-
公开(公告)号:CN111909914B
公开(公告)日:2022-04-12
申请号:CN202010695299.2
申请日:2020-07-19
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域,具体为一种来源于酿脓链球菌的CRISPR核酸酶SpCas9的高PAM兼容性截短型变异体txCas9及其应用。本发明中的高PAM兼容性截短型变异体txCas9核酸酶属于CRISPR‑Cas9系统。txCas9核酸酶是将高PAM兼容性xCas9核酸酶的第180位到299位的氨基酸截掉后重组所得。该高PAM兼容性截短型变异体txCas9不仅具有与野生型CRISPR‑Cas9核酸酶相当的基因编辑活性,而且能够识别NGN、GAA、GAT PAM,有效扩宽了CRISPR‑Cas9核酸酶的靶向范围。重要的是,该小型化Cas9核酸酶适合使用装载容量有限的腺病毒载体进行体内运输,因而在生物医药的体内精准编辑方面具有更大的应用潜力。
-
公开(公告)号:CN111893104B
公开(公告)日:2021-06-04
申请号:CN202010666107.5
申请日:2020-07-12
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域,具体为一种基于结构的CRISPR蛋白的优化设计方法。本发明基于已解析的CRISPR/Cas9蛋白结构,首先通过分析和比较,找出对Cas9某一功能有重要影响的氨基酸位点;然后结合Rosetta优化Cas9的Protein‑DNA相互作用界面,最后设计并获得新型突变体,成功地获得一个突变体yCas9。该突变体具有xCas9相当的剪切活性:宽泛的PAM识别范围,可识别NGG、NGA、NGT、NGC、GAA和GAT,且在基因编辑时脱靶率低。因此,yCas9在功能上可与xCas9并驾齐驱,是一个有潜在应用价值的基因编辑工具,证明本设计方法的有效性和实用性。
-
公开(公告)号:CN110272881B
公开(公告)日:2021-04-30
申请号:CN201910581265.8
申请日:2019-06-29
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域,具体为一种来源于酿脓链球菌的CRISPR核酸酶SpCas9的截短型高特异性变异体及其应用。本发明中的CRISPR‑Cas9(TSpCas9‑V1/V2)核酸酶属于CRISPR‑Cas9系统,TSpCas9‑V1核酸酶将截短型CRISPR‑Cas9(TSpCas9)核酸酶的第863位的氨基酸H突变成N,TSpCas9‑V2核酸酶将截短型CRISPR‑Cas9(TSpCas9)核酸酶的第862位的氨基酸H突变成A,将第863位的氨基酸H突变成N;该截短型高特异性变异体具有与野生型CRISPR‑Cas9核酸酶相当的基因编辑活性,能够降低基因编辑中的脱靶,因而能用于对基因组DNA片段特定位置的精准编辑。
-
公开(公告)号:CN110241099B
公开(公告)日:2021-04-30
申请号:CN201910488075.1
申请日:2019-06-05
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域,具体为来源于酿脓链球菌的CRISPR核酸酶SpCas9的截短变异体及其应用。本发明中,CRISPR‑Cas9(TSpCas9)核酸酶属于CRISPR‑Cas9系统,具有野生型CRISPR‑Cas9核酸酶相当的剪切活性,所述CRISPR‑Cas9(TSpCas9)核酸酶是将野生型CRISPR‑Cas9核酸的氨基酸序列截掉120个即第180位到299位的氨基酸后重组所得;所述野生型CRISPR‑Cas9核酸酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.7所示;或者所述CRISPR‑Cas9核酸酶含有如SEQ ID NO.7所示90%的氨基酸序列,即SEQ ID NO.15。该截短变异体可用于基因组编辑、基因打靶、基因组工程、表观基因组工程、基因治疗与体外诊断。
-
公开(公告)号:CN111893104A
公开(公告)日:2020-11-06
申请号:CN202010666107.5
申请日:2020-07-12
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域,具体为一种基于结构的CRISPR蛋白的优化设计方法。本发明基于已解析的CRISPR/Cas9蛋白结构,首先通过分析和比较,找出对Cas9某一功能有重要影响的氨基酸位点;然后结合Rosetta优化Cas9的Protein-DNA相互作用界面,最后设计并获得新型突变体,成功地获得一个突变体yCas9。该突变体具有xCas9相当的剪切活性:宽泛的PAM识别范围,可识别NGG、NGA、NGT、NGC、GAA和GAT,且在基因编辑时脱靶率低。因此,yCas9在功能上可与xCas9并驾齐驱,是一个有潜在应用价值的基因编辑工具,证明本设计方法的有效性和实用性。
-
公开(公告)号:CN110241098B
公开(公告)日:2021-04-30
申请号:CN201910488074.7
申请日:2019-06-05
