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公开(公告)号:CN118240926A
公开(公告)日:2024-06-25
申请号:CN202410336570.1
申请日:2024-03-22
Applicant: 深圳新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 北京新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 深圳市新合生物医疗科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种测定未知RNA序列的方法,首先借助T4RNALigase2,truncated酶在RNA的3’端特异性连接5’端腺苷化及3’端封闭修饰的Linker;再采用与Linker互补的引物进行反转录获得cDNA;接着采用羧基磁珠对获得的cDNA进行纯化;然后借助TdT在cDNA的3’端添加poly(C)尾;再对未知序列RNA的cDNA片段采用降落PCR进行特异性扩增;最后采用sanger测序,即可获得其具体的序列信息。本发明的测定未知RNA序列的方法,不受限于特定类型的RNA,可广泛应用于各种未知RNA序列的研究,为研究者提供了一种灵活而高效的选择,且本发明方法易于操作、经济实惠,适用于各种科研需求。
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公开(公告)号:CN117466777B
公开(公告)日:2024-03-19
申请号:CN202311819318.8
申请日:2023-12-27
Applicant: 北京新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 深圳市新合生物医疗科技有限公司 , 深圳新合睿恩生物医疗科技有限公司
IPC: C07C259/06 , A61K47/18 , C07C239/20 , C07C227/08 , C07C229/12 , C07C67/08 , C07C69/63
Abstract: 本发明是关于一种阳离子脂质化合物及其制备方法和应用、以及mRNA递送系统,涉及医药生物技术领域,解决目前亟需开发递送效率高、具有靶向性的阳离子质脂化合物的问题。其中,所述阳离子脂质化合物的结构如下所示:#imgabs0#;其中,该阳离子脂质化合物用于制备mRNA递送系统,具有肝脏蓄积少、安全性高、递送效率高、脾脏靶向性强的特点。
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公开(公告)号:CN117660467A
公开(公告)日:2024-03-08
申请号:CN202311664961.8
申请日:2023-12-06
Applicant: 北京新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 深圳新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 深圳市新合生物医疗科技有限公司
Abstract: 本发明涉及一种高表达、具有强大激活特异性T细胞和诱导免疫记忆能力的Survivin疫苗核酸序列。本发明首先对以Survivin为靶点的肿瘤疫苗进行密码子优化,从优化的10条序列中筛选出蛋白表达量最高的序列Survivin‑038作为靶点的最优序列。实验证明该最佳Survivin‑038疫苗核酸序列具有强大的激活特异性T细胞和诱导免疫记忆的能力。利用该Survivin‑038核酸序列制备的疫苗有良好抗肿瘤效果,为此靶点开发治疗肿瘤的药物研究提供依据。
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公开(公告)号:CN117004732A
公开(公告)日:2023-11-07
申请号:CN202311180547.X
申请日:2023-09-13
Applicant: 北京新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 深圳新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 深圳市新合生物医疗科技有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测肿瘤组织中Muc1抗原的引物、探针、试剂盒和方法,所述引物包括如SEQ ID NO.1所示的正向引物和如SEQ ID NO.2所示的反向引物,所述探针的序列如SEQ ID NO.3所示。在本发明中,首先针对肿瘤相关抗原Muc1和内参基因HPRT1设计了特异性高、敏感性强的引物和探针,并对肿瘤相关抗原Muc1的检测方法进行了全面优化;在此构思下,实现了mRNA保存状况较差的石蜡包埋肿瘤组织样品中Muc1表达水平的精准检测,具有广阔的临床应用前景。
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公开(公告)号:CN116283624B
公开(公告)日:2023-10-20
申请号:CN202310203981.9
申请日:2023-03-06
Applicant: 深圳市新合生物医疗科技有限公司 , 深圳新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 北京新合睿恩生物医疗科技有限公司
IPC: C07C219/16 , C07C213/06 , C07C229/12 , C07C269/04 , C07C271/20 , C07C329/06 , C07C333/04 , C07C67/29 , C07C69/30 , A61K47/18 , A61K47/20
Abstract: 本发明是关于一种阳离子脂质化合物及其制备方法和应用、以及mRNA递送系统;解决亟需开发递送效率高、免疫激活特性优异的阳离子质脂的问题。其中,阳离子脂质化合物的结构如下式(I)所示:#imgabs0#其中,在式(I):X为O或N;n为2‑4;m为2‑4;a为0或1;R1为包含三级胺的链状结构;R2为直链状脂肪酰基或具有支链的链状脂肪酰基;R3为具有支链的链状脂肪酰基。本发明主要用于开发一种阳离子脂质化合物,该阳离子脂质化合物用于制备mRNA递送系统,具有递送效率高、器官靶向递送、以及免疫激活特性优异的特点。
