一种代谢组深度注释方法

    公开(公告)号:CN114594171B

    公开(公告)日:2023-12-15

    申请号:CN202011407735.8

    申请日:2020-12-03

    摘要: 本发明公开了一种复杂生物样本代谢组深度注释方法。该方法通过对生物样本提取物进行基于超高效液相色谱‑高分辨质谱的非靶向代谢组学分析,获取生物样本的代谢组色谱‑质谱信息,再根据所获非靶向代谢组学数据中的实验一级质谱离子质荷比和实验保留时间,从代谢组学数据库筛选匹配的候选代谢物;进一步根据候选代谢物的分子指纹相似性构建代谢物分子结构关联网络。然后,利用非靶向超高效液相色谱‑高分辨质谱代谢组实验数据,以分子结构关联网络作为背景网络,进行代谢组规模化定性。本发明方法不依赖于大规模的实验二级谱图数据库,定性的覆盖度和可靠性更高。(56)对比文件孔宏伟 等.基于液相色谱-质谱联用的代谢组学研究中代谢物的结构鉴定进展《.色谱》.2014,第32卷(第10期),Shanshan Xu 等.Metabolomics Based onUHPLC-Orbitrap-MS and Global NaturalProduct Social Molecular NetworkingReveals Effects of Time Scale andEnvironment of Storage on the Metabolitesand Taste Quality of Raw Pu-erh Tea.《Journal of Agricultural and FoodChemistry》.2019,第67卷(第43期),Brian E. Sedio 等.A protocol forhigh-throughput,untargeted forestcommunity metabolomics using massspectrometry molecular networks.《Applications in Plant Sciences》.2018,第6卷(第3期),Huibin Shen 等.Metaboliteidentification through multiple kernellearning on fragmentation trees.《Bioinformatics》.2014,第30卷

    一种代谢组深度注释方法
    6.
    发明公开

    公开(公告)号:CN114594171A

    公开(公告)日:2022-06-07

    申请号:CN202011407735.8

    申请日:2020-12-03

    摘要: 本发明公开了一种复杂生物样本代谢组深度注释方法。该方法通过对生物样本提取物进行基于超高效液相色谱‑高分辨质谱的非靶向代谢组学分析,获取生物样本的代谢组色谱‑质谱信息,再根据所获非靶向代谢组学数据中的实验一级质谱离子质荷比和实验保留时间,从代谢组学数据库筛选匹配的候选代谢物;进一步根据候选代谢物的分子指纹相似性构建代谢物分子结构关联网络。然后,利用非靶向超高效液相色谱‑高分辨质谱代谢组实验数据,以分子结构关联网络作为背景网络,进行代谢组规模化定性。本发明方法不依赖于大规模的实验二级谱图数据库,定性的覆盖度和可靠性更高。

    一种基于直接进样质谱的代谢物定性方法

    公开(公告)号:CN118150669A

    公开(公告)日:2024-06-07

    申请号:CN202211546427.2

    申请日:2022-12-05

    IPC分类号: G01N27/62 H01J49/42

    摘要: 本发明公布了一种基于直接进样质谱的代谢物定性方法,采用四极杆隔离窗口移动的数据非依赖采集模式获取混合样本中代谢物二级信息,根据子离子强度与隔离窗口中心值变化得到母离子与子离子潜在对应关系;随后将不同浓度的个体样本提取物分别注入质谱,采用谱图拼接式分段扫描模式获取代谢物一级信息,数据非依赖模式获取二级信息,根据母离子与子离子强度相关性得到母离子与子离子对应关系。最后将同一母离子采用上述两种模式得到的共有子离子作为该母离子的二级质谱实现母离子‑子离子的精确归属,从而对质量相近的代谢物进行精确鉴定。有助于基于直接进样质谱技术的高通量代谢组学研究。

    基于直接进样高分辨质谱的高通量检测代谢物方法

    公开(公告)号:CN116263423A

    公开(公告)日:2023-06-16

    申请号:CN202111521896.4

    申请日:2021-12-13

    IPC分类号: G01N27/62 G01N1/28

    摘要: 本发明公布了一种基于直接进样高分辨质谱的高通量检测代谢物新方法,涉及小分子代谢物的检测及高分辨质谱领域。本发明基于直接进样高分辨质谱技术,首先利用直接进样傅里叶变换离子回旋共振超高分辨质谱构建高覆盖、高质量准确度的血清代谢物分子式数据库;其次,根据自建数据库中分子式个数在不同质核比范围内的分布,指导建立基于直接进样纳升喷雾电离高分辨质谱的高通量代谢组检测方法;最后,通过对高通量检测方法获得的非靶向代谢物数据进行自建数据库搜索,实现代谢物的高通量分子注释。本发明通过两步采集的策略,以高可靠、高覆盖代谢组分子库为桥梁,兼顾了检测通量、覆盖度及可靠性。本发明方法的可靠性更高、代谢组覆盖范围更广,适合大规模代谢组数据分析。

    联合标志物及在诊断心房颤动中应用及诊断试剂或试剂盒

    公开(公告)号:CN115112776A

    公开(公告)日:2022-09-27

    申请号:CN202110291839.5

    申请日:2021-03-18

    摘要: 本发明涉及血浆样品中脂质代谢物脂肪酸(FA)23:0、溶血磷脂酰胆碱(LPC)20:5和磷脂酰肌醇(PI)16:0_18:1作为联合标志物在制备用于诊断心房颤动疾病的试剂盒中的新应用。本发明还涉及检测心律失常受试者中的心房颤动的试剂盒,通过检测来自受试者的血浆样品中上述联合标志物的各自浓度,基于二元逻辑回归方程计算所述联合标志物变量Prob以及判断截点值(cut‑off值),判断受试者是否患有心房颤动。所述试剂盒可实现对心房颤动疾病高灵敏、高效检测。本发明涉及的三种脂质代谢物具有检测成本低、稳定性好的特点。上述几种脂质代谢物联合使用,可在心房颤动的辅助诊断中得到应用。

    一种筛查糖尿病的联合型代谢标志物的应用及其试剂盒

    公开(公告)号:CN112903885B

    公开(公告)日:2022-05-06

    申请号:CN201911218594.2

    申请日:2019-12-03

    IPC分类号: G01N30/88

    摘要: 本发明涉及空腹血清中代谢物:半乳糖,1,5‑脱水山梨糖醇,N‑乙酰葡糖胺,2‑羟基丁酸作为组合标志物在制备用于快速诊断受试者中糖尿病患者的试剂盒中的新应用。通过检测来自受试者空腹血清样本中的上述四种代谢物的浓度,基于二元逻辑回归方程计算所述组合标志物变量P,以及判断截点值,判断受试者是否患有糖尿病。所述试剂盒可实现高灵敏、高效检测,本发明涉及的几种小分子代谢物,具有检测成本低,重复性好的特点。本发明可应用于辅助快速筛查糖尿病人群中得到应用,且可与传统临床指标空腹血糖相互补充的特点,具有较好的应用前景。