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公开(公告)号：CN103184216A
公开(公告)日：2013-07-03
申请号：CN201110444740.0
申请日：2011-12-27
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
Abstract: 本发明涉及用于扩增免疫球蛋白重链CDR3编码序列的引物组合物，富集免疫球蛋白重链CDR3编码序列的方法，构建免疫球蛋白重链CDR3编码序列的测序文库的方法，确定免疫球蛋白重链CDR3编码序列的序列信息的方法，确定个体免疫状态的方法，确定个体免疫状态的系统。该引物组合物包括第一引物组，所述第一引物组由至少一种V区引物组成，所述至少一种V区引物的每一种均包含与至少一个V基因片段互补的序列；以及第二引物组，所述第二引物组由至少一种J区引物组成，所述至少一种J区引物的每一种均包含与至少一个J基因片段互补的序列。利用该引物组合物，能够有效地对免疫球蛋白重链CDR3编码序列进行富集，从而为对CDR3进行深入研究提供了便利的工具。
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公开(公告)号：CN103184216B
公开(公告)日：2015-03-18
申请号：CN201110444740.0
申请日：2011-12-27
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司 , 深圳华大基因研究院
Abstract: 本发明涉及用于扩增免疫球蛋白重链CDR3编码序列的引物组合物，富集免疫球蛋白重链CDR3编码序列的方法，构建免疫球蛋白重链CDR3编码序列的测序文库的方法，确定免疫球蛋白重链CDR3编码序列的序列信息的方法，确定个体免疫状态的方法，确定个体免疫状态的系统。该引物组合物包括第一引物组，所述第一引物组由至少一种V区引物组成，所述至少一种V区引物的每一种均包含与至少一个V基因片段互补的序列；以及第二引物组，所述第二引物组由至少一种J区引物组成，所述至少一种J区引物的每一种均包含与至少一个J基因片段互补的序列。利用该引物组合物，能够有效地对免疫球蛋白重链CDR3编码序列进行富集，从而为对CDR3进行深入研究提供了便利的工具。
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公开(公告)号：CN105506746A
公开(公告)日：2016-04-20
申请号：CN201410485822.3
申请日：2014-09-22
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明提出了一种构建可变区测序文库的方法及确定可变区核酸序列的方法，其中，构建可变区测序文库的方法包括：以含有编码所述可变区的核酸样本作为模板，扩增编码所述可变区的核酸，以便获得第一扩增产物；在所述第一扩增产物的两个末端至少之一添加测序接头，以便获得所述可变区测序文库，其中，所述扩增采用下列引物：第一引物，所述第一引物包括至少一个特异性识别V区的框架区编码序列的核酸分子；以及第二引物，所述第二引物包括至少一个特异性识别J区或C区编码序列的核酸分子。利用该方法，能够有效地构建可变区测序文库。
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公开(公告)号：CN106557667A
公开(公告)日：2017-04-05
申请号：CN201510629695.4
申请日：2015-09-28
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种评价疫苗免疫效果的系统，该系统包括：序列提供装置、参数确定装置和疫苗免疫效果判断装置，其中，所述疫苗免疫效果判断装置被设置为当满足选自下列条件的至少之一时，判定所述疫苗免疫效果好：(1)相对于免疫前，免疫后样本的TCR/BCR的CDR3编码序列克隆种类数目降低；(2)相对于免疫前，免疫后样本的多态性值显著降低；(3)相对于免疫前，免疫后样本的高频扩增克隆的数目增加，并且所有高频扩增克隆的丰度和显著增加；(4)当CDR3编码序列来自BCR时，相对于免疫前，免疫后样本的碱基突变率上升。利用该系统能够快速、准确地评价疫苗的免疫效果。
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公开(公告)号：CN105331680A
公开(公告)日：2016-02-17
申请号：CN201410405146.4
申请日：2014-08-15
