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公开(公告)号：CN118447502A
公开(公告)日：2024-08-06
申请号：CN202410896593.8
申请日：2024-07-05
申请人： 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
IPC分类号： G06V20/69 , G06V10/30 , G06V10/44 , G06V10/26 , G06V10/52 , G06V10/764 , G06V10/82 , G06N3/0455 , G06N3/0464 , G06N3/08 , G06T7/00 , G06T7/13 , G06T7/62 , G06T5/70 , G06T5/90
摘要： 本发明提供了单细胞轮廓识别与提取的方法、系统、设备及存储介质，属于图像处理技术领域。所述的方法包括如下步骤：S1、采集图像；S2、图像数据增强；S3、U‑net分割；S4、细胞外轮廓识别；S5、剔除干扰；S6、保留分散的单细胞；S7、单细胞编号。本发明提供的方法通过输入染色后的组织切片，经过深度学习模型进行实例分割，识别组织中的单细胞，并进行编号，标注每个细胞的轮廓，去除重叠在一起的细胞，仅保留分散的单个细胞，从而实现单细胞轮廓的自动化提取输出。本发明提供的方法能够提高组织切片中单细胞识别的准确率和效率，为后续实验方法的开发提供强大的工具。
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公开(公告)号：CN118925623A
公开(公告)日：2024-11-12
申请号：CN202411333729.0
申请日：2024-09-24
申请人： 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
摘要： 本发明公开了一种用于多通道浓度或粒径梯度水凝胶微球的微流控器件及应用。本发明所述微流控器件包括两个水相入口、一个油相入口、八个流动聚焦液滴生成十字微管道和八个出口；基于所述微流控器件，本发明还提供多通道浓度梯度或粒径梯度水凝胶微球的制备方法。本发明在以微流控技术生产水凝胶微球的基础上设计的微流控器件结构，用于同时生成不同载药浓度或粒径梯度的水凝胶微球，提升了生产效率及浓度可控性，为研究药物作用浓度提供更便捷的生产工具。
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公开(公告)号：CN118658535A
公开(公告)日：2024-09-17
申请号：CN202411133882.9
申请日：2024-08-19
申请人： 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
摘要： 本发明公开了一种基于脑组织空间转录组图谱的可视化方法，涉及空间转录组信息展示领域，其技术方案要点是获取脑组织，确定脑组织的脑区分布并切片；通过激光捕获显微切割技术和空间条形码技术进行细胞转录组测序，并构建数据库，所述数据库包括通过空间转录组图谱呈现的基因信息、脑区信息、标记基因信息、通路富集信息、基因表达谱信息和切片信息；构建与数据库链接的检索页面，通过检索页面以基因、脑区和切片中的任意一种为检索条目进行对数据库的检索，便于研究人员从多个角度快速检索到所需的数据。通过空间转录组图谱，数据库返回的检索结果得以通过3D可视化的形式进行展示。
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公开(公告)号：CN118658535B
公开(公告)日：2024-11-01
申请号：CN202411133882.9
申请日：2024-08-19
申请人： 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
摘要： 本发明公开了一种基于脑组织空间转录组图谱的可视化方法，涉及空间转录组信息展示领域，其技术方案要点是获取脑组织，确定脑组织的脑区分布并切片；通过激光捕获显微切割技术和空间条形码技术进行细胞转录组测序，并构建数据库，所述数据库包括通过空间转录组图谱呈现的基因信息、脑区信息、标记基因信息、通路富集信息、基因表达谱信息和切片信息；构建与数据库链接的检索页面，通过检索页面以基因、脑区和切片中的任意一种为检索条目进行对数据库的检索，便于研究人员从多个角度快速检索到所需的数据。通过空间转录组图谱，数据库返回的检索结果得以通过3D可视化的形式进行展示。
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公开(公告)号：CN118737275A
公开(公告)日：2024-10-01
申请号：CN202410773192.3
申请日：2024-06-17
申请人： 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
摘要： 本发明提供了一种Bulk转录组数据增强空间基因表达分辨率的方法，涉及生物信息技术领域，该方法分三步实施：首先，整合与优化数据输入，涉及Bulk与空间转录组数据的预处理、共同高度表达基因的选择以及通过MuSiC软件进行的解卷积操作，产出基因在空间聚类上的丰度矩阵。其次，通过构建“伪Bulk”基因表达矩阵并与实际Bulk数据对比，调整空间转录组的表达估算，此过程利用变量因子矩阵实现精确调整。相比现有技术，本发明显著增强了空间基因表达的解析能力，为生物医学研究提供了强大的工具，促进了对复杂组织结构中基因表达模式的深入理解。
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公开(公告)号：CN118109286A
公开(公告)日：2024-05-31
申请号：CN202410258321.5
申请日：2024-03-07
申请人： 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
摘要： 本发明涉及DNA条形码序列合成技术领域，具体涉及一种DNA条形码序列合成仪、控制系统及合成方法，控制系统，包括设备管理模块、工作流管理模块、数据与管理模块、故障与管理模块、软件平台、LIMS‑API模块、调度与引擎模块、应用模块，合成仪包括存储器、处理器、机械手、封撕膜一体机、PCR仪、离心机、磁力震荡机、液体工作站、声波移液系统、移液站、摇匀器、涡旋仪、开关盖机、洗板机、孵育仪、过滤器，以及采用上述合成仪的合成方法，本发明的有益效果为，实现了DNA条形码序列的自动化合成，提高了合成效率。
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