公开(公告)号：CN116042820A

公开(公告)日：2023-05-02

申请号：CN202211089666.X

申请日：2022-09-07

Applicant: 浙江大学

Inventor： 陆燕 ,  刘鹏渊 ,  刘艺 ,  穆罕默德·阿曼努拉 ,  易佳妮 ,  周莉媛

IPC: C12Q1/6886 ,  G16B5/00 ,  G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00 ,  G06N20/10

Abstract: 本发明公开了一组结肠癌的DNA甲基化分子标志物及其在制备用于结肠癌早期诊断试剂盒中的应用。所述的标志物是30个结肠癌甲基化特异性的CpG位点。这30个CpG位点包括cg06668555、cg06392169、cg18596362、cg13265789、cg21782409、cg04555373、cg01893212、cg04904331、cg12584684、cg04454951、cg04804539、cg20078466、cg09493505、cg05470523、cg19202058、cg00333226、cg15701178、cg01194057、cg01610488、cg07039180、cg04279973、cg06716730、cg18500968、cg03462053、cg05000488、cg14898779、cg14018648、cg19981409、cg05407490和cg0533134，分布在16个不同基因上：FAM135B、IRF4、CBLN2、UNC5C、NRG1、VWC2、MAL、IKZF1、TRPA1、PRKCB、DUSP14、TMPRSS3、KRT6A、STK31、ASGR1和NOX4。其中，有9个基因与结肠癌患者的生存率明显相关，可用于制备结肠癌预后判断试剂盒。本发明还公开了检测所述DNA甲基化标志物的方法。本发明的DNA甲基化分子标志物具有良好的诊断指标特性，可以有效用于结肠癌诊断和预后，具有较高的临床使用和推广价值。

公开(公告)号：CN112986497B

公开(公告)日：2022-04-01

申请号：CN202110181973.X

申请日：2021-02-09

Applicant: 浙江大学

Inventor： 高翔 ,  姚龙超 ,  郑成航 ,  翁卫国 ,  吴卫红 ,  刘潇繁 ,  陆燕 ,  刘少俊 ,  杨洋 ,  宋浩 ,  张涌新

IPC: G01N33/00 ,  G06N3/08

Abstract: 本发明涉及一种基于气体传感器阵列指纹识别的污染气体溯源方法，包括构建污染物气体传感器阵列；建立气体污染物排放源的传感器阵列响应指纹库；在线监测、实时收集传感器阵列的响应数据；采用人工神经网络分析对比数据、确定气体污染事故的排放源；开展事故发生可能排放源的现场调查、取证及验证五个步骤。本发明将排放源的污染特征做成信息集成的指纹图谱库，而无需获得气体污染物的具体种类和浓度，极大地简化了溯源模型；溯源结果对指纹识别模型的优化改进功能具有累积效应，可不断提高溯源准确性；该方法适用于小空间尺度范围内潜在污染源集中情况下的污染溯源，便于工业园区内环境空气质量的快速有效监管。

公开(公告)号：CN107451419B

公开(公告)日：2020-01-24

申请号：CN201710576797.3

申请日：2017-07-14

Applicant: 浙江大学

Inventor： 陆燕 ,  孙喜伟 ,  刘鹏渊 ,  周莉媛

IPC: G16B30/00 ,  G16B5/00

Abstract: 本发明公开了一种通过计算机程序模拟产生简化DNA甲基化测序数据的方法，可以用来评估不同简化基因组甲基化(RRBS)测序数据比对软件的效率以及相应数据分析平台的可靠性，以此来确定最优的比对方法及相应的最优参数。本发明通过计算机程序模拟RRBS文库构建和测序过程，根据CpGs甲基化水平的分布，产生与真实RRBS测序数据非常相近的仿真数据。该仿真数据除了模拟单个碱基水平的甲基化水平外，还模拟了真实数据的插入、缺失、单核苷酸变异和结构变异等其他特性以增加真实性。此外，本发明在模拟RRBS测序过程中，通过引入经验误差模型来模拟测序过程中出现的误差，进一步增加了仿真数据的真实性。