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明提供了确定可变区扩增引物是否存在偏向性的方法和装置及其应用，所述方法包括：(1)利用通用引物组对含有可变区的核酸样本进行多重PCR扩增，以便获得所述第一扩增产物；(2)对所述第一扩增产物进行第一测序，以便获得所述第一测序结果；(3)利用候选引物组对所述第一扩增产物进行多重PCR扩增，以便获得第二扩增产物；(4)对所述第二扩增产物进行第二测序，以便获得第二测序结果；以及(5)将所述第二测序结果与第一测序结果进行比较，以便确定所述候选引物组是否存在偏向性。利用本发明的该方法，可以有效地确定不同引物之间扩增的偏向性，且获得的偏向性结果真实可靠。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN106557667B
公开(公告)日：2019-03-26
申请号：CN201510629695.4
申请日：2015-09-28
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种评价疫苗免疫效果的系统，该系统包括：序列提供装置、参数确定装置和疫苗免疫效果判断装置，其中，所述疫苗免疫效果判断装置被设置为当满足选自下列条件的至少之一时，判定所述疫苗免疫效果好：(1)相对于免疫前，免疫后样本的TCR/BCR的CDR3编码序列克隆种类数目降低；(2)相对于免疫前，免疫后样本的多态性值显著降低；(3)相对于免疫前，免疫后样本的高频扩增克隆的数目增加，并且所有高频扩增克隆的丰度和显著增加；(4)当CDR3编码序列来自BCR时，相对于免疫前，免疫后样本的碱基突变率上升。利用该系统能够快速、准确地评价疫苗的免疫效果。
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公开(公告)号：CN105331680B
公开(公告)日：2018-09-14
申请号：CN201410405146.4
申请日：2014-08-15
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
Abstract: 本发明提供了确定可变区扩增引物是否存在偏向性的方法和装置及其应用，所述方法包括：(1)利用通用引物组对含有可变区的核酸样本进行多重PCR扩增，以便获得所述第一扩增产物；(2)对所述第一扩增产物进行第一测序，以便获得所述第一测序结果；(3)利用候选引物组对所述第一扩增产物进行多重PCR扩增，以便获得第二扩增产物；(4)对所述第二扩增产物进行第二测序，以便获得第二测序结果；以及(5)将所述第二测序结果与第一测序结果进行比较，以便确定所述候选引物组是否存在偏向性。利用本发明的该方法，可以有效地确定不同引物之间扩增的偏向性，且获得的偏向性结果真实可靠。
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公开(公告)号：CN106661629B
公开(公告)日：2021-03-16
申请号：CN201580042224.1
申请日：2015-08-06
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6844 , C12Q1/6811 , G01N27/62 , C12M1/34
Abstract: 本发明提供了筛选纳米抗体的方法及相应的系统，所述方法采用聚合酶链式反应和cDNA 5’末端快速扩增技术，筛选获得纳米抗体，实验周期只需21天左右。
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公开(公告)号：CN204079981U
公开(公告)日：2015-01-07
申请号：CN201420425293.3
申请日：2014-07-30
Applicant: 深圳华大基因科技有限公司
IPC: C12M1/34
Abstract: 本实用新型属于生物化学检测工具领域，提供了一种试剂盒，用于检测免疫球蛋白重链的V-J重排和免疫球蛋白重链CDR3的编码序列，其包括：用于识别免疫球蛋白重链家族中V基因片段并引导进行聚合酶链式反应的第一引物试剂管组，其包括至少一支装有引物的第一引物试剂管；用于识别免疫球蛋白重链家族中J基因片段并引导进行聚合酶链式反应的第二引物试剂管组，其包括至少一支装有引物的第二引物试剂管；设有第一盒腔及第二盒腔的盒体；用于固定引物试剂管组的第一、第二固定架；第一引物试剂管组及第一固定架设于第一盒腔内，第二引物试剂管组及第二固定架设于第二盒腔内。该试剂盒便于检测试验的操作，可提高检测的准确度及效率。
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