一种基于多重PCR的目标区域富集方法和试剂

    公开(公告)号:CN107002080A

    公开(公告)日:2017-08-01

    申请号:CN201580068010.1

    申请日:2015-12-09

    IPC分类号: C12N15/11

    摘要: 提供一种基于多重PCR的目标区域富集方法和试剂,该方法包括:在含待富集目标区域的核酸片段两端分别连接第一接头和第二接头,得到接头连接产物;使用特异性结合第一接头的第一引物和特异性结合第二接头的第二引物,对接头连接产物进行PCR扩增,得到扩增产物,其中第一引物或第二引物具有第一亲和标记;通过固相载体捕获扩增产物中带有第一亲和标记的单链;以捕获的单链为模板,使用第三引物进行单引物线性扩增;以线性扩增产物为模板,使用第三引物和第一引物进行指数扩增,得到包含目标区域的产物。

    一种基于分子反向探针的测序文库构建方法和试剂

    公开(公告)号:CN105714383A

    公开(公告)日:2016-06-29

    申请号:CN201510971452.9

    申请日:2015-12-22

    IPC分类号: C40B50/06 C12Q1/68

    摘要: 本发明公开了一种基于分子反向探针的测序文库构建方法和试剂,该方法包括:用分子反向探针与变性核酸进行退火杂交,分子反向探针包括5’端的锚定序列和3’端的延伸序列以及二者之间的测序接头序列,锚定序列和延伸序列分别与变性核酸中的目标区域两端的序列反向互补;以目标区域为模板,从3’端的延伸序列开始进行聚合反应,生成目标区域的互补序列;将5’端的锚定序列与目标区域的互补序列连接形成环状核酸分子;使用核酸外切酶消化未环化的线性分子,得到含有目标区域的单链环状分子。将得到的单链环状分子进行测序,从而实现对目标区域捕获测序。本发明的方法实现将单链环状文库构建和目标区域捕获融为一体,从而大大缩减建库流程和周期。

    一种基于分子反向探针的测序文库构建方法和试剂

    公开(公告)号:CN105714383B

    公开(公告)日:2018-01-23

    申请号:CN201510971452.9

    申请日:2015-12-22

    IPC分类号: C40B50/06 C12Q1/6869

    摘要: 本发明公开了一种基于分子反向探针的测序文库构建方法和试剂,该方法包括:用分子反向探针与变性核酸进行退火杂交,分子反向探针包括5’端的锚定序列和3’端的延伸序列以及二者之间的测序接头序列,锚定序列和延伸序列分别与变性核酸中的目标区域两端的序列反向互补;以目标区域为模板,从3’端的延伸序列开始进行聚合反应,生成目标区域的互补序列;将5’端的锚定序列与目标区域的互补序列连接形成环状核酸分子;使用核酸外切酶消化未环化的线性分子,得到含有目标区域的单链环状分子。将得到的单链环状分子进行测序,从而实现对目标区域捕获测序。本发明的方法实现将单链环状文库构建和目标区域捕获融为一体,从而大大缩减建库流程和周期。

    一种锚定巢式多重PCR富集DNA目标区域的方法和试剂盒

    公开(公告)号:CN106192018A

    公开(公告)日:2016-12-07

    申请号:CN201510229173.5

    申请日:2015-05-07

    IPC分类号: C40B50/06 C40B40/06

    摘要: 本发明公开了一种锚定巢式多重PCR富集DNA目标区域的方法和试剂盒,该方法包括:将DNA进行末端修复和接头序列的连接,其中接头序列包括互补的长序列和短序列,长序列在靠近连接端处与短序列互补,其它部分中包含一段标签序列;对连接产物进行第一轮多重PCR反应,其中上游引物为其至少一部分与标签序列相同的锚定引物,下游引物包括多条特异性结合到目标区域上的序列;对第一轮多重PCR反应得到的产物进行第二轮多重PCR反应,其中上游引物为锚定引物,下游引物包括多条5’-端具有测序引物序列、3’-端特异性结合到目标区域上的序列,最后得到目标区域文库。本发明的方法具有快速、低成本和高通量的特点。