一种单细胞测序文库构建方法、获得的测序文库及应用

    公开(公告)号:CN118207638A

    公开(公告)日:2024-06-18

    申请号:CN202410533373.9

    申请日:2024-04-30

    摘要: 本发明属于生物医药技术领域,涉及一种单细胞测序文库构建方法、获得的测序文库及应用,该文库构建方法利用细胞膜或细胞核膜上广泛存在的糖蛋白,以及多种能够非特异性结合糖蛋白的链霉亲和素融合蛋白,实现对多个样本的同时和无偏标记,从而构建出高质量的单细胞混样文库。本发明相较已有的基于靶向细胞表面抗原的抗体或磷脂的单细胞混样标记方法更加具有优势,对单细胞和单细胞核的标记及混样都可以较好适用,极大地丰富了适用的样本类型和使用场景。本发明可以实现多样本混样以及超高通量单细胞过载上机,极大地降低单细胞转录组实验的成本,进一步提高了单细胞转录组测序技术的应用性和普适性。

    一种可控释放分子标签的水凝胶微球及其制备方法

    公开(公告)号:CN116832718A

    公开(公告)日:2023-10-03

    申请号:CN202310781798.7

    申请日:2023-06-29

    摘要: 本发明涉及单细胞测序技术领域,尤其涉及一种可控释放分子标签的水凝胶微球及其制备方法,所述水凝胶微球与oligo序列的连接包含可断化学键,所述连接的结构顺序为:水凝胶微球‑(CS)‑(A)‑(B1C1B2C2…BnCn)‑Bn+1‑(D)‑(E),其中CS为可断化学键,A为测序接头,Bn为细胞标签,Cn为连接序列,D为可选序列,E为捕获序列。本发明所制备的水凝胶微球可通过外部刺激来释放微球表面的分子标签,无需如传统方法来溶解微球从而释放分子标签,可显著避免微球溶解产物对反应体系带来的干扰,从而提高核酸捕获的数据质量。

    一种用于单细胞测序的具有寡核苷酸序列的双层微球

    公开(公告)号:CN113234718A

    公开(公告)日:2021-08-10

    申请号:CN202110530676.1

    申请日:2021-05-15

    摘要: 本发明属于单细胞测序相关试剂,具体涉及一种双层结构的微球,外层材质为可在一定条件溶解的水凝胶(如含二硫键的聚丙烯酰胺),内部为携带寡核苷酸序列的磁性微球。本发明以双层微球的内层小微球为寡核苷酸序列分子标签的基底,在内层磁性微球上利用化学键酶连接的方法将寡核苷酸按顺序连接到磁性微球上,合成为带有独特序列的微球,再将小微球包裹到大体积的外层微球内,制作成双层微球。本发明的微球继承传统硬质磁性微球的易于连接寡核苷酸序列的优点,同时有着外层软质微球更适用于单个液滴包裹单个微球,用于单细胞测序的优点,提高单细胞测序结果的稳定性和精确性,可以广泛的应用于医学、生物等研究。

    一种高通量筛选和分析酵母单细胞的方法

    公开(公告)号:CN117907594A

    公开(公告)日:2024-04-19

    申请号:CN202410298584.9

    申请日:2024-03-15

    摘要: 本发明涉及微生物和微流控技术领域,尤其涉及一种高通量筛选和分析酵母单细胞的方法,所述方法包括如下步骤:S1.液滴生成;S2.液滴孵育;S3.液滴分选。本发明可以在单个酵母水平上对异源分泌蛋白进行快速、高效和可靠的动力学分析,还可以高通量完成分泌蛋白质和菌株的定向进化,筛选百万级酵母菌株仅需2~5 h,荧光试剂仅需1~6μL,大幅度降低试剂成本。

    一种基于液滴运动图像的自动计数分析方法

    公开(公告)号:CN117455922B

    公开(公告)日:2024-04-05

    申请号:CN202311799006.5

    申请日:2023-12-26

    摘要: 本发明涉及一种自动化计数领域,尤其设计一种基于液滴运动图像的自动计数分析方法。液滴微流控在实际应用过程中需要进行高通量的液滴融合,按照试剂比例需要两种液滴一对一的配对及融合。由于芯片尺寸、液滴大小等批次间差距较大的关键因素会影响液滴输出频率,每一次做实验需要重新确定各个试剂的流速以达成最优的配对。本发明为了克服现有技术中采取人工的方法,手动计数及调整,需要更多的时间,及更多的试错次数调整至最优比例的问题。本发明要解决的技术问题提供一种基于液滴运动图像的自动计数分析方法。本发明通过对液滴图像进行识别,之后测试不同芯片、不同试剂下的流速与液滴生成频率的关系,极大地提高了液滴识别的自动化。

