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公开(公告)号：CN118048464A
公开(公告)日：2024-05-17
申请号：CN202410249248.5
申请日：2024-03-05
申请人： 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号： C12Q1/6888 , G01N33/68 , C12N15/11
摘要： 本发明属于动物分子育种技术领域，具体涉及一种牛精液品质相关基因及其分子标记和应用。具体的，本发明通过基因敲除小鼠模型明确了Cfap58基因在雄性繁殖以及精子发生中的作用机制，并在CFAP58基因启动子区域发现了两个SNPs和一个indel与公牛精液品质显著关联，可作为评价公牛精液品质的分子标记，从而可用于高繁殖力公牛的筛选育种，因此具有良好的实际应用之价值。
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公开(公告)号：CN113684206B
公开(公告)日：2023-06-13
申请号：CN202111080861.1
申请日：2021-09-15
申请人： 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号： C12N15/11 , C12Q1/6888 , C12Q1/6858
摘要： 本发明涉及一种SNP分子标记在鉴定高繁殖性能奶牛及辅助育种中的应用，属于生物化学遗传育种技术领域，具体通过牛50K SNP芯片和全基因组关联分析的方法提供了SIGLEC12基因作为奶牛妊娠期标记基因的应用，并通过分子生物学相关技术提供了SIGLEC12基因第七外显子的一组单倍型的信息，可用于选择具有优势妊娠周期基因型的奶牛个体。养殖企业通过选择优势基因型个体留种，可以提高SIGLEC12基因妊娠周期优势基因型在奶牛群体中的频率，从而优化奶牛群体的妊娠周期，提高奶牛的繁殖效率，降低养殖成本，增加经济效益。本发明为加速奶牛的妊娠周期遗传改良提供了一种新的方法。
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公开(公告)号：CN113774154B
公开(公告)日：2023-09-22
申请号：CN202111249291.4
申请日：2021-10-26
申请人： 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要： 本发明属于动物分子育种技术领域，涉及一种筛选牛体高变异相关分子标记的方法及其应用，所述分子标记包括位于GALNT8基因上的单核苷酸多态位点，分别为：rs133878668A﹥C、rs135659917A﹥G、rs210135533G﹥A和rs110000229A﹥G。利用全基因组关联分析方法结合基因型效应、环境效应及基因型与环境互作效应分析，准确高效地筛选体高变异相关的重要新候选基因和分子标记，方法科学合理，依据候选基因和标记设计的检测方法，具有操作简单快捷、结果准确性高和成本低的特点。
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公开(公告)号：CN113897441B
公开(公告)日：2024-05-31
申请号：CN202111294873.4
申请日：2021-11-03
申请人： 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种奶牛产乳热抗性筛选的SNP分子标记及在育种领域的应用，属于奶牛育种分子标记技术领域。产乳热是5‑9岁奶牛群中最常见的一种急性低钙性代谢病，在奶牛生产的全阶段都可能发生，且容易复发，对奶牛的健康状况及产奶量都有明显的影响。本发明设计获取奶牛产乳热抗性相关的分子标记，辅助筛选优势性状母本育种进行奶牛遗传改良。基于上述技术目的，本发明具体提供了一种影响奶牛产乳热抗性的GRM8基因和分子标记，通过测序鉴别奶牛在该基因上的标签SNP的基因型，选择具有优势基因型或单倍型个体进行遗传改良，从而提高奶牛群体的抗产乳热能力，减少经济损失。
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公开(公告)号：CN113897441A
公开(公告)日：2022-01-07
申请号：CN202111294873.4
申请日：2021-11-03
申请人： 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及一种奶牛产乳热抗性筛选的SNP分子标记及在育种领域的应用，属于奶牛育种分子标记技术领域。产乳热是5‑9岁奶牛群中最常见的一种急性低钙性代谢病，在奶牛生产的全阶段都可能发生，且容易复发，对奶牛的健康状况及产奶量都有明显的影响。本发明设计获取奶牛产乳热抗性相关的分子标记，辅助筛选优势性状母本育种进行奶牛遗传改良。基于上述技术目的，本发明具体提供了一种影响奶牛产乳热抗性的GRM8基因和分子标记，通过测序鉴别奶牛在该基因上的标签SNP的基因型，选择具有优势基因型或单倍型个体进行遗传改良，从而提高奶牛群体的抗产乳热能力，减少经济损失。
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公开(公告)号：CN113774154A
公开(公告)日：2021-12-10
申请号：CN202111249291.4
申请日：2021-10-26