公开(公告)号：CN109913547A

公开(公告)日：2019-06-21

申请号：CN201910157340.8

申请日：2019-03-01

Applicant: 浙江大学医学院附属妇产科医院

Inventor： 陆燕 ,  刘鹏渊 ,  吕卫国 ,  郑梦月

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/686 ,  C12N15/113

Abstract: 本发明公开了一种血浆外泌体miRNA生物标志物及其在用于宫颈癌早期诊断的微量数字PCR试剂盒中的应用，所述分子标记的RNA序列如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:8所示。以本发明标记物为基础进行检测，灵敏度高，特异性好，AUC可高达0.992，诊断效果良好。在测试数据中，根据其中的2个miRNAs的表达量，能有效区分宫颈上皮内瘤变1级以下和宫颈上皮内瘤变2级以上的患者样本。本发明公开的新型的血浆外泌体miRNA分子标记物具有良好的诊断指标的特性，所开发的用于检测这8个miRNA的诊断试剂盒及检测方法，所述试剂盒由特异性扩增引物以及通用PCR扩增试剂组成，可以有效用于宫颈癌筛查诊断，具有较高的临床使用和推广价值。

公开(公告)号：CN109852686A

公开(公告)日：2019-06-07

申请号：CN201910142875.8

申请日：2019-02-26

Applicant: 浙江大学医学院附属妇产科医院

Inventor： 陆燕 ,  郑梦月 ,  刘鹏渊 ,  吕卫国

IPC: C12Q1/6883 ,  C12Q1/6886 ,  C12N15/113 ,  G16B25/10 ,  G16B25/20

Abstract: 本发明公开了一种外泌体miRNA标准化的多内参联合定量的方法及其用途，具体包括以下步骤：(1)高通量miRNA测序数据的标准化处理；(2)利用变异系数和标准差筛选内参miRNAs；(3)数字PCR的测序引物设计；(4)miRNA的数字PCR检测；(5)多内参联合标准的R_score值计算。通过对大量取自健康的体检样本和不同程度疾病患者的样本进行研究，发现miR-128-3p,miR-129-5p,miR-320a和Let-7i-5p或其组合能够作为血浆外泌体microRNA标准化的内参，具有极高的稳定性和准确度。本发明基于数字PCR方法，为生物体内外泌体miRNA的研究提供了一种有效且便捷的定量标准化检测，弥补目前外泌体中没有标准内参U6 snRNA的缺陷，对于全面深入外泌体microRNA的生物标志物筛选具有的重要意义。

公开(公告)号：CN108048460A

公开(公告)日：2018-05-18

申请号：CN201810102540.9

申请日：2018-02-01

Applicant: 浙江大学

Inventor： 刘鹏渊 ,  孙喜伟 ,  陆燕 ,  周莉媛

IPC: C12N15/11 ,  C12Q1/6886

Abstract: 本发明公开了一种新型分子标记及其在制备用于头颈癌诊断和预后的试剂盒中的应用，所述新型分子标记的RNA序列如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:48所示。以本发明标记物为基础，构建头颈癌诊断的数学模型；该模型灵敏度高，特异性好，AUC可高达0.981，诊断效果良好。此外，这48个tRF片段也可以作为头颈癌分型及预测病人生存期的分子标记物；在测试数据中，根据tRFs表达，头颈癌肿瘤样本被聚类成4个亚型，通过生存曲线分析显示这些亚型的生存期存在显著差异；本发明公开的新型的tRF分子标记物具有良好的诊断指标的特性，可以有效用于头颈癌诊断、分型和预后，具有较高的临床使用和推广价值。

