针对EGFR-TKI靶向药物的ON-TARGET耐药突变位点的肿瘤疫苗及其设计模型

    公开(公告)号:CN116966282A

    公开(公告)日:2023-10-31

    申请号:CN202310887925.1

    申请日:2023-07-19

    摘要: 本发明公开了一种针对EGFR‑TKI靶向药物的ON‑TARGET耐药突变位点的肿瘤疫苗及其设计模型,属于生物医药领域,本发明的肿瘤疫苗能够缓解目前所有EGFR‑TKI靶向药物的耐药问题;具有广谱性,可有效降低医疗成本;进一步的,本发明的疫苗肽是根据每个基因型在EGFR耐药患者中的检出频率,对最终得到的疫苗肽序列进行分级后,再进行组合得到的疫苗肽组合,疫苗肽组合能够更好地覆盖并杀伤更多耐药基因型的肿瘤细胞;疫苗肽组合可与EGFR‑TKI靶向治疗进行联合治疗,能够在一定程度上克服肿瘤异质性的影响,提升疫苗疗效;本疫苗无需检测,节省成本和时间,有利于尽早开展对症治疗以获得更好地抑癌疗效。

    一种单链分子标签接头及单链DNA建库方法及其在检测循环肿瘤DNA中应用

    公开(公告)号:CN109797197A

    公开(公告)日:2019-05-24

    申请号:CN201910110142.6

    申请日:2019-02-11

    摘要: 本发明公开了一种单链分子标签接头及单链DNA建库方法及其在检测循环肿瘤DNA中应用,单链分子标签接头,包括:14个碱基配对形成的茎结构、测序引物序列、和8个随机核苷酸组成的分子标签序列,其中测序引物序列与茎结构序列之间插入了一位碱基“U”,该单链核酸序列经退火变性会形成茎环结构;本发明通过单链DNA建库,解决现有检测技术中对液态活检特别是ctDNA片段短、浓度低、碎片化、灵敏度低技术问题;实现准确辨别基因组坐标始末位点相同的测序reads是来自同一还是多个原始细胞释放出来的cfDNA,并将来源于同一个细胞的原始正负链的测序reads配对起来分析的目的,从而降低测序的重复劳动,提高对假阳性突变的分辨率。

    一种筛选新生抗原或新生抗原编码序列的方法

    公开(公告)号:CN112301088B

    公开(公告)日:2022-12-13

    申请号:CN202011134511.4

    申请日:2020-10-21

    摘要: 本发明公开了一种筛选新生抗原或新生抗原编码序列的方法,将待筛选新生抗原编码序列插入到原始表达载体中获得重组表达载体,然后转染未成熟的DC细胞,培养转染后的DC细胞使DC细胞成熟,成熟的DC细胞表面表达有相应的新生抗原表位肽,由成熟的DC细胞将新生抗原表位肽递呈给T细胞,诱导T细胞活化为效应T细胞,再将效应T细胞与肿瘤细胞共培养,筛选杀伤肿瘤细胞效果好的效应T细胞,从而筛选出免疫原性好的新生抗原,对应的编码序列即为筛选到的免疫原性好的新生抗原编码序列。本发明筛选新生抗原或新生抗原编码序列的方法,可以快速筛选得到免疫原性强的新生抗原,且其对应的野生型肽不具有免疫原性,这类的新生抗原是疫苗的最佳选择。

    一种筛选新生抗原或新生抗原编码序列的方法

    公开(公告)号:CN112301088A

    公开(公告)日:2021-02-02

    申请号:CN202011134511.4

    申请日:2020-10-21

    摘要: 本发明公开了一种筛选新生抗原或新生抗原编码序列的方法,将待筛选新生抗原编码序列插入到原始表达载体中获得重组表达载体,然后转染未成熟的DC细胞,培养转染后的DC细胞使DC细胞成熟,成熟的DC细胞表面表达有相应的新生抗原表位肽,由成熟的DC细胞将新生抗原表位肽递呈给T细胞,诱导T细胞活化为效应T细胞,再将效应T细胞与肿瘤细胞共培养,筛选杀伤肿瘤细胞效果好的效应T细胞,从而筛选出免疫原性好的新生抗原,对应的编码序列即为筛选到的免疫原性好的新生抗原编码序列。本发明筛选新生抗原或新生抗原编码序列的方法,可以快速筛选得到免疫原性强的新生抗原,且其对应的野生型肽不具有免疫原性,这类的新生抗原是疫苗的最佳选择。

    溶瘤病毒与新生抗原联用的肿瘤疫苗及其制备方法

    公开(公告)号:CN110433286A

    公开(公告)日:2019-11-12

    申请号:CN201910758706.7

    申请日:2019-08-16

    摘要: 本发明公开了一种溶瘤病毒与新生抗原联用的肿瘤疫苗及其制备方法,联用疫苗可通过两种方式实现,第一种是将溶瘤病毒试剂的产生的免疫应答反应,促进多肽试剂被抗原递呈细胞吞噬的效率并提高能特异性识别肿瘤新抗原的T细胞的数量与肿瘤浸润能力,从而增强抗癌疗效;第二种是将编码肿瘤新抗原的基因插入溶瘤病毒载体中,大量表达肿瘤新生抗原,并结合溶瘤病毒的肿瘤杀伤能力,进一步增强肿瘤病灶局部的免疫应答反应,提高杀伤型T细胞在肿瘤组织中的浸润程度,使局部产生免疫原反应,刺激效应细胞的产生达到抗癌效果;通过实验比较发现,第一种联用疫苗、第二种联用疫苗均具有良好的抑瘤效果,第二种联用疫苗具有显著的抑瘤效果。

    针对肿瘤靶向药物耐药位点的多肽疫苗及其设计方法

    公开(公告)号:CN109887553A

    公开(公告)日:2019-06-14

    申请号:CN201910086371.9

    申请日:2019-01-29

    IPC分类号: G16C20/50 G16C20/70 G16B20/50

    摘要: 本发明公开了一种针对肿瘤靶向药物耐药位点的多肽疫苗及其设计方法,设计方法包括如下步骤:收集靶向药物耐药突变数据;截取耐药突变多肽序列截取及预测MHC分子亲和力及免疫原性;靶向药物与耐药位点相互关系及药物聚类;人工设计相对应的疫苗多肽序列;通过这样的设计方法得到的靶向药物联合多肽疫苗组合能够覆盖常见的靶向治疗药物,可以有效降低肿瘤耐药发生概率,延长靶向药有效作用时间,增加患者的疾病响应率,具有广谱性,缩短个体化多肽疫苗从分析到治疗的时间,降低医疗成本。