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公开(公告)号:CN116168764B
公开(公告)日:2023-06-30
申请号:CN202310453568.8
申请日:2023-04-25
Applicant: 深圳新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 深圳市新合生物医疗科技有限公司 , 北京新合睿恩生物医疗科技有限公司
Abstract: 本发明属于生物信息学技术领域,公开了一种信使核糖核酸的5'非翻译区序列优化方法,通过提取mRNA样本的5'UTR样本序列的特征,计算每个特征的重要性分值并筛选重要性高的特征,计算特征与蛋白表达的相关值,根据相关值与重要性计算特征的概率值,据此对原始5'UTR序列进行定向遗传变异迭代直至收敛,获得优化后的目标5'UTR序列,从而通过明确不同特征与蛋白表达的相关性、重要性,可以更好地解释序列改造的过程,具备可解释性,还能够指导有益的变异朝着更加优化的方向前进,实现更好的序列优化效果。
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公开(公告)号:CN116130005B
公开(公告)日:2023-06-16
申请号:CN202310046004.2
申请日:2023-01-30
Applicant: 深圳新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 北京新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 深圳市新合生物医疗科技有限公司
Abstract: 本发明属于生物信息学技术领域,公开了一种多表位疫苗的串联设计方法及装置、设备、存储介质,通过获取候选疫苗序列的多序列比对数据和序列特征矩阵,据此计算初始PSSM进行特征编码获得作用特征信息,同时对序列特征矩阵进行局部特征提取获得局部特征信息;然后根据局部特征信息和作用特征信息获得增强PSSM,再根据增强PSSM和序列特征矩阵计算候选疫苗序列的各个位点的预测裂解概率,最后构建混合整数线性规划问题进行优化求解获得多个多表位疫苗,从而可以提取候选疫苗序列的相邻氨基酸残基的局部隐藏模式和特征,对初始PSSM进行修正获取更加精准的增强PSSM参与后续的表位串联设计,提高所设计的多表位疫苗的准确性和可靠。
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公开(公告)号:CN116064399A
公开(公告)日:2023-05-05
申请号:CN202210897658.1
申请日:2022-07-28
Applicant: 深圳市新合生物医疗科技有限公司 , 深圳新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 北京新合睿恩生物医疗科技有限公司
IPC: C12N5/10 , C12N5/0781 , C12N5/0783 , C12N5/0784 , C12N15/11 , G01N33/543
Abstract: 本发明公开一种mRNA特异性免疫激活检测方法,其包括下列步骤:制备mRNA:包括,线性化模板制备,体外转录,加帽,线性化模板去除,mRNA纯化;制备iDC细胞,iDC细胞转染,通过电转染或者化学转染将mRNA负载至DC细胞上;iDC诱导mDC:培养,Elispot实验种板;Elispot染色,检测。本发明主要在于设计了利用Elispot直接检测mRNA特异性免疫激活的方法。本发明所述方法能够直接检测mRNA特异性免疫激活,具有检测耗时短、便利性高、实验细胞消耗少、检测成本低等优势和特点,可很好地应用于检测mRNA疫苗特异性免疫激活的效果。
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公开(公告)号:CN115798595A
公开(公告)日:2023-03-14
申请号:CN202310046005.7
申请日:2023-01-30
Applicant: 深圳新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 北京新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 深圳市新合生物医疗科技有限公司
Abstract: 本发明属于生物信息学领域,公开了一种蛋白质序列的水解位点预测方法及装置、设备、存储介质,通过计算蛋白质序列的特征矩阵和VHSE描述向量,该VHSE描述向量用于表示蛋白质序列的亲疏水特性、几何特性和电荷特性等物理化学性质,然后根据特征矩阵和VHSE描述向量计算蛋白质序列各个位点的先验裂解概率,根据蛋白质序列的位置特异性矩阵计算蛋白质序列各个位点的第一概率和第二概率,再利用贝叶斯公式计算各个位点的预测裂解概率,将预测裂解概率达到指定概率阈值的位点确定为水解位点,从而可以融合考虑蛋白质的物理化学性质和位置特异性矩阵,来预测蛋白质各个位点可能裂解的概率,以此确定水解位点,可以提高预测准确率。
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公开(公告)号:CN115240773A
公开(公告)日:2022-10-25
申请号:CN202211086237.7
申请日:2022-09-06
Applicant: 深圳新合睿恩生物医疗科技有限公司 , 深圳市新合生物医疗科技有限公司 , 北京新合睿恩生物医疗科技有限公司
Abstract: 本发明属于生物信息学技术领域,公开了一种肿瘤特异环状RNA的新抗原鉴定方法,通过对检测出的候选环状RNA构建用于重比对的伪参考序列,分别将肿瘤组织样本和癌旁组织样本的测序数据与伪参考序列进行比对,提取出比对上的第一候选reads和第二候选reads,将具有第一候选reads支持的候选环状RNA确定为从肿瘤组织中的第一环状RNA,而具有第二候选reads支持的候选环状RNA确定为从癌旁组织中的第二环状RNA,两者融合将同时存在于肿瘤组织和癌旁组织的环状RNA滤除,获得肿瘤特异环状RNA,进一步预测翻译能力分值,对其衍生的新抗原进行打分并排序,获取排序靠前的新抗原,可以增加肿瘤新抗原的来源,同时提高环状RNA的鉴定准确性,使其新抗原更具免疫原性。
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