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公开(公告)号:CN107002153B
公开(公告)日:2020-10-27
申请号:CN201680003838.3
申请日:2016-01-13
申请人: 深圳华大生命科学研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12N15/10 , C12M1/00 , C40B50/06 , C40B60/14
摘要: 本发明提供了一种构建长片段测序文库的方法。本发明提供的方法包括如下步骤:1)制备含有单链DNA的5184孔板;2)将所述单链DNA等量分装到5184孔板每个孔中;3)将全基因组扩增反应体系分装到步骤2)处理后的5184孔板每个孔中,反应;4)将片段化反应液分装到步骤3)处理的5184孔板每个孔中,反应;5)将步骤4)处理后的5184孔板每个孔中的核酸分子添加不同标签序列,即得到测序文库。
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公开(公告)号:CN107250447B
公开(公告)日:2020-05-05
申请号:CN201680012412.4
申请日:2016-04-14
申请人: 深圳华大生命科学研究院 , 深圳华大基因科技有限公司
摘要: 提供了一种长片段DNA文库构建方法,包括如下步骤:1)通过转座酶使长片段DNA断开为大小为3‑10kb的目的片段,再扩增所述目的片段,得到含有dUTP的目的片段扩增产物;2)通过去除所述目的片段扩增产物中的dUTP,使所述目的片段二次片段化为300‑1200bp DNA短片段;3)在所述DNA短片段两端分别连接测序接头单链A和测序接头单链B;得到连接测序接头产物;4)PCR扩增所述连接测序接头产物,得到扩增产物。
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公开(公告)号:CN113039283A
公开(公告)日:2021-06-25
申请号:CN201880099543.X
申请日:2018-12-12
申请人: 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12Q1/6813 , G01N33/487
摘要: 一种分离和/或富集宿主源核酸和病原核酸的方法和试剂及其制备方法。所述方法包括选自如下(a)或(b)的步骤:(a)将固定在固相载体上的宿主源探针与含有宿主源核酸和病原核酸的液体样品混合孵育,使宿主源探针与宿主源核酸杂交;进行固液分离得到结合在固相载体上的宿主源核酸和保留在液体样品中的病原核酸;(b)将宿主源探针、固定在固相载体上的病原探针与含有宿主源核酸和病原核酸的液体样品混合孵育,使宿主源探针与宿主源核酸杂交、病原探针与病原核酸杂交;进行固液分离得到结合在固相载体上的病原核酸和保留在液体样品中的宿主源核酸。该方法使用宿主源探针特异性捕获宿主源核酸,通过分离宿主源核酸来实现病原核酸的富集。
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公开(公告)号:CN112639094A
公开(公告)日:2021-04-09
申请号:CN201980046212.4
申请日:2019-05-07
申请人: 深圳华大智造科技股份有限公司 , 深圳华大生命科学研究院
发明人: 拉多吉·T·德尔马纳茨 , 布罗克·A·彼得斯 , 王欧
摘要: 本发明描述了用于制备核酸测序文库的方法和组合物,所述方法包括:(a)将插入序列转座入靶核酸的第一片段,其中所述插入序列包含杂交序列,并且其中所述转座在所述第一片段中产生切口;(b)将(i)来自(a)的所述靶核酸的所述第一片段、(ii)夹板寡核苷酸和(iii)珠粒群体合并成单个混合物,其中每个珠粒包含固定在其上的捕获寡核苷酸,和(c)将单个珠粒的捕获寡核苷酸连接到单个第一片段的插入的杂交序列。
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公开(公告)号:CN117377776A
公开(公告)日:2024-01-09
申请号:CN202180098529.X
申请日:2021-05-28
申请人: 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号: C12Q1/6851
摘要: 一种基于电浸润的CRISPR的核酸检测系统及其方法。所述核酸检测系统包括:电浸润芯片模块、CRISPR反应模块、信号捕获模块和控制与分析模块;其中:所述电浸润芯片模块包括:试剂储存区、生化反应区、荧光拍照区和驱动系统,以及各区之间的微通道;所述CRISPR反应模块包括:含有荧光探针的CRISPR反应液、含有Cas12a的蛋白反应液和含有gRNA的gRNA反应液;所述蛋白反应液、gRNA反应液和CRISPR反应液均包含表面活性剂和酶缓冲液。