    一种用于单细胞测序的微流控芯片及应用

    公开(公告)号:CN114717100B

    公开(公告)日:2024-03-19

    申请号:CN202110809113.6

    申请日:2021-07-16

    发明人: 郑文山 裴颢

    IPC分类号: C12M1/34 C12M1/00

    摘要: 本发明提供一种用于单细胞测序的微流控芯片及利用微流控芯片进行单细胞测序样品处理的方法。本发明的微流控芯片分别将细胞溶液、细胞标记物溶液(如带有核酸序列的微球)、反应试剂溶液(如细胞裂解液)存于不同储存腔,使细胞溶液入口和反应试剂溶液入口分开,可有效地提高细胞的存活率;同时,由于油相溶液在芯片流道的交叉结构处将混合液切割生成油包水液滴,可实现微球和细胞的高包裹率。

    一种基于微流控的高通量单B细胞筛选方法和应用

    公开(公告)号:CN117420105A

    公开(公告)日:2024-01-19

    申请号:CN202311234529.5

    申请日:2023-09-25

    摘要: 本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种基于微流控的高通量单B细胞筛选方法和应用,包括:将细胞相和试剂相结合并利用不相溶的油相切割得到液滴,将液滴孵育后,在荧光显微镜下确认液滴中的微球或抗原表达细胞上产生的荧光高于背景的荧光后,将液滴重新注入芯片;逐一检测芯片流道中每一个液滴的荧光强度,对荧光强度在所设阈值以上的液滴施加电场进行分选;所述细胞相为单B细胞悬液。本发明的微流控技术产生的每一个液滴都是一个独立的反应腔,单次实验可以产生107数量级的液滴,每秒钟能够处理上千个液滴,相当于10块96孔板,相比传统杂交瘤技术,不仅筛选周期从数月缩短到一天,而且也增加了目标B细胞的数量,显著提升检测效率。

    微液滴生成装置
    9.
    发明公开

    公开(公告)号:CN114950580A

    公开(公告)日:2022-08-30

    申请号:CN202110961284.0

    申请日:2021-08-20

    IPC分类号: B01L3/00

    摘要: 本发明公开了一种微液滴生成装置,其包括生成芯片,生成芯片包含第一隔室和第二隔室,生成芯片可将第一隔室和第二隔室的液体样本生成为微液滴;收集板,收集板包括收集孔;连接基座,连接基座包裹收集板,连接基座包括芯片支架,生成芯片放置并限位于芯片支架,收集板可拆卸地安装在连接基座上。通过本发明公开的微液滴生成装置,生成芯片与作为收集板的96孔板通过连接基座集成在一起,使得生产芯片生成的微液滴可以直接被作为收集板的96孔板收集。收集板可拆卸地安装于连接基座,也方便在收集微液滴后直接拆卸下来进行后续操作,无需通过其他手段和工具转移微液滴,流程简便且过程中不易污染微液滴样本。

    一种用于单细胞测序的具有特定寡核苷酸序列的微球

    公开(公告)号:CN113215233A

    公开(公告)日:2021-08-06

    申请号:CN202110531839.8

    申请日:2021-05-15

    IPC分类号: C12Q1/6869 C12Q1/6806

    摘要: 本发明属于单细胞测序相关试剂,具体涉及一种具有特定寡核苷酸序列的聚丙烯酰胺微球及其制备方法。本发明以聚丙烯酰胺微球为寡核苷酸序列分子标签的基底,利用化学键和酶连接的方法将三段寡核苷酸(oligo)按顺序连接到聚丙烯酰胺微球上,合成为带有独特oligo序列的聚丙烯酰胺微球。本发明聚丙烯酰胺微球具有特定的核苷酸序列,体积较大,根据市场上常用微流控芯片流道尺寸定制,又由于聚丙烯酰胺微球质地稍软、微弹,在实际使用中可单独占满一条流道并排列整齐,明显降低液滴包裹单个微球的难度和批次差异,使得该微球比传统硬质小微球更适用于基于液滴微流控的单细胞测序,提高单细胞测序结果的稳定性和精确性,可以广泛的应用于医学、生物等研究。