申请人： 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要： 本发明属于动物分子育种技术领域，涉及一种筛选牛体高变异相关分子标记的方法及其应用，所述分子标记包括位于GALNT8基因上的单核苷酸多态位点，分别为：rs133878668A﹥C、rs135659917A﹥G、rs210135533G﹥A和rs110000229A﹥G。利用全基因组关联分析方法结合基因型效应、环境效应及基因型与环境互作效应分析，准确高效地筛选体高变异相关的重要新候选基因和分子标记，方法科学合理，依据候选基因和标记设计的检测方法，具有操作简单快捷、结果准确性高和成本低的特点。
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公开(公告)号：CN113684206A
公开(公告)日：2021-11-23
申请号：CN202111080861.1
申请日：2021-09-15
申请人： 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 山东奥克斯畜牧种业有限公司
IPC分类号： C12N15/11 , C12Q1/6888 , C12Q1/6858
摘要： 本发明涉及一种SNP分子标记在鉴定高繁殖性能奶牛及辅助育种中的应用，属于生物化学遗传育种技术领域，具体通过牛50K SNP芯片和全基因组关联分析的方法提供了SIGLEC12基因作为奶牛妊娠期标记基因的应用，并通过分子生物学相关技术提供了SIGLEC12基因第七外显子的一组单倍型的信息，可用于选择具有优势妊娠周期基因型的奶牛个体。养殖企业通过选择优势基因型个体留种，可以提高SIGLEC12基因妊娠周期优势基因型在奶牛群体中的频率，从而优化奶牛群体的妊娠周期，提高奶牛的繁殖效率，降低养殖成本，增加经济效益。本发明为加速奶牛的妊娠周期遗传改良提供了一种新的方法。
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公开(公告)号：CN117165592A
公开(公告)日：2023-12-05
申请号：CN202311189787.6
申请日：2023-09-14
申请人： 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC分类号： C12N15/113 , C12N5/10 , C12N15/85 , C12N15/64 , C12N15/12
摘要： 本发明提供了一种靶向敲除牛乳腺上皮细胞TARDBP基因的sgRNA及其构建的细胞株。该sgRNA包括sgRNA1、sgRNA2，sgRNA的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2所示。本发明的sgRNA能够精确指导Cas9蛋白靶向切割牛乳腺上皮细胞TARDBP基因，采用该sgRNA构建获得的表达载体细胞转化率高，极大提高了敲除牛乳腺上皮细胞TARDBP基因的成功率，获得TARDBP基因敲除乳腺上皮细胞系。为便于研究TARDBP基因在奶牛的乳脂分泌和产奶方面的功能及其机制供了细胞模型，为奶牛生物育种奠定了基础。
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公开(公告)号：CN117025797A
公开(公告)日：2023-11-10
申请号：CN202311211912.9
申请日：2023-09-19
申请人： 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
IPC分类号： C12Q1/6888 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要： 本发明公开了与奶牛乳房炎抗性相关的SNP分子标记及其应用，属于奶牛育种标记物领域。本发明提供的与奶牛乳房炎抗性相关的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，多态性位点位于如SEQ ID No.1所示序列的第129位，多态性为C或T。该分子标记能够在不同遗传背景下准确预测奶牛乳房炎抗性特性，可用于鉴别高乳房炎抗性性状的奶牛，提高分子设计育种的效率。且根据上述SNP位点的鉴定结果，养殖人员可以选择有利的基因型个体留种，从而改善奶牛群体的乳房炎抗性性状，提高奶牛群体的乳房炎抗性，降低治疗成本，提高牧场经济效益。
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公开(公告)号：CN116935959A
公开(公告)日：2023-10-24
申请号：CN202310477930.5
申请日：2023-04-25
申请人： 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 , 全国畜牧总站
摘要： 本发明属于基因测序领域，提供了一种Sanger基因测序结果快速判读方法、系统及介质。其中，Sanger基因测序结果快速判读方法包括获取Sanger基因测序文件，基于所述测序文件提取每个测序位点的四个碱基的信号值，判断每个测序位点的纯合或杂合状态，生成主要序列和次要序列；获取配置文件信息，根据靶位点的锚定序列在主序列中定位靶位点的位置，进而确定出靶位点的纯合或杂合状态并提取出主要序列和次要序列中的靶位点碱基，得到靶位点的基因型；根据靶位点的基因型及靶位点的位置，输出基因型或氨基酸报告。
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