公开(公告)号：CN116189775A

公开(公告)日：2023-05-30

申请号：CN202211414891.6

申请日：2022-11-10

Applicant: 南京邮电大学

Inventor： 郭丽 ,  颜小强 ,  熊依琪 ,  任得康 ,  任玉杰 ,  向阳洋

IPC: G16B40/00 ,  G16B25/10 ,  G16B20/50 ,  G16H50/50 ,  G16H50/70

Abstract: 本发明属于生物医药领域，提供一种基于性别的肺腺癌免疫预后模型的构建方法。基于肺腺癌高通量测序数据和肺腺癌单细胞测序数据通过生物信息学整合分析得到分性别的免疫分型，根据女性和男性中的免疫相关差异表达基因分别构建女性和男性的免疫相关预后模型并利用独立数据集进行验证。基于性别的肺腺癌免疫预后模型可以针对患者的性别，更大限度的提高肺腺癌患者术后的生存率，促进个体化治疗。在肺腺癌患者接受根治性手术后，即可通过对上述预后模型中基因的检测和联合分析，快速评估该患者术后的预后风险级别，从而能够对风险级别较高的患者尽早地开展针对性治疗，帮助延长患者的生存时间。

公开(公告)号：CN112837744A

公开(公告)日：2021-05-25

申请号：CN202110174715.9

申请日：2021-02-07

Applicant: 南京邮电大学

Inventor： 郭丽 ,  康一浩 ,  窦宇阳 ,  熊依琪 ,  颜小强 ,  夏道良

IPC: G16B15/30 ,  G16H50/80

Abstract: 本发明公开了一种前列腺癌预后显著相关ceRNA调控网络的构建方法，整合TCGA和GTEx数据库的前列腺癌基因表达数据集，分别进行差异基因表达分析和加权基因共表达网络分析，筛选差异表达的关键模块基因；通过WGCNA分析和Cox比例风险回归分析得到关键基因，将得到的关键基因，miRNA，lncRNA通过其相互作用关系构建ceRNA网络，并根据lncRNA,miRNA和hub gene在PRAD中的表达趋势进行评估，结合生存分析得到与PRAD预后显著相关的ceRNA调控网，便于进行疾病的早期诊断，设计靶向药物的精准治疗。

公开(公告)号：CN112837744B

公开(公告)日：2023-07-28

申请号：CN202110174715.9

申请日：2021-02-07

Applicant: 南京邮电大学

Inventor： 郭丽 ,  康一浩 ,  窦宇阳 ,  熊依琪 ,  颜小强 ,  夏道良

IPC: G16B15/30 ,  G16H50/80

Abstract: 本发明公开了一种前列腺癌预后显著相关ceRNA调控网络的构建方法，整合TCGA和GTEx数据库的前列腺癌基因表达数据集，分别进行差异基因表达分析和加权基因共表达网络分析，筛选差异表达的关键模块基因；通过WGCNA分析和Cox比例风险回归分析得到关键基因，将得到的关键基因，miRNA，lncRNA通过其相互作用关系构建ceRNA网络，并根据lncRNA,miRNA和hub gene在PRAD中的表达趋势进行评估，结合生存分析得到与PRAD预后显著相关的ceRNA调控网，便于进行疾病的早期诊断，设计靶向药物的精准治疗。

公开(公告)号：CN115954054A

公开(公告)日：2023-04-11

申请号：CN202310056304.9

申请日：2023-01-18

Applicant: 南京邮电大学

Inventor： 郭丽 ,  熊依琪 ,  颜小强 ,  杨雪妮 ,  熊仕正

IPC: G16B30/00 ,  G16B40/00 ,  G16B15/30 ,  C12Q1/6886

Abstract: 本发明属于生物信息领域，公开了一种基于信息熵表征isomiR表达鉴定乳腺癌生物标志物的方法，包括以下步骤：获取乳腺癌的isomiR表达数据，利用信息熵量化miRNA对应两臂的isomiR序列表达，作为miRNA的表达特征；并使用表达特征进行差异分析，筛选在乳腺癌中共同差异表达的miR‑3p/5p对；进行生存分析，预测可作为乳腺癌生物标志物的miR‑3p/5p对；获取miRNA靶标调控网络，确定其在乳腺癌发生过程中参与的生物学通路。本发明利用信息熵较无偏差地构建出表达特征，筛选在乳腺癌发生发展过程中起重要作用的生物标志物，为乳腺癌的诊断、预防和治疗提供了可行的现实方法。