分离和/或富集宿主源核酸和病原核酸的方法和试剂及其制备方法

    公开(公告)号:CN113039283A

    公开(公告)日:2021-06-25

    申请号:CN201880099543.X

    申请日:2018-12-12

    摘要: 一种分离和/或富集宿主源核酸和病原核酸的方法和试剂及其制备方法。所述方法包括选自如下(a)或(b)的步骤:(a)将固定在固相载体上的宿主源探针与含有宿主源核酸和病原核酸的液体样品混合孵育,使宿主源探针与宿主源核酸杂交;进行固液分离得到结合在固相载体上的宿主源核酸和保留在液体样品中的病原核酸;(b)将宿主源探针、固定在固相载体上的病原探针与含有宿主源核酸和病原核酸的液体样品混合孵育,使宿主源探针与宿主源核酸杂交、病原探针与病原核酸杂交;进行固液分离得到结合在固相载体上的病原核酸和保留在液体样品中的宿主源核酸。该方法使用宿主源探针特异性捕获宿主源核酸,通过分离宿主源核酸来实现病原核酸的富集。

    一种DNA甲基化检测的方法、试剂盒、装置和应用

    公开(公告)号:CN113166809B

    公开(公告)日:2023-12-26

    申请号:CN201980076223.7

    申请日:2019-12-23

    IPC分类号: C12Q1/6869 C12Q1/6806

    摘要: 本申请提供了一种DNA甲基化检测的方法,包括长片段DNA处理步骤,将长片段DNA打断;常规文库构建步骤,用stLFR技术建库;双链保护步骤,取回收的stLFR文库,DNA变性,用退火或延伸方法将分子标签或接头序列转化为双链;重亚硫酸盐转化步骤,加入双链保护剂和重亚硫酸盐,进行脱氨基;甲基化测序文库构建步骤,对脱氨基产物进行常规PCR或环化后滚环扩增,得到甲基化测序文库;甲基化测序步骤,对甲基化测序文库测序,根据测序结果分析基因的甲基化信息;本申请还提供了相应试剂盒、装置和应用。本申请方法利用stLFR技术,获得长片段甲基化信息;通过双链保护策略,可事先加入分子标签序列建库,可有效追踪分子来源。

    基于DNA纳米球的多重测序方法
    7.
    发明公开

    公开(公告)号:CN118421767A

    公开(公告)日:2024-08-02

    申请号:CN202310130564.6

    申请日:2023-02-01

    IPC分类号: C12Q1/6869 C12Q1/6883

    摘要: 本申请提出了一种基于DNA纳米球(DNB)的多重测序方法,涉及基因测序技术领域,所述方法包括:对DNB进行第一测序,其中第一测序引物与所述DNB结合并在所述第一测序过程中生成第一测序链;将所述第一测序链洗脱;和使用所述第一测序引物对所述DNB进行第二测序。本申请提出的基于DNB的多重测序方法操作简单并且能够有效提升DNB测序的准确度。

    一种通过单链滚环扩增获得双链序列的方法

    公开(公告)号:CN117529561A

    公开(公告)日:2024-02-06

    申请号:CN202180099520.0

    申请日:2021-06-16

    摘要: 一种通过单链滚环扩增获得双链序列的方法。所述方法包括:1)以第一引物对单链环状DNA进行滚环扩增反应,获得扩增序列,所述第一引物与所述单链环状DNA部分区域互补,所述单链环状DNA具有可致所述单链环状DNA开环的断开机制;2)通过所述断开机制使所述单链环状DNA开环,获得单链线性DNA;3)以所述单链线性DNA为第二引物、以1)中获得的扩增序列为模板进行扩增反应,获得扩增的双链序列。该方法通过单链滚环扩增获得双链序列具有诸多优点。

    测序文库的构建方法和得到的测序文库及测序方法

    公开(公告)号:CN112739829A

    公开(公告)日:2021-04-30

    申请号:CN201880097792.5

    申请日:2018-09-27

    IPC分类号: C12Q1/6869

    摘要: 一种测序文库的构建方法和得到的测序文库及测序方法,构建方法包括:将线性核酸分子环化形成环状核酸分子,滚环扩增得到多拷贝的长片段核酸分子,然后合成互补链得到双链的长片段核酸分子;与转座复合体混合孵育形成带有转座复合体的长片段核酸分子,与带有分子标签序列的固相载体混合孵育,使得分子标签序列与转座复合体上的转座子序列连接;将转座复合体上的转座酶从长片段核酸分子上释放出来,同时长片段核酸分子被打断成多个连接有转座子序列和分子标签序列的短片段核酸分子;对短片段核酸分子进行聚合酶链式扩增,得到测序文库。