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公开(公告)号：CN105714383A
公开(公告)日：2016-06-29
申请号：CN201510971452.9
申请日：2015-12-22
Applicant: 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于分子反向探针的测序文库构建方法和试剂，该方法包括：用分子反向探针与变性核酸进行退火杂交，分子反向探针包括5’端的锚定序列和3’端的延伸序列以及二者之间的测序接头序列，锚定序列和延伸序列分别与变性核酸中的目标区域两端的序列反向互补；以目标区域为模板，从3’端的延伸序列开始进行聚合反应，生成目标区域的互补序列；将5’端的锚定序列与目标区域的互补序列连接形成环状核酸分子；使用核酸外切酶消化未环化的线性分子，得到含有目标区域的单链环状分子。将得到的单链环状分子进行测序，从而实现对目标区域捕获测序。本发明的方法实现将单链环状文库构建和目标区域捕获融为一体，从而大大缩减建库流程和周期。
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公开(公告)号：CN105714383B
公开(公告)日：2018-01-23
申请号：CN201510971452.9
申请日：2015-12-22
Applicant: 深圳华大基因研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
IPC: C40B50/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于分子反向探针的测序文库构建方法和试剂，该方法包括：用分子反向探针与变性核酸进行退火杂交，分子反向探针包括5’端的锚定序列和3’端的延伸序列以及二者之间的测序接头序列，锚定序列和延伸序列分别与变性核酸中的目标区域两端的序列反向互补；以目标区域为模板，从3’端的延伸序列开始进行聚合反应，生成目标区域的互补序列；将5’端的锚定序列与目标区域的互补序列连接形成环状核酸分子；使用核酸外切酶消化未环化的线性分子，得到含有目标区域的单链环状分子。将得到的单链环状分子进行测序，从而实现对目标区域捕获测序。本发明的方法实现将单链环状文库构建和目标区域捕获融为一体，从而大大缩减建库流程和周期。
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公开(公告)号：CN106661575A
公开(公告)日：2017-05-10
申请号：CN201480081525.0
申请日：2014-10-14
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 提供了一种接头元件和使用该接头元件构建测序文库的方法，所述接头元件由接头A和接头B组成；接头A由一条核酸长链与一条核酸短链互补配对而成，长链5’端具有磷酸修饰，短链3’端为封闭修饰，短链中具有酶作用位点；接头B为一条核酸单链，其3’端能与接头A长链5’端互补配对。使用本发明的接头元件构建测序文库时，在保证接头连接方向性的同时，解决了片段互连、接头自连、连接效率低的问题，减少了步骤间的纯化反应，缩短了连接时间，降低了成本。
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公开(公告)号：CN107075731A
公开(公告)日：2017-08-18
申请号：CN201480081852.6
申请日：2014-10-14
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明提供了一种核酸单链环状文库的构建方法和试剂。所述方法包括：使用转座酶包埋复合体随机打断核酸并连接第一接头；在缺口处连接第二接头；进行第一PCR反应，其中一条引物5’端具有第一亲和标记，得到两端连接不同接头序列的产物；将产物与具有第二亲和标记的固相载体结合；变性，分离无亲和标记的单链；对单链进行环化。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN106715713A
公开(公告)日：2017-05-24
申请号：CN201480081856.4
申请日：2014-09-12
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 提供了一种试剂盒、一种基于双链DNA制备环状双链DNA的方法、一种制备双链核酸融合分子的方法、一种基于双链DNA片段构建测序文库的方法、一种核酸测序方法、一种基于双链DNA制备环状双链DNA的装置、一种基于双链DNA片段构建测序文库的设备以及一种核酸测序系统。
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公开(公告)号：CN104834833A
公开(公告)日：2015-08-12
申请号：CN201410048518.2
申请日：2014-02-12
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种单核苷酸多态性SNP的检测方法及装置，包括获取含有核酸序列信息的读段序列；将读段序列与参考序列进行比对，获取比对上的读段序列；将比对上的读段序列按照碱基序列5’端比对位置划分为不同的冗余读段序列组；对不同冗余读段序列组中的每个冗余读段序列组中的每个读段序列进行计分，依据读段序列的得分从一个冗余读段序列组中得到一个代表读段序列组；判断代表读段序列组是否存在支持假阴性SNP的读段序列；若判断结果为是，则从代表读段序列组中去除支持假阴性SNP的代表读段序列，获得不支持假阴性SNP的代表读段序列组；对不支持假阴性SNP的代表读段序列组进行SNP检测。通过本发明提供的SNP检测方法，可以提高测序分析结果准确率。
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公开(公告)号：CN107075513A
公开(公告)日：2017-08-18
申请号：CN201480081861.5
申请日：2014-09-12
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 提供了分离的寡核苷酸及其在核酸测序中的用途，该分离的寡核苷酸包括：第一链，所述第一链的5’末端核苷酸具有磷酸基团，并且所述第一链的3’末端核苷酸为双脱氧核苷酸；以及第二链，所述第二链的5’末端核苷酸不具有磷酸基团，并且所述第二链的3’末端核苷酸为双脱氧核苷酸，其中，所述第一链的长度大于所述第二链的长度，并且所述第一链和所述第二链之间形成双链结构。
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公开(公告)号：CN107075512A
公开(公告)日：2017-08-18
申请号：CN201480081517.6
申请日：2014-10-14
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 提供了一种接头元件和使用该接头元件构建测序文库的方法，所述接头元件由接头A和接头B组成；接头A由一条核酸长链与一条核酸短链互补配对而成，长链5’端具有磷酸修饰，短链3’端为封闭修饰，短链中具有酶作用位点；接头B为一条核酸单链，其3’端能与接头A长链5’端互补配对；所述接头A的长链和接头B中具有II型限制性内切酶识别位点。使用本发明的接头元件构建测序文库时，在保证接头连接方向性的同时，解决了片段互连、接头自连、连接效率低的问题，减少了步骤间的纯化反应，缩短了连接时间，降低了成本。
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公开(公告)号：CN104834833B
公开(公告)日：2017-12-05
申请号：CN201410048518.2
申请日：2014-02-12
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种单核苷酸多态性SNP的检测方法及装置，包括获取含有核酸序列信息的读段序列；将读段序列与参考序列进行比对，获取比对上的读段序列；将比对上的读段序列按照碱基序列5’端比对位置划分为不同的冗余读段序列组；对不同冗余读段序列组中的每个冗余读段序列组中的每个读段序列进行计分，依据读段序列的得分从一个冗余读段序列组中得到一个代表读段序列组；判断代表读段序列组是否存在支持假阴性SNP的读段序列；若判断结果为是，则从代表读段序列组中去除支持假阴性SNP的代表读段序列，获得不支持假阴性SNP的代表读段序列组；对不支持假阴性SNP的代表读段序列组进行SNP检测。通过本发明提供的SNP检测方法，可以提高测序分析结果准确率。
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