一种植物微生物耐药性基因的检测方法

    公开(公告)号:CN105624297B

    公开(公告)日:2020-03-10

    申请号:CN201610060794.X

    申请日:2016-01-29

    申请人: 江汉大学

    发明人: 张静 彭海 高利芬

    IPC分类号: C12Q1/6895

    摘要: 本发明公开了一种植物微生物耐药性基因的检测方法。所述方法包括:确定耐药性基因、内源标准基因和外源标准基因;制备多重扩增引物;向待测样品中加入外源核酸,得到混合样品并提取基因组;向基因组中加入外源标准基因,获得混合核酸;扩增混合核酸,利用扩增产物构建高通量测序文库并进行高通量测序,得到测序片段组;分析所述测序片段组,并根据获得的外源标准基因和内源标准基因的测序片段的数量,判断实验是否成功;若实验成功,则计算耐药性基因的含量;根据耐药性基因的含量判定待测样品是否含有耐药性基因。所述方法可以一次性定量检测任意微生物中的任意多种希望检测的耐药性基因,且检测不需要培养与纯化微生物,速度快,结果准确可靠。

    一种非诊断目的的肠道微生物定性与定量的检测方法

    公开(公告)号:CN105603081B

    公开(公告)日:2019-12-06

    申请号:CN201610061101.9

    申请日:2016-01-29

    IPC分类号: C12Q1/689

    摘要: 本发明公开了一种非诊断目的的肠道微生物定性与定量的检测方法,属于生物技术领域。所述方法包括以下步骤:确定待测样品中的目标微生物类群、目标微生物和非目标生物、以及不存在于所述待测样品中的参考微生物;设计目标微生物类群与目标微生物的特征区域;设计特征区域的多重扩增引物;在待测样品中加入参考微生物与外源核酸后,提取待测样品中的微生物的核酸;利用设计的多重引物扩增微生物核酸,扩增获得特征测序片段;利用特征测序片段定性、定量分析待测样品中微生物。本发明不需要对微生物进行预培养与增殖,可以一次性地对待测样品中的多种已知微生物进行高通量、高准确度、高分辨率的检测,检测过程简单、快速且流程规范。

    一种测试纯系油菜新品种的特异性、一致性与稳定性的方法

    公开(公告)号:CN104846077B

    公开(公告)日:2018-11-13

    申请号:CN201510148702.9

    申请日:2015-03-31

    IPC分类号: C12Q1/6869 C40B50/06

    摘要: 本发明公开了一种测试纯系油菜新品种的特异性、一致性与稳定性的方法。所述方法包括:获得变异位点;确定待测油菜品种的测试区域;构建数据库;确定抽样量后,随机抽样混合并提取混合样本的DNA;制备引物;利用引物对混合样本的DNA进行扩增,扩增产物用于构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;分析测序片段组,获得待测油菜品种基因型和杂株基因型;比较获得近似品种、变异位点和变异位点率;将杂株基因型与数据库中的基因型比较,获得杂株品种后,计算杂株率;利用变异位点、变异位点率和杂株率,判断待测油菜品种特异性、一致性和稳定性。该方法能够准确、完整地判断待测油菜品种的特异性、稳定性与一致性。

    一种测试纯系水稻新品种的特异性、一致性与稳定性的方法

    公开(公告)号:CN104805184B

    公开(公告)日:2018-03-20

    申请号:CN201510148635.0

    申请日:2015-03-31

    IPC分类号: C12Q1/68

    摘要: 本发明公开了一种测试纯系水稻新品种的特异性、一致性与稳定性的方法,具体包括:获得变异位点;确定待测水稻品种的测试区域;构建数据库;确定抽样量后,随机抽样混合并提取混合样本的DNA;制备引物;利用引物对混合样本的DNA进行扩增,扩增产物用于构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;分析测序片段组,获得待测水稻品种基因型和杂株基因型;比较获得近似品种、变异位点和变异位点率;将杂株基因型与数据库中的基因型比较,获得杂株品种后,计算杂株率;利用变异位点、变异位点率和杂株率,判断待测水稻品种特异性、一致性和稳定性。该方法能够准确、完整地判断待测水稻品种的特异性、稳定性与一致性。