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公开(公告)号：CN113481311B
公开(公告)日：2021-12-31
申请号：CN202111041179.1
申请日：2021-09-07
申请人： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6858 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/01
摘要： 本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及鉴定布鲁氏菌疫苗株M5的SNP分子标记及其应用。本发明提供的SNP分子标记，其包含位于如SEQ ID NO.1所示序列第37位多态性为A/C的核苷酸序列，该SNP分子标记的多态性位点为A，对应于布鲁氏菌疫苗株M5，多态性位点为C，对应于野毒株或其他布鲁氏菌疫苗株。本发明的SNP分子标记及其检测引物和探针可实现布鲁氏菌疫苗株M5和野毒株、其他布鲁氏菌疫苗株的简便和高效鉴别，准确性较高，可应用于布鲁氏菌病病原监测和流行病学分析，为布鲁氏菌病防控提供精准的技术支撑。
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公开(公告)号：CN112111588A
公开(公告)日：2020-12-22
申请号：CN202011004977.2
申请日：2020-09-22
申请人： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6869 , G16B30/00 , G16B40/30
摘要： 本发明公开了一种定量16S宏基因组测序方法，采用随机标签和内参法相结合的方法，有效的提高了菌群结构检测的精准性，降低了实验操作对结果的影响，也提高了测序与其他分子生物学方法间的可比性，对于菌群多样性研究和未知病原检测具有重要的研究价值。
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公开(公告)号：CN106868114B
公开(公告)日：2020-01-07
申请号：CN201710061639.4
申请日：2017-01-26
申请人： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
IPC分类号： C12Q1/6851 , C12Q1/6895 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/77
摘要： 本发明提供一种镰刀菌病病原菌实时荧光定量PCR检测引物和探针组合及试剂盒。所述引物和探针组合的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1‑12所示。本发明的试剂盒能够快速、特异、灵敏、稳定对角膜镰刀菌病病原菌进行分子诊断。在建立了可靠的镰刀菌病病原菌检测体系的基础上，本发明针对性地设计了竞争性内参，确保阴性结果的真实可信。同时，本发明提供的试剂盒包含改良的DNA提取体系，能快速有效地完成DNA提取过程，使检测更为快捷方便。
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公开(公告)号：CN106755502B
公开(公告)日：2020-04-07
申请号：CN201710061637.5
申请日：2017-01-26
申请人： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q1/6851 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
摘要： 本发明提供一种暗色丝孢霉病病原菌实时荧光定量PCR检测引物和探针组合及试剂盒。所述引物和探针组合的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1‑12所示。本发明的试剂盒能够快速、特异、灵敏、稳定对暗色丝孢霉病病原菌进行分子诊断。在建立了可靠的暗色丝孢霉病病原菌检测体系的基础上，本发明针对性地设计了竞争性内参，确保阴性结果的真实可信。同时，本发明在DNA提取方案和分子检测方法上均做了一些针对性对性的优化，以确保暗色丝孢霉病中的病原菌准确检出。
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公开(公告)号：CN106701980B
公开(公告)日：2019-11-29
申请号：CN201710064639.X
申请日：2017-02-04
申请人： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
摘要： 本发明提供一种用于鉴别羊种和牛种布鲁氏菌的核心SNP标记及其应用。本发明基于最小核心基因组(minimum core genome,MCG)分型技术，通过筛选每个MCG Group中特有的单核苷酸多态性(SNP)位点，获得用于鉴别羊种和牛种布鲁氏菌的核心SNP标记，所述核心SNP标记分别位于布鲁氏菌基因BOV_0551和基因BOV_A0392上，并设计引物对分离菌株进行简便和高效的鉴定，可应用于布病病原监测和流行病学分析，为布病防控提供新的技术支撑。
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公开(公告)号：CN111793704B
公开(公告)日：2021-01-05
