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公开(公告)号：CN118006731A
公开(公告)日：2024-05-10
申请号：CN202410143693.3
申请日：2024-02-01
Applicant: 浙江大学
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种利用超低起始量血浆游离DNA构建甲基化文库的方法，该方法包括如以下步骤：(1)血浆游离DNA的提取和质检；(2)血浆游离DNA的末端修复和加A尾反应；(3)血浆游离DNA与有甲基化修饰的接头的连接；(4)重亚硫酸氢盐处理；(5)文库PCR和纯化筛选。本发明在传统的RRBS文库构建方法的基础之上加以修改，通过后续实验探索，提出了一种操作流程简单，重复性好的超低量血浆游离DNA起始的甲基化文库构建方法，解决了大量血浆样本难以获得的问题。
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公开(公告)号：CN116042820A
公开(公告)日：2023-05-02
申请号：CN202211089666.X
申请日：2022-09-07
Applicant: 浙江大学
Abstract: 本发明公开了一组结肠癌的DNA甲基化分子标志物及其在制备用于结肠癌早期诊断试剂盒中的应用。所述的标志物是30个结肠癌甲基化特异性的CpG位点。这30个CpG位点包括cg06668555、cg06392169、cg18596362、cg13265789、cg21782409、cg04555373、cg01893212、cg04904331、cg12584684、cg04454951、cg04804539、cg20078466、cg09493505、cg05470523、cg19202058、cg00333226、cg15701178、cg01194057、cg01610488、cg07039180、cg04279973、cg06716730、cg18500968、cg03462053、cg05000488、cg14898779、cg14018648、cg19981409、cg05407490和cg0533134，分布在16个不同基因上：FAM135B、IRF4、CBLN2、UNC5C、NRG1、VWC2、MAL、IKZF1、TRPA1、PRKCB、DUSP14、TMPRSS3、KRT6A、STK31、ASGR1和NOX4。其中，有9个基因与结肠癌患者的生存率明显相关，可用于制备结肠癌预后判断试剂盒。本发明还公开了检测所述DNA甲基化标志物的方法。本发明的DNA甲基化分子标志物具有良好的诊断指标特性，可以有效用于结肠癌诊断和预后，具有较高的临床使用和推广价值。
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公开(公告)号：CN116042820B
公开(公告)日：2023-09-29
申请号：CN202211089666.X
申请日：2022-09-07
Applicant: 浙江大学
Abstract: 本发明公开了一组结肠癌的DNA甲基化分子标志物及其在制备用于结肠癌早期诊断试剂盒中的应用。所述的标志物是30个结肠癌甲基化特异性的CpG位点。这30个CpG位点包括cg06668555、cg06392169、cg18596362、cg13265789、cg21782409、cg04555373、cg01893212、cg04904331、cg12584684、cg04454951、cg04804539、cg20078466、cg09493505、cg05470523、cg19202058、cg00333226、cg15701178、cg01194057、cg01610488、cg07039180、cg04279973、cg06716730、cg18500968、cg03462053、cg05000488、cg14898779、cg14018648、cg19981409、cg05407490和cg0533134，分布在16个不同基因上：FAM135B、IRF4、CBLN2、UNC5C、NRG1、VWC2、MAL、IKZF1、TRPA1、PRKCB、DUSP14、TMPRSS3、KRT6A、STK31、ASGR1和NOX4。其中，有9个基因与结肠癌患者的生存率明显相关，可用于制备结肠癌预后判断试剂盒。本发明还公开了检测所述DNA甲基化标志物的方法。本发明的DNA甲基化分子标志物具有良好的诊断指标特性，可以有效用于结肠癌诊断和预后，具有较高的临床使用和推广价值。
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