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公开(公告)号：CN118222686B
公开(公告)日：2025-01-28
申请号：CN202410534391.9
申请日：2024-04-30
Applicant: 浙江大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/686
Abstract: 本发明公开了一种转录组和基因组可及性双模态测序试剂盒和方法，能同时分析一个细胞中的染色体开放区域基因组信息和转录组信息，属于单细胞测序技术领域。所述试剂盒包括带有细胞标签1的转座酶和反转录引物、带有细胞标签2的第一杂交引物、带有细胞标签3的第二杂交引物和第三杂交引物及多种酶试剂；所述方法包括酶切、逆转录、末端转移酶加尾、连接、修复及扩增文库等步骤。本发明基于带有不同细胞标记序列的转座酶，带有不同细胞标签的随机引物、连接引物和杂交引物，实现上亿种分子标记来标记单个细胞，并对其进行超高通量的转录组和基因组可及性测序，具有重要的应用推广价值。
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公开(公告)号：CN118272508B
公开(公告)日：2024-11-08
申请号：CN202410368301.3
申请日：2023-06-28
Applicant: 浙江大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒及其应用，属于单细胞测序技术领域。所述试剂盒包括：连接有特殊定制序列的转座酶，所述特殊定制序列为双链序列，分别为第一链序列和第二链序列，其中第一链序列依次包括连接序列1、细胞标签1序列和包埋序列，其中第二链序列为包埋序列的互补序列；第一杂交引物，依次包括连接序列2、细胞标签2序列和测序接头1序列；桥连引物，用于将连接序列1和连接序列2进行连接；第二杂交引物，依次包括所述包埋序列的互补序列、分子标签序列、至少一部分所述连接序列1的互补序列和测序接头2。本发明的试剂盒生方法能够实现上亿种分子标记来标记单个细胞，达到超高通量，并且建库时间大幅缩短，属于快速单细胞基因组测序方法。
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公开(公告)号：CN116515977B
公开(公告)日：2024-04-16
申请号：CN202310774780.4
申请日：2023-06-28
Applicant: 浙江大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒和方法，属于单细胞测序技术领域。所述试剂盒包括：连接有特殊定制序列的转座酶，所述特殊定制序列为双链序列，分别为第一链序列和第二链序列，其中第一链序列依次包括连接序列1、细胞标签1序列和包埋序列，其中第二链序列为包埋序列的互补序列；第一杂交引物，依次包括连接序列2、细胞标签2序列和测序接头1序列；桥连引物，用于将连接序列1和连接序列2进行连接；第二杂交引物，依次包括所述包埋序列的互补序列、分子标签序列、至少一部分所述连接序列1的互补序列和测序接头2。本发明的试剂盒生方法能够实现上亿种分子标记来标记单个细胞，达到超高通量，并且建库时间大幅缩短，属于快速单细胞基因组测序方法。
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公开(公告)号：CN113106150B
公开(公告)日：2022-05-24
申请号：CN202110517750.6
申请日：2021-05-12
Applicant: 浙江大学
IPC: C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种超高通量单细胞测序方法，本发明超高通量单细胞测序方法通过分子标记微珠、反转录序列、桥连引物的使用，先使用反转录序列对细胞内进行一次细胞内反转录，再将经细胞内反转录后的细胞通过微孔板技术或微流控技术使一个分子标记微珠与一个或多个细胞处于分隔的空间中，并在裂解液作用下裂解细胞，反转录后得到的序列在桥连引物的帮助下与分子标记微珠上的分子标记序列连接，并通过PCR扩增获得大量序列，构建获得cDNA测序文库，然后进行高通量测序，一次测序便可以获得上百万个单细胞的特异性转录组信息。大大提高了单细胞测序的通量。
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公开(公告)号：CN106399248B
公开(公告)日：2020-01-14
申请号：CN201610871283.6
申请日：2016-09-30
Applicant: 浙江大学
Abstract: 本发明公开了一种诱导成纤维细胞转分化为神经细胞的方法，步骤如下：(1)培养成纤维细胞20～30h；(2)将细胞转移到含诱导小分子组合6TCF的培养基中继续培养6～8天，期间每2～4天更换一次培养基；(3)将细胞再转移到含诱导小分子组合6TCF和8CFV的培养基中继续7～16天，期间每2～4天更换一次培养基，获得神经细胞；其中，6为E616452、T为苯环丙胺、C为CHIR99021、F为毛喉素、8为A‑83‑01、V为丙戊酸。本发明通过在培养基中添加诱导小分子组合，能够将成纤维细胞诱导转分化为神经细胞，所得神经细胞具有正常神经细胞的特异性分子标签，并且具有正常神经细胞的功能，为再生医学的细胞来源问题提供一种新的途径。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN118272508A
公开(公告)日：2024-07-02
