公开(公告)号：CN117821597A

公开(公告)日：2024-04-05

申请号：CN202410251616.X

申请日：2024-03-06

申请人： 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所

发明人： 裴仁军 ,  杨德元 ,  王子迅 ,  李铖 ,  孔玉彤

IPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q1/6837 ,  C12N15/11

摘要： 本发明涉及一种实时检测活细胞内lncRNA表达水平的方法及其应用，所述方法包括：将携带荧光基团和荧光淬灭基团的发夹DNA修饰到带有纳米针的芯片上，得到捕获探针；将捕获探针通过离心刺入目标细胞，与其共同孵育；分析纳米针芯片上的荧光信号，得到检测结果。将纳米针芯片通过离心刺入细胞时，细胞中的目标lncRNA与纳米针上的发夹DNA互补配对，DNA发夹颈环结构改变，探针的荧光开启，再将纳米针芯片取出，这样目标lncRNA便可以被纳米针捕获，最后通过共聚焦显微镜对纳米针芯片上的lncRNA分子表达谱的荧光图像进行分析和定量。该方法为临床诊断和生物医学研究提供了一个全新的视角和检测平台。

公开(公告)号：CN117821597B

公开(公告)日：2024-05-24

申请号：CN202410251616.X

申请日：2024-03-06

申请人： 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所

发明人： 裴仁军 ,  杨德元 ,  王子迅 ,  李铖 ,  孔玉彤

IPC分类号： C12Q1/6886 ,  C12Q1/6837 ,  C12N15/11

摘要： 本发明涉及一种实时检测活细胞内lncRNA表达水平的方法及其应用，所述方法包括：将携带荧光基团和荧光淬灭基团的发夹DNA修饰到带有纳米针的芯片上，得到捕获探针；将捕获探针通过离心刺入目标细胞，与其共同孵育；分析纳米针芯片上的荧光信号，得到检测结果。将纳米针芯片通过离心刺入细胞时，细胞中的目标lncRNA与纳米针上的发夹DNA互补配对，DNA发夹颈环结构改变，探针的荧光开启，再将纳米针芯片取出，这样目标lncRNA便可以被纳米针捕获，最后通过共聚焦显微镜对纳米针芯片上的lncRNA分子表达谱的荧光图像进行分析和定量。该方法为临床诊断和生物医学研究提供了一个全新的视角和检测平台。

公开(公告)号：CN118006789B

公开(公告)日：2024-08-09

申请号：CN202410418304.3

申请日：2024-04-09

申请人： 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所

发明人： 裴仁军 ,  李铖 ,  孙娜 ,  王志利

IPC分类号： C12Q1/6886 ,  G16B30/00 ,  G16B25/10 ,  G16B40/00 ,  G16B50/30

摘要： 本发明公开了与结直肠癌相关生物标志物或其检测试剂在制备诊断结直肠癌的产品中的应用。本发明通过TCGA数据库中结直肠癌组织转录谱信息与GTEx数据库中正常肠组织信息整合，挖掘与结直肠癌相关生物标志物，并基于神经网络架构，通过网格搜索和交叉验证寻找最佳超参数，建立诊断模型。该模型在测试集上诊断准确率为94.6%，灵敏度和特异性分别为98.7%和90.3%，结合机器学习、深度学习的优势，面对复杂数据时预测准确度更高，为结直肠癌的临床诊断提供了方法参考。

公开(公告)号：CN118006789A

公开(公告)日：2024-05-10

申请号：CN202410418304.3

申请日：2024-04-09

申请人： 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所

发明人： 裴仁军 ,  李铖 ,  孙娜 ,  王志利

IPC分类号： C12Q1/6886 ,  G16B30/00 ,  G16B25/10 ,  G16B40/00 ,  G16B50/30

摘要： 本发明公开了与结直肠癌相关生物标志物或其检测试剂在制备诊断结直肠癌的产品中的应用。本发明通过TCGA数据库中结直肠癌组织转录谱信息与GTEx数据库中正常肠组织信息整合，挖掘与结直肠癌相关生物标志物，并基于神经网络架构，通过网格搜索和交叉验证寻找最佳超参数，建立诊断模型。该模型在测试集上诊断准确率为94.6%，灵敏度和特异性分别为98.7%和90.3%，结合机器学习、深度学习的优势，面对复杂数据时预测准确度更高，为结直肠癌的临床诊断提供了方法参考。

公开(公告)号：CN117887856A

公开(公告)日：2024-04-16

申请号：CN202410220354.0

申请日：2024-02-28

申请人： 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所

发明人： 裴仁军 ,  李铖 ,  孙娜 ,  王志利

IPC分类号： C12Q1/6886 ,  G16B25/10

摘要： 本发明公开了一种结直肠癌的诊断生物标志物及检测方法。所述结直肠癌生物标志物包括转谷氨酰胺酶2、上皮细胞黏附分子，二肽酶1、基质金属肽酶14和跨膜4L超家族成员1的组合，和/或，转谷氨酰胺酶2的编码核酸、上皮细胞黏附分子的编码核酸、二肽酶1的编码核酸、基质金属肽酶14的编码核酸和跨膜4L超家族成员1的编码核酸的组合。本发明以所述生物标志物为特征构建CRC Score诊断模型，在测试组患者的诊断准确率为88％，灵敏度和特异度分别为86％和92％，相比于现有血清指标能更早发现结直肠癌，有利于结直肠癌的早期筛查。