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发明公开
一种Bulk转录组数据增强空间基因表达分辨率的方法审中-实审

公开(公告)号：CN118737275A

公开(公告)日：2024-10-01

申请号：CN202410773192.3

申请日：2024-06-17

申请人： 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心

发明人： 廖杰 , 沈敏杰 , 程涛 , 董洋 , 吕天航

IPC分类号： G16B25/00 , G16B30/00 , G16B35/20 , G16B40/30 , G06F18/23

摘要： 本发明提供了一种Bulk转录组数据增强空间基因表达分辨率的方法，涉及生物信息技术领域，该方法分三步实施：首先，整合与优化数据输入，涉及Bulk与空间转录组数据的预处理、共同高度表达基因的选择以及通过MuSiC软件进行的解卷积操作，产出基因在空间聚类上的丰度矩阵。其次，通过构建“伪Bulk”基因表达矩阵并与实际Bulk数据对比，调整空间转录组的表达估算，此过程利用变量因子矩阵实现精确调整。相比现有技术，本发明显著增强了空间基因表达的解析能力，为生物医学研究提供了强大的工具，促进了对复杂组织结构中基因表达模式的深入理解。