申请号：CN202410368301.3
申请日：2023-06-28
Applicant: 浙江大学
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于单端接头转座酶的单细胞基因组测序试剂盒及其应用，属于单细胞测序技术领域。所述试剂盒包括：连接有特殊定制序列的转座酶，所述特殊定制序列为双链序列，分别为第一链序列和第二链序列，其中第一链序列依次包括连接序列1、细胞标签1序列和包埋序列，其中第二链序列为包埋序列的互补序列；第一杂交引物，依次包括连接序列2、细胞标签2序列和测序接头1序列；桥连引物，用于将连接序列1和连接序列2进行连接；第二杂交引物，依次包括所述包埋序列的互补序列、分子标签序列、至少一部分所述连接序列1的互补序列和测序接头2。本发明的试剂盒生方法能够实现上亿种分子标记来标记单个细胞，达到超高通量，并且建库时间大幅缩短，属于快速单细胞基因组测序方法。
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公开(公告)号：CN118222686A
公开(公告)日：2024-06-21
申请号：CN202410534391.9
申请日：2024-04-30
Applicant: 浙江大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/686
Abstract: 本发明公开了一种转录组和基因组可及性双模态测序试剂盒和方法，能同时分析一个细胞中的染色体开放区域基因组信息和转录组信息，属于单细胞测序技术领域。所述试剂盒包括带有细胞标签1的转座酶和反转录引物、带有细胞标签2的第一杂交引物、带有细胞标签3的第二杂交引物和第三杂交引物及多种酶试剂；所述方法包括酶切、逆转录、末端转移酶加尾、连接、修复及扩增文库等步骤。本发明基于带有不同细胞标记序列的转座酶，带有不同细胞标签的随机引物、连接引物和杂交引物，实现上亿种分子标记来标记单个细胞，并对其进行超高通量的转录组和基因组可及性测序，具有重要的应用推广价值。
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公开(公告)号：CN114958996A
公开(公告)日：2022-08-30
申请号：CN202210590187.X
申请日：2021-05-12
Applicant: 浙江大学
IPC: C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种超高通量单细胞测序试剂组合，利用本发明超高通量单细胞测序试剂组合，通过分子标记微珠、反转录序列、桥连引物的使用，先使用反转录序列对细胞内进行一次细胞内反转录，再将经细胞内反转录后的细胞通过微孔板技术或微流控技术使一个分子标记微珠与一个或多个细胞处于分隔的空间中，并在裂解液作用下裂解细胞，反转录后得到的序列在桥连引物的帮助下与分子标记微珠上的分子标记序列连接，并通过PCR扩增获得大量序列，构建获得cDNA测序文库，然后进行高通量测序，一次测序便可以获得上百万个单细胞的特异性转录组信息。大大提高了单细胞测序的通量。
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公开(公告)号：CN118692590B
公开(公告)日：2024-12-27
申请号：CN202410991441.6
申请日：2024-07-23
Applicant: 浙江大学
IPC: G16C20/30 , G16C20/70 , G16B20/00 , G16B25/00 , G16B50/10 , G16B40/00 , G06N3/045 , G06N3/047 , G06N3/0475 , G06N3/08
Abstract: 本申请公开了一种基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法、介质及设备，涉及单细胞转录组数据分析领域。构建包含多种癌症类型的癌症组织、对应的癌旁组织以及来源于正常人体对应组织的单细胞泛肿瘤转录组图谱，有助于发现跨不同癌症类型的共同药物靶点；通过重新分群注释，能够精确区分不同细胞类型，特别是恶性细胞与正常细胞之间的差异，有助于发现针对特定细胞类型的药物；基于单细胞泛肿瘤转录组图谱，结合预处理后的细胞扰动数据矩阵，训练深度学习模型，实现了对药物处理下细胞响应的精准预测，能够快速识别泛肿瘤药物及肿瘤特异性药物，发现已上市药物和候选药物的新适应症，评估药物的副作用，发现药物的潜在作用机制。
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公开(公告)号：CN118272509A
公开(公告)日：2024-07-02
申请号：CN202410368940.X
申请日：2024-03-28
Applicant: 浙江大学
IPC: C12Q1/6869 , G01N33/53
Abstract: 本发明公开了一种基于组合索引的单细胞DNA‑蛋白互作测序试剂盒和方法，属于单细胞测序技术领域。本发明的试剂盒利用多种不同的细胞标签1序列的链球菌蛋白G偶联转座酶包埋复合物对细胞核内目标蛋白附近的DNA带上第一轮分子标记；再利用两轮杂交反应和一轮PCR反应，使得细胞带上共四轮分子标签，单次实验能够标记上百种目标蛋白并获得上亿种分子标记，达到超高通量。本发明的试剂盒和方法能够实现单次实验中检测多种不同蛋白与基因组DNA互作的位点，再通过4轮标签标记，可获得上亿个细胞的目标蛋白与基因组DNA的互作信息并且建库时间大幅缩短，实现快速单细胞DNA‑蛋白互作测序。
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