申请号：CN202010945299.3
申请日：2020-09-10
申请人： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6858 , C12Q1/04 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及鉴别布鲁氏菌疫苗株S2和野毒株的SNP分子标记及其应用。本发明提供用于鉴别布鲁氏菌疫苗株S2和野毒株的SNP分子标记，其包含位于如SEQ ID NO.1所示序列第749位多态性为G/T的核苷酸序列，该SNP分子标记的多态性位点为G，对应于布鲁氏菌疫苗株S2，多态性位点为T，对应于野毒株。本发明的SNP分子标记及其检测引物和探针可实现布鲁氏菌疫苗株S2和野毒株的简便和高效鉴别，准确性较高，可应用于布鲁氏菌病病原监测和流行病学分析，为布鲁氏菌病防控提供高效的技术支撑。
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公开(公告)号：CN113481311A
公开(公告)日：2021-10-08
申请号：CN202111041179.1
申请日：2021-09-07
申请人： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6858 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/01
摘要： 本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及鉴定布鲁氏菌疫苗株M5的SNP分子标记及其应用。本发明提供的SNP分子标记，其包含位于如SEQ ID NO.1所示序列第37位多态性为A/C的核苷酸序列，该SNP分子标记的多态性位点为A，对应于布鲁氏菌疫苗株M5，多态性位点为C，对应于野毒株或其他布鲁氏菌疫苗株。本发明的SNP分子标记及其检测引物和探针可实现布鲁氏菌疫苗株M5和野毒株、其他布鲁氏菌疫苗株的简便和高效鉴别，准确性较高，可应用于布鲁氏菌病病原监测和流行病学分析，为布鲁氏菌病防控提供精准的技术支撑。
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公开(公告)号：CN111793704A
公开(公告)日：2020-10-20
申请号：CN202010945299.3
申请日：2020-09-10
申请人： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
IPC分类号： C12Q1/689 , C12Q1/6858 , C12Q1/04 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及鉴别布鲁氏菌疫苗株S2和野毒株的SNP分子标记及其应用。本发明提供用于鉴别布鲁氏菌疫苗株S2和野毒株的SNP分子标记，其包含位于如SEQ ID NO.1所示序列第749位多态性为G/T的核苷酸序列，该SNP分子标记的多态性位点为G，对应于布鲁氏菌疫苗株S2，多态性位点为T，对应于野毒株。本发明的SNP分子标记及其检测引物和探针可实现布鲁氏菌疫苗株S2和野毒株的简便和高效鉴别，准确性较高，可应用于布鲁氏菌病病原监测和流行病学分析，为布鲁氏菌病防控提供高效的技术支撑。
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公开(公告)号：CN106755502A
公开(公告)日：2017-05-31
申请号：CN201710061637.5
申请日：2017-01-26
申请人： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
摘要： 本发明提供一种暗色丝孢霉病病原菌实时荧光定量PCR检测引物和探针组合及试剂盒。所述引物和探针组合的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1‑12所示。本发明的试剂盒能够快速、特异、灵敏、稳定对暗色丝孢霉病病原菌进行分子诊断。在建立了可靠的暗色丝孢霉病病原菌检测体系的基础上，本发明针对性地设计了竞争性内参，确保阴性结果的真实可信。同时，本发明在DNA提取方案和分子检测方法上均做了一些针对性对性的优化，以确保暗色丝孢霉病中的病原菌准确检出。
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公开(公告)号：CN107341367A
公开(公告)日：2017-11-10
申请号：CN201710409822.9
申请日：2017-06-02
申请人： 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
CPC分类号： G06F19/26 , G06F17/30392 , G06F17/30554 , G06F17/30592 , G06F19/28
摘要： 本发明涉及微生物数据处理技术领域，提供一种耐药基因数据平台的多维数据展示方法及系统，接收用户在预先创建的耐药基因数据平台的首页显示界面上的输入动作，生成对应的操作指令，然后根据操作指令的类型执行平台多维数据展示、信息检索和生物信息分析动作，实现对有关耐药基因及相关信息的汇集和对学者用户的展示，同时为学者用户提供基于blast的基因序列的比对分析结果和耐药基因预测分析，也为初学者和中外学者提供便利的研究平台。
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