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公开(公告)号:CN113166809B
公开(公告)日:2023-12-26
申请号:CN201980076223.7
申请日:2019-12-23
申请人: 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号: C12Q1/6869 , C12Q1/6806
摘要: 本申请提供了一种DNA甲基化检测的方法,包括长片段DNA处理步骤,将长片段DNA打断;常规文库构建步骤,用stLFR技术建库;双链保护步骤,取回收的stLFR文库,DNA变性,用退火或延伸方法将分子标签或接头序列转化为双链;重亚硫酸盐转化步骤,加入双链保护剂和重亚硫酸盐,进行脱氨基;甲基化测序文库构建步骤,对脱氨基产物进行常规PCR或环化后滚环扩增,得到甲基化测序文库;甲基化测序步骤,对甲基化测序文库测序,根据测序结果分析基因的甲基化信息;本申请还提供了相应试剂盒、装置和应用。本申请方法利用stLFR技术,获得长片段甲基化信息;通过双链保护策略,可事先加入分子标签序列建库,可有效追踪分子来源。
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公开(公告)号:CN118421767A
公开(公告)日:2024-08-02
申请号:CN202310130564.6
申请日:2023-02-01
申请人: 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号: C12Q1/6869 , C12Q1/6883
摘要: 本申请提出了一种基于DNA纳米球(DNB)的多重测序方法,涉及基因测序技术领域,所述方法包括:对DNB进行第一测序,其中第一测序引物与所述DNB结合并在所述第一测序过程中生成第一测序链;将所述第一测序链洗脱;和使用所述第一测序引物对所述DNB进行第二测序。本申请提出的基于DNB的多重测序方法操作简单并且能够有效提升DNB测序的准确度。
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公开(公告)号:CN118355114A
公开(公告)日:2024-07-16
申请号:CN202180104689.0
申请日:2021-12-31
申请人: 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号: C12N9/14 , C12N15/55 , C12M1/34 , C12Q1/6869 , G01N33/48
摘要: 本发明提供一种解旋酶BCH2X,其包含SEQ ID NO:1‑3任一项所示的氨基酸序列。本发明还提供包含解旋酶BCH2X和用于结合多核苷酸的结合部分的复合体结构,本发明还提供解旋酶BCH2X或其复合体结构在控制和表征多核苷酸、单分子纳米孔测序方面的用途。
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公开(公告)号:CN117529561A
公开(公告)日:2024-02-06
申请号:CN202180099520.0
申请日:2021-06-16
申请人: 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号: C12Q1/6869 , C12Q1/6844 , C40B50/06
摘要: 一种通过单链滚环扩增获得双链序列的方法。所述方法包括:1)以第一引物对单链环状DNA进行滚环扩增反应,获得扩增序列,所述第一引物与所述单链环状DNA部分区域互补,所述单链环状DNA具有可致所述单链环状DNA开环的断开机制;2)通过所述断开机制使所述单链环状DNA开环,获得单链线性DNA;3)以所述单链线性DNA为第二引物、以1)中获得的扩增序列为模板进行扩增反应,获得扩增的双链序列。该方法通过单链滚环扩增获得双链序列具有诸多优点。
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公开(公告)号:CN112739829A
公开(公告)日:2021-04-30
申请号:CN201880097792.5
申请日:2018-09-27
申请人: 深圳华大生命科学研究院
IPC分类号: C12Q1/6869
摘要: 一种测序文库的构建方法和得到的测序文库及测序方法,构建方法包括:将线性核酸分子环化形成环状核酸分子,滚环扩增得到多拷贝的长片段核酸分子,然后合成互补链得到双链的长片段核酸分子;与转座复合体混合孵育形成带有转座复合体的长片段核酸分子,与带有分子标签序列的固相载体混合孵育,使得分子标签序列与转座复合体上的转座子序列连接;将转座复合体上的转座酶从长片段核酸分子上释放出来,同时长片段核酸分子被打断成多个连接有转座子序列和分子标签序列的短片段核酸分子;对短片段核酸分子进行聚合酶链式扩增,得到测序文库。
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