadA7.10和TadA‑R突变体介导的腺嘌呤碱基编辑技术，并且可以扩展其编辑活性窗口，提高了腺嘌呤碱基编辑技术的效率和扩宽了其应用范围。本发明能够在水稻甚至其它植物细胞中广泛适用。
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公开(公告)号：CN108034671B
公开(公告)日：2021-09-28
申请号：CN201711294415.4
申请日：2017-12-08
申请人： 中国农业科学院植物保护研究所
摘要： 本申请涉及质粒载体及利用其规模化建立植物突变群体的方法。该质粒载体包括在复制起点，包含表达Cas9蛋白的基因表达盒、第一启动子、包含自杀基因序列的核苷酸序列、gRNA scaffold元件和终止信号，以及位于所述包含自杀基因序列的核苷酸序列5’端的至少一个第一酶切位点和位于所述包含自杀基因序列的核苷酸序列3’端的至少一个第二酶切位点；并且在所述质粒载体的其他位置中不存在所述第一酶切位点和所述第二酶切位点；其中，所述第一启动子位于所述终止信号的上游，所述包含自杀基因序列的核苷酸序列和所述gRNA scaffold元件和均位于所述第一启动子和所述终止信号之间。
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公开(公告)号：CN112852791A
公开(公告)日：2021-05-28
申请号：CN202110061201.2
申请日：2020-11-20
申请人： 中国农业科学院植物保护研究所
摘要： 本发明公开了腺嘌呤碱基编辑器及其相关生物材料与应用。该腺嘌呤碱基编辑器是一种融合蛋白质，该融合蛋白质是含有Cas蛋白和腺苷脱氨酶的蛋白质，所述腺苷脱氨酶是氨基酸序列是序列表中序列2的第1‑167位的蛋白质，即TadA9。TadA9与SpCas9(D10A)、SpCas9‑NG(D10A)、ScCas9(D10A)和SpRY(D10A)融合后介导的腺嘌呤碱基编辑技术的编辑效率显著高于TadA7.10和TadA‑R突变体介导的腺嘌呤碱基编辑技术，并且可以扩展其编辑活性窗口，提高了腺嘌呤碱基编辑技术的效率和扩宽了其应用范围。本发明能够在水稻甚至其它植物细胞中广泛适用。
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公开(公告)号：CN112080513A
公开(公告)日：2020-12-15
申请号：CN202010971535.9
申请日：2020-09-16
申请人： 中国农业科学院植物保护研究所
摘要： 本发明公开了一套编辑范围扩展的水稻人工基因编辑系统及其应用。本发明提供了DNA分子在水稻单碱基编辑中的应用，该DNA分子由含Cas蛋白+脱氨酶表达盒和sgRNA表达盒组成；所述含Cas蛋白+脱氨酶表达盒表达融合蛋白，所述融合蛋白含有Cas蛋白和脱氨酶，所述脱氨酶为胞嘧啶脱氨酶和/或腺嘌呤脱氨酶，所述Cas蛋白为氨基酸序列是SEQ ID No.6的第212‑1578位的蛋白质；所述sgRNA表达盒表达sgRNA，所述sgRNA的靶标序列是5′‑N19‑20PAM‑3′。本发明能广泛地应用于水稻基因组中靶标基因的敲除或单碱基的定向突变。
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公开(公告)号：CN110066824B
公开(公告)日：2021-06-08
申请号：CN201810069129.6
申请日：2018-01-24
申请人： 中国农业科学院植物保护研究所
IPC分类号： C12N15/82 , C12N15/113
摘要： 本申请涉及一套用于水稻的碱基编辑人工系统，其包括：第I调节元件，其包括能够编码如氨基酸序列I的核苷酸序列；其中所述氨基酸序列I包括如SEQ ID No.1所示的氨基酸序；第II调节元件，其包括依次从5’端到3’端的第II‑1核苷酸序列和第II‑2核苷酸序列；所述第II‑1核苷酸序列包括靶核苷酸序列；所述第II‑2核苷酸序列包括来源于化脓链球菌的sgRNA核酸序列；所述第II‑1核苷酸序列和所述第II‑2核苷酸序列转录融合。
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