一种类器官基质胶球体的制备系统及方法

    公开(公告)号:CN118620729A

    公开(公告)日:2024-09-10

    申请号:CN202411087226.X

    申请日:2024-08-09

    摘要: 本发明属于类器官制备领域,涉及到一种类器官基质胶球体的制备系统及方法,该制备系统包括:微流控芯片,包括基质胶悬浮液腔、油相腔、细胞球悬浮液腔,所述基质胶悬浮液腔具有第一端口,所述油相腔具有第二端口;上样模块,用于承载微流控芯片,包括芯片承载台和下压推台结构,下压推台结构具有气道一和气道二,分别对应连通第一端口和第二端口;气压控制模块,用于分别控制并调节作用于基质胶悬浮液腔和油相腔的推进压力;控温模块,用于控制微流控芯片的温度。本发明优化了推动动力源,采用气压控制模块对微流控芯片通过动力,无死体积,操作更加方便,而且对样本的使用更彻底,控制更加精准,所得到的基质胶球体大小更加均匀。

    一种基于液滴运动图像的自动计数分析方法

    公开(公告)号:CN117455922A

    公开(公告)日:2024-01-26

    申请号:CN202311799006.5

    申请日:2023-12-26

    摘要: 本发明涉及一种自动化计数领域,尤其设计一种基于液滴运动图像的自动计数分析方法。液滴微流控在实际应用过程中需要进行高通量的液滴融合,按照试剂比例需要两种液滴一对一的配对及融合。由于芯片尺寸、液滴大小等批次间差距较大的关键因素会影响液滴输出频率,每一次做实验需要重新确定各个试剂的流速以达成最优的配对。本发明为了克服现有技术中采取人工的方法,手动计数及调整,需要更多的时间,及更多的试错次数调整至最优比例的问题。本发明要解决的技术问题提供一种基于液滴运动图像的自动计数分析方法。本发明通过对液滴图像进行识别,之后测试不同芯片、不同试剂下的流速与液滴生成频率的关系,极大地提高了液滴识别的自动化。

    微液滴制备装置、方法及可读存储介质

    公开(公告)号:CN116408164A

    公开(公告)日:2023-07-11

    申请号:CN202111673263.5

    申请日:2021-12-31

    IPC分类号: B01L3/00 C12Q1/6869

    摘要: 本发明公开了一种微液滴制备装置、方法及可读存储介质,包括芯片组件、识别器和控制器,所述芯片组件上设有识别标签,所述识别标签与待制备的目标微液滴相对应;所述芯片组件用于接收与所述目标微液滴对应的制备原材料;所述识别器用于识别所述识别标签以获取制备所述目标微液滴的制备参数;所述控制器用于基于所述制备参数对所述制备原材料进行制备,以得到所述目标微液滴。本申请根据识别芯片组件上的识别标签识别得到与待制备的目标微液滴一一对应的制备参数,进而通过控制器驱动微液滴芯片制备微液滴,克服或至少减轻了由于微液滴芯片结构尺寸差异导致的单细胞微液滴的包裹质量降低,进而提高单细胞测序的可靠性。

    在单细胞微生物基因组测序结果中区分菌株的方法

    公开(公告)号:CN118737269A

    公开(公告)日:2024-10-01

    申请号:CN202411204676.2

    申请日:2024-08-30

    发明人: 巢杉

    摘要: 本发明提供了一种在单细胞微生物基因组测序结果中区分菌株的方法。本发明首先基于不同位点SNP的检测深度、突变数量及基因的多样性等预设过滤条件对SAG的SNP信息进行精细过滤以获得含有特征SNP的特征矩阵,根据特征矩阵对SAG进行层次聚类后,利用可自动化确定最佳菌株数目的算法高通量地对层次聚类结果进行准确的菌株区分,再以每个SAG的比对率、覆盖度、相对覆盖比和有效覆盖比为依据,采用贪婪算法高效地从每个菌株的SAG集合中选择出最优的SAG组装集合,经组装后获得具有高完整度低污染度的高质量菌株级别基因组序列。