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域,具体为一种来源于酿脓链球菌的CRISPR核酸酶SpCas9的截短型高特异性变体及其应用。本发明Cas9核酸酶变体(THSpCas9),属于CRISPR‑Cas9系统,具有野生型CRISPR‑Cas9核酸酶基因编辑功能,CRISPR‑Cas9核酸酶是将野生型CRISPR‑Cas9核酸的氨基酸序截掉8个即第494‑501位的氨基酸后重组所得到;野生型CRISPR‑Cas9核酸酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,或者,所述CRISPR‑Cas9核酸酶含有如SEQ ID NO.1所示90%的氨基酸序列,即SEQ ID NO.2。采用所述Cas9核酸酶变体(THSpCas9)能够提高编辑特异性,实现对基因组DNA片段的特定位置的精准编辑。
-
公开(公告)号:CN110272881A
公开(公告)日:2019-09-24
申请号:CN201910581265.8
申请日:2019-06-29
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域,具体为一种来源于酿脓链球菌的CRISPR核酸酶SpCas9的截短型高特异性变异体及其应用。本发明中的CRISPR-Cas9(TSpCas9-V1/V2)核酸酶属于CRISPR-Cas9系统,TSpCas9-V1核酸酶将截短型CRISPR-Cas9(TSpCas9)核酸酶的第863位的氨基酸H突变成N,TSpCas9-V2核酸酶将截短型CRISPR-Cas9(TSpCas9)核酸酶的第862位的氨基酸H突变成A,将第863位的氨基酸H突变成N;该截短型高特异性变异体具有与野生型CRISPR-Cas9核酸酶相当的基因编辑活性,能够降低基因编辑中的脱靶,因而能用于对基因组DNA片段特定位置的精准编辑。
-
公开(公告)号:CN111909914A
公开(公告)日:2020-11-10
申请号:CN202010695299.2
申请日:2020-07-19
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域,具体为一种来源于酿脓链球菌的CRISPR核酸酶SpCas9的高PAM兼容性截短型变异体txCas9及其应用。本发明中的高PAM兼容性截短型变异体txCas9核酸酶属于CRISPR-Cas9系统。txCas9核酸酶是将高PAM兼容性xCas9核酸酶的第180位到299位的氨基酸截掉后重组所得。该高PAM兼容性截短型变异体txCas9不仅具有与野生型CRISPR-Cas9核酸酶相当的基因编辑活性,而且能够识别NGN、GAA、GAT PAM,有效扩宽了CRISPR-Cas9核酸酶的靶向范围。重要的是,该小型化Cas9核酸酶适合使用装载容量有限的腺病毒载体进行体内运输,因而在生物医药的体内精准编辑方面具有更大的应用潜力。
-
公开(公告)号:CN110241099A
公开(公告)日:2019-09-17
申请号:CN201910488075.1
申请日:2019-06-05
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域,具体为来源于酿脓链球菌的CRISPR核酸酶SpCas9的截短变异体及其应用。本发明中,CRISPR-Cas9(TSpCas9)核酸酶属于CRISPR-Cas9系统,具有野生型CRISPR-Cas9核酸酶相当的剪切活性,所述CRISPR-Cas9(TSpCas9)核酸酶是将野生型CRISPR-Cas9核酸的氨基酸序列截掉120个即第180位到299位的氨基酸后重组所得;所述野生型CRISPR-Cas9核酸酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.7所示;或者所述CRISPR-Cas9核酸酶含有如SEQ ID NO.7所示90%的氨基酸序列,即SEQ ID NO.15。该截短变异体可用于基因组编辑、基因打靶、基因组工程、表观基因组工程、基因治疗与体外诊断。
-
公开(公告)号:CN110241098A
公开(公告)日:2019-09-17
申请号:CN201910488074.7
申请日:2019-06-05
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属于蛋白质工程技术领域,具体为一种来源于酿脓链球菌的CRISPR核酸酶SpCas9的截短型高特异性变体及其应用。本发明Cas9核酸酶变体(THSpCas9),属于CRISPR-Cas9系统,具有野生型CRISPR-Cas9核酸酶基因编辑功能,CRISPR-Cas9核酸酶是将野生型CRISPR-Cas9核酸的氨基酸序截掉8个即第494-501位的氨基酸后重组所得到;野生型CRISPR-Cas9核酸酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,或者,所述CRISPR-Cas9核酸酶含有如SEQ ID NO.1所示90%的氨基酸序列,即SEQ ID NO.2。采用所述Cas9核酸酶变体(THSpCas9)能够提高编辑特异性,实现对基因组DNA片段的特定位置的精准编辑。
-
-
-
-
-
-
-
-
-