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公开(公告)号:CN116935959A
公开(公告)日:2023-10-24
申请号:CN202310477930.5
申请日:2023-04-25
申请人: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 全国畜牧总站
摘要: 本发明属于基因测序领域,提供了一种Sanger基因测序结果快速判读方法、系统及介质。其中,Sanger基因测序结果快速判读方法包括获取Sanger基因测序文件,基于所述测序文件提取每个测序位点的四个碱基的信号值,判断每个测序位点的纯合或杂合状态,生成主要序列和次要序列;获取配置文件信息,根据靶位点的锚定序列在主序列中定位靶位点的位置,进而确定出靶位点的纯合或杂合状态并提取出主要序列和次要序列中的靶位点碱基,得到靶位点的基因型;根据靶位点的基因型及靶位点的位置,输出基因型或氨基酸报告。
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公开(公告)号:CN113416789B
公开(公告)日:2022-06-03
申请号:CN202110851539.8
申请日:2021-07-27
申请人: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明属于奶牛酮病抗性育种技术领域,涉及与奶牛血液β‑羟丁酸浓度相关的分子标记及应用,所述分子标记包括位于UBA6基因上的SNP位点g.66266G>T。本发明提供了与奶牛血液β‑羟丁酸浓度相关的分子标记及应用,提供了UBA6基因中与奶牛血液β‑羟丁酸浓度相关的SNP位点及其加性遗传效应,具有良好的实际应用价值。
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公开(公告)号:CN118773327A
公开(公告)日:2024-10-15
申请号:CN202410866212.1
申请日:2024-07-01
申请人: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC分类号: C12Q1/6888 , G16B20/20 , C12N15/11
摘要: 本发明提出了一种与奶牛体细胞数相关的SNP及其应用,属于生物化学遗传育种技术领域。本发明中鉴定获得一种与奶牛体细胞数性状相关的SNP(chr6:g.88494442T>C),分析其基因型CC为优势基因型。通过选择优势基因型个体留种,可以提高SLC4A4优势基因型在奶牛群体中的频率,从而优化奶牛群体的体细胞数,提高奶牛的乳房健康,降低乳腺炎发生概率,增加经济效益。本发明为改善奶牛乳腺炎抗性遗传改良提供了一种新的方法。
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公开(公告)号:CN113774154B
公开(公告)日:2023-09-22
申请号:CN202111249291.4
申请日:2021-10-26
申请人: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要: 本发明属于动物分子育种技术领域,涉及一种筛选牛体高变异相关分子标记的方法及其应用,所述分子标记包括位于GALNT8基因上的单核苷酸多态位点,分别为:rs133878668A﹥C、rs135659917A﹥G、rs210135533G﹥A和rs110000229A﹥G。利用全基因组关联分析方法结合基因型效应、环境效应及基因型与环境互作效应分析,准确高效地筛选体高变异相关的重要新候选基因和分子标记,方法科学合理,依据候选基因和标记设计的检测方法,具有操作简单快捷、结果准确性高和成本低的特点。
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公开(公告)号:CN116590422A
公开(公告)日:2023-08-15
申请号:CN202211273521.5
申请日:2022-10-18
申请人: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 山东省农业机械科学研究院
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要: 本发明属于动物遗传育种技术领域,具体涉及一种筛选牛寒冷气候适应基因DNAJC18和功能性分子标记的方法及其应用。本发明选择分布于北方和南方的牛品种,利用牛高密度SNP芯片进行基因分型,整合FLK和hapFLK两种基因组选择信号分析方法,比较分析南北方牛之间和牛品种内的基因组选择信号,鉴定受到强烈选择的区域和正选择基因,筛选出适应寒冷环境的基因及其分子标记;并利用牛的重测序数据进一步挖掘潜在的功能标记,并建立相应检测技术。本发明为寒冷地区特色牛品种的培育等分子育种提供了科学依据和简单易行的检测技术;同时对于地方牛品种遗传资源的保护、评价和利用具有重要意义和价值。
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公开(公告)号:CN118048464A
公开(公告)日:2024-05-17
申请号:CN202410249248.5
申请日:2024-03-05
申请人: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号: C12Q1/6888 , G01N33/68 , C12N15/11
摘要: 本发明属于动物分子育种技术领域,具体涉及一种牛精液品质相关基因及其分子标记和应用。具体的,本发明通过基因敲除小鼠模型明确了Cfap58基因在雄性繁殖以及精子发生中的作用机制,并在CFAP58基因启动子区域发现了两个SNPs和一个indel与公牛精液品质显著关联,可作为评价公牛精液品质的分子标记,从而可用于高繁殖力公牛的筛选育种,因此具有良好的实际应用之价值。
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公开(公告)号:CN118028221A
公开(公告)日:2024-05-14
申请号:CN202410359163.2
申请日:2024-03-27
申请人: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
摘要: 本发明提供了一种牛卵母细胞成熟液和应用,属于动物繁殖技术领域。本发明通过在基础培养基中添加脂氧素,有效提高牛卵母细胞成熟效率,促进卵丘细胞增殖,提高了胚胎发育能力,进而提高牛体外胚胎生产效率。
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公开(公告)号:CN117385051A
公开(公告)日:2024-01-12
申请号:CN202311140018.7
申请日:2023-09-05
申请人: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要: 本发明属于动物抗病分子育种领域,涉及一种分子标记在制备检测牛酮病抗性试剂中的应用。所述分子标记为ACAA2基因核心启动子区遗传变异g.‑424G>C。经群体基因分型并与血液BHB浓度关联分析表明,g.‑424G>C不同基因型与血液BHB浓度显著相关,并影响基因启动子活性,其中,CC型奶牛血液BHB浓度显著低于GG和GC基因型。
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公开(公告)号:CN117070642A
公开(公告)日:2023-11-17
申请号:CN202311160631.5
申请日:2023-09-08
申请人: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC分类号: C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要: 本发明属于奶牛育种标记物技术领域,具体涉及与奶牛生产寿命相关的SNP分子标记及其应用。所述分子标记来自NDUFA9基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述序列的第304bp处为突变位点,碱基为C或A。所述突变位点的碱基为A,即chr5:g.105870613C>A时,表现为长生产寿命的性状。本发明鉴别了1个SNP位点,通过分子生物学相关技术检测个体奶牛NDUFA9基因在此位点的基因型,并且通过和奶牛生产寿命性状的估计育种值的关联分析,选择有利的基因型个体留种,可以提高NDUFA9基因长生产寿命基因型在奶牛群体中的频率,从而提高奶牛群体的使用年限,降低养殖成本,增加牧场的经济效益。本发明为奶牛的生产寿命遗传改良提供了一种新的方法。
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公开(公告)号:CN116875738A
公开(公告)日:2023-10-13
申请号:CN202310912114.2
申请日:2023-07-24
申请人: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC分类号: C12Q1/6897
摘要: 本发明涉及一种鉴定牛TDP‑43基因启动子活性区域的方法,包括以下步骤:(1)牛TDP‑43基因启动子的克隆;(2)牛TDP‑43启动子5’端系列缺失片段荧光素酶报告基因载体的构建及鉴定;(3)牛TDP‑43基因启动子系列缺失片段转录活性分析及核心启动子区确定;(4)牛TDP‑43核心启动子区转录因子结合位点预测及筛选。通过本发明,为进一步筛选调控牛TDP‑43基因表达的转录因子、研究调控TDP‑43基因转录的具体机制提供了一种便捷高效的方法。
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