    一种单细胞测序文库构建方法、获得的测序文库及应用

    公开(公告)号:CN118207638A

    公开(公告)日:2024-06-18

    申请号:CN202410533373.9

    申请日:2024-04-30

    摘要: 本发明属于生物医药技术领域,涉及一种单细胞测序文库构建方法、获得的测序文库及应用,该文库构建方法利用细胞膜或细胞核膜上广泛存在的糖蛋白,以及多种能够非特异性结合糖蛋白的链霉亲和素融合蛋白,实现对多个样本的同时和无偏标记,从而构建出高质量的单细胞混样文库。本发明相较已有的基于靶向细胞表面抗原的抗体或磷脂的单细胞混样标记方法更加具有优势,对单细胞和单细胞核的标记及混样都可以较好适用,极大地丰富了适用的样本类型和使用场景。本发明可以实现多样本混样以及超高通量单细胞过载上机,极大地降低单细胞转录组实验的成本,进一步提高了单细胞转录组测序技术的应用性和普适性。

    一种基于生物多组学数据的模型构建方法与系统

    公开(公告)号:CN117476114B

    公开(公告)日:2024-04-05

    申请号:CN202311796758.6

    申请日:2023-12-25

    发明人: 郑冠涛 丛蓉

    摘要: 本发明涉及生物信息技术领域,尤其涉及一种基于生物多组学数据的模型构建方法与系统,包括:S1.样本数据获取与生物信息学分析;S2.输入嵌入:包括基因标记、表达值标记、知识标记、启动子标记、样本的组学类型标记、样本的批次数据标记和嵌入层;S3.模型的预训练:包括预训练框架和目标、注意力掩码;S4.模型的调整与应用。本发明引入了知识标记和启动子标记,使得模型能够理解生物学的专家知识;引入样本的组学类型标记和批次标记,原生支持多组学数据整合和批次效应去除,协助构建更合理的模型。

    一种生物样本制备装置
    8.
    发明公开

    公开(公告)号:CN117213949A

    公开(公告)日:2023-12-12

    申请号:CN202311378395.4

    申请日:2023-10-24

    发明人: 王戈 杨登志 张斌

    IPC分类号: G01N1/28

    摘要: 本发明公开了一种生物样本制备装置,属于生命科学实验仪器领域,包括用于盛放组织的试管本体和密封底盖;旋转研磨轴连接在密封底盖上;旋转研磨轴、解离密封底盖、解离外筒上设有多组研磨组件。多组研磨组件包括第一研磨部、第二研磨部、第三研磨部、第四研磨部。第一研磨部与第三研磨部相抵,第二研磨部与第四研磨部相抵。第一滑落面、第二滑落面、第三滑落面均位于旋转研磨轴上。本发明在使用时,样品通过第二滑落面和第三滑落面进入到第一研磨部与第三研磨部之间的缝隙、第二研磨部与第四研磨部之间的缝隙,进入到缝隙中的生物组织样品将会被挤压、研磨,通过各组研磨面之间的相互摩擦研磨,能使掉落到缝隙中的样品被充分研磨。

    一种微生物裂解液、裂解方法及试剂盒

    公开(公告)号:CN116694472A

    公开(公告)日:2023-09-05

    申请号:CN202310879380.X

    申请日:2023-07-18

    发明人: 郑文山 张孝瑾

    IPC分类号: C12N1/06

    摘要: 本发明涉及微生物基因组检测技术领域,尤其涉及一种微生物裂解液、裂解方法及试剂盒,所述裂解液的制备原料包括:复合酶、表面活性剂、牛血清白蛋白、引物、裂解缓冲液、裂解酶、水。本发明采用多种生物酶共同裂解的方法,操作简单,仅在PCR仪上便能完成微生物裂解,且裂解所需样本量少,通量高,可同时对多个样本同时裂解,并且能通过染色迅速检测裂解效果,使用于快速检测大量样本。

    一种用于单细胞测序的具有寡核苷酸序列的双层微球

    公开(公告)号:CN113234718A

    公开(公告)日:2021-08-10

    申请号:CN202110530676.1

    申请日:2021-05-15

    摘要: 本发明属于单细胞测序相关试剂,具体涉及一种双层结构的微球,外层材质为可在一定条件溶解的水凝胶(如含二硫键的聚丙烯酰胺),内部为携带寡核苷酸序列的磁性微球。本发明以双层微球的内层小微球为寡核苷酸序列分子标签的基底,在内层磁性微球上利用化学键酶连接的方法将寡核苷酸按顺序连接到磁性微球上,合成为带有独特序列的微球,再将小微球包裹到大体积的外层微球内,制作成双层微球。本发明的微球继承传统硬质磁性微球的易于连接寡核苷酸序列的优点,同时有着外层软质微球更适用于单个液滴包裹单个微球,用于单细胞测序的优点,提高单细胞测序结果的稳定性和精确性,可以广泛的应用于医学、生物等研究。