公开(公告)号：CN1880459A

公开(公告)日：2006-12-20

申请号：CN200610050388.1

申请日：2006-04-18

Applicant: 浙江大学

Inventor： 梅乐和 ,  陆燕

IPC: C12N15/63 ,  C12N15/53 ,  C12N15/64 ,  C12N1/21 ,  C12P17/10

Abstract: 本发明公开了一种能共表达P450BM3和葡萄糖脱氢酶，并能催化吲哚合成靛蓝的质粒pET28a(+)－P450BM3－gdh0310、制备方法及其用途。它是将P450BM3基因和葡萄糖脱氢酶基因共同连接在同一个表达载体pET28a(+)上，将此质粒转入E.coliBL21，得到的菌株能同时表达细胞色素P450BM3单加氧酶和葡萄糖脱氢酶，并能协同作用催化吲哚生成靛蓝，与以往菌株相比，其催化活性提高了22－27倍，为生物转化生产染料靛蓝提供了广阔的应用前景。

公开(公告)号：CN117265117B

公开(公告)日：2024-08-13

申请号：CN202311405832.7

申请日：2023-10-27

Applicant: 浙江大学

Inventor： 陆燕 ,  余梦倩 ,  刘鹏渊 ,  周莉媛 ,  李旭凡 ,  李佳

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种tRF分子标记物CAT1及其在制备用于癌症诊断和预后试剂盒中的应用，所述分子标记物CAT1是新发现的tRNA来源的RNA片段(tRNA‑derived RNA fragment，tRF)，其RNA序列为UCCCCAGUACCUCCACCA。本发明证实tRF CAT1在多种肿瘤组织中的表达均上调，并且其高表达与多种类型癌症患者的不良生存预后呈正相关。此外，以肺腺癌为例，本发明在肺腺癌患者血浆中检测到CAT1的表达，并证实与非癌症对照组血浆样本相比，肺腺癌患者血浆中CAT1的水平显著升高。本发明还公开了精确检测所述tRF分子标记物CAT1的方法。本发明公开的tRF分子标记物CAT1对于多种癌症都具有良好的诊断和预后指示作用，并可以有效用于肺腺癌的无创诊断和预后预测，具有较高的临床使用和推广价值。

公开(公告)号：CN118006731A

公开(公告)日：2024-05-10

申请号：CN202410143693.3

申请日：2024-02-01

Applicant: 浙江大学

Inventor： 陆燕 ,  易佳妮 ,  刘鹏渊 ,  李佳 ,  周莉媛

IPC: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  C40B50/06 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种利用超低起始量血浆游离DNA构建甲基化文库的方法，该方法包括如以下步骤：(1)血浆游离DNA的提取和质检；(2)血浆游离DNA的末端修复和加A尾反应；(3)血浆游离DNA与有甲基化修饰的接头的连接；(4)重亚硫酸氢盐处理；(5)文库PCR和纯化筛选。本发明在传统的RRBS文库构建方法的基础之上加以修改，通过后续实验探索，提出了一种操作流程简单，重复性好的超低量血浆游离DNA起始的甲基化文库构建方法，解决了大量血浆样本难以获得的问题。

公开(公告)号：CN117265117A

公开(公告)日：2023-12-22

申请号：CN202311405832.7

申请日：2023-10-27

Applicant: 浙江大学

Inventor： 陆燕 ,  余梦倩 ,  刘鹏渊 ,  周莉媛 ,  李旭凡 ,  李佳

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种新型tRF分子标记物CAT1及其在制备用于癌症诊断和预后试剂盒中的应用，所述新型分子标记物CAT1是新发现的tRNA来源的RNA片段(tRNA‑derived RNA fragment，tRF)，其RNA序列为UCCCCAGUACCUCCACCA。本发明证实tRF CAT1在多种肿瘤组织中的表达均上调，并且其高表达与多种类型癌症患者的不良生存预后呈正相关。此外，以肺腺癌为例，本发明在肺腺癌患者血浆中检测到CAT1的表达，并证实与非癌症对照组血浆样本相比，肺腺癌患者血浆中CAT1的水平显著升高。本发明还公开了精确检测所述tRF分子标记物CAT1的方法。本发明公开的新型tRF分子标记物CAT1对于多种癌症都具有良好的诊断和预后指示作用，并可以有效用于肺腺癌的无创诊断和预后预测，具有较高的临床使用和推广价值。