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公开(公告)号：CN115792238B
公开(公告)日：2024-08-20
申请号：CN202210209696.3
申请日：2022-03-04
Applicant: 清华大学
IPC: G01N33/68 , C07K14/725 , C12N1/19 , C12Q1/6869 , C12R1/865
Abstract: 本发明涉及一种筛选并确定与特定抗原相互作用的TCR及其与特定抗原相互作用强度的方法，本发明的方法是一种利用酵母展示和酵母交配系统实现筛选并确定与特定抗原相互作用的TCR及其与特定抗原相互作用强度，根据本发明的方法，将TCR和pMHC分别展示到不同交配型酵母表面，然后进行酵母交配实验，进而通过酵母交配系统中TCR与pMHC互相作用形成的二倍体酵母细胞来筛选并确定TCR及其与特定抗原相互作用强度。同时通过计算所述筛选并确定出的每种TCR序列的差异倍数(fold change)值，由此确定出与特定抗原相互作用的TCR及其与特定抗原相互作用强度。
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公开(公告)号：CN115786148A
公开(公告)日：2023-03-14
申请号：CN202210190607.5
申请日：2022-02-28
Applicant: 清华大学
IPC: C12N1/19 , C12N15/81 , C12N15/12 , C12N15/10 , C40B50/06 , C40B40/02 , C40B30/04 , C40B20/04 , C12R1/865
Abstract: 本发明涉及一种双向筛选相互作用的TCR和pMHC的方法，通过本发明所提供的方法，利用酵母展示技术与酵母交配系统，在酵母表面分别展示TCR文库、pMHC抗原文库，进而通过二倍体筛选和测序实现TCR和pMHC抗原序列的双向筛选。根据本发明所提供的方法，无需以往技术中耗时费力的纯化蛋白的步骤，可在短时间内双向筛选得到相互作用的特定TCR序列和特定pMHC抗原序列，且实验结果可靠。
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公开(公告)号：CN116199766A
公开(公告)日：2023-06-02
申请号：CN202210715802.5
申请日：2022-06-22
Applicant: 清华大学
IPC: C07K14/725 , C12N5/0783 , C12N5/10 , C12N15/12 , C07K14/165 , C12N15/50 , A61K39/215 , A61K38/17 , A61K35/17 , A61P31/14
Abstract: 本发明涉及一种筛选TCR的方法。方法包括：将第一细胞与第二细胞进行共培养处理，第一细胞表达单个HLA等位基因和多个抗原表位肽，第二细胞选自T细胞或含有T细胞的细胞群；将共培养处理后获得的第二细胞进行分选处理，得到分选细胞，分选细胞表达有与抗原表位肽结合的TCR，TCR为目标TCR；其中，第一细胞是通过将表达载体导入受体细胞后获得的，表达载体携带串联小基因，串联小基因编码所述多个抗原表位肽。该方法可单次获得多个特异性TCR，具有筛选效率高和筛选成本低等优点；尤其是当多个抗原表位肽来源于同一病毒或病原细胞时，得到的多个TCR均可特异性识别该病毒或病原细胞，具有筛选效率高等优点。
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公开(公告)号：CN118588172A
公开(公告)日：2024-09-03
申请号：CN202410734839.1
申请日：2024-06-07
Applicant: 首都医科大学附属北京积水潭医院 , 人科(北京)生物技术有限公司 , 清华大学
Abstract: 本发明公开了用于监测多发性骨髓瘤微小残留病的计算机装置及计算机可读存储介质，属于医疗保健信息学领域。本发明所要解决的技术问题是如何实现高特异性和/或高敏感性地监测多发性骨髓瘤微小残留病。本发明提供了计算机装置，其包括存储器、处理器及存储在存储器上的计算机程序，所述处理器执行所述计算机程序以实现如下步骤：S1、接收待测多发性骨髓瘤患者50个靶基因的TSS相对覆盖度数据；S2、将所述数据输入多发性骨髓瘤微小残留病监测模型；S3、通过所述模型输出多发性骨髓瘤微小残留病的概率值；再基于概率值得出待测多发性骨髓瘤患者的MRD状况。本发明用于多发性骨髓瘤微小残留病的监测。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN116199766B
公开(公告)日：2024-03-12
申请号：CN202210715802.5
申请日：2022-06-22
Applicant: 清华大学
IPC: C07K14/725 , C12N5/0783 , C12N5/10 , C12N15/12 , C07K14/165 , C12N15/50 , A61K39/215 , A61K38/17 , A61K35/17 , A61P31/14
Abstract: 本发明涉及一种筛选TCR的方法。方法包括：将第一细胞与第二细胞进行共培养处理，第一细胞表达单个HLA等位基因和多个抗原表位肽，第二细胞选自T细胞或含有T细胞的细胞群；将共培养处理后获得的第二细胞进行分选处理，得到分选细胞，分选细胞表达有与抗原表位肽结合的TCR，TCR为目标TCR；其中，第一细胞是通过将表达载体导入受体细胞后获得的，表达载体携带串联小基因，串联小基因编码所述多个抗原表位肽。该方法可单次获得多个特异性TCR，具有筛选效率高和筛选成本低等优点；尤其是当多个抗原表位肽来源于同一病毒或病原细胞时，得到的多个TCR均可特异性识别该病毒或病原细胞，具有筛选效率高等优点。
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公开(公告)号：CN112501269B
公开(公告)日：2022-02-18
申请号：CN202011473454.2
申请日：2020-12-15
Applicant: 清华大学
IPC: C12Q1/6869 , C12N1/19 , C12N15/12
Abstract: 本发明涉及一种快速鉴定高亲和力TCR抗原交叉反应活性的方法，将TCR和pMHC序列调整为组成型启动子诱导表达，并将该元件整合表达到酵母基因组中，包括以下步骤：将TCR和pMHC蛋白展示到不同交配型酵母表面；利用整合TCR和pMHC的不同交配型酵母进行酵母交配实验；二倍体的筛选和二代测序。本发明能够提供一种快速鉴定高亲和力TCR抗原交叉反应活性的方法，无需纯蛋白，仅需合成DNA序列，利用Golden‑gate克隆方法，一周内可获得更全的抗原突变文库，方便快捷；借助酵母交配系统，突破在细胞水平上筛选的限制，操作步骤简化，可短时间内获得与特定TCR相互作用的抗原序列，实验结果可靠。
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公开(公告)号：CN118588172B
公开(公告)日：2025-01-17
申请号：CN202410734839.1
申请日：2024-06-07
Applicant: 首都医科大学附属北京积水潭医院 , 人科(北京)生物技术有限公司 , 清华大学
Abstract: 本发明公开了用于监测多发性骨髓瘤微小残留病的计算机装置，属于医疗保健信息学领域。本发明所要解决的技术问题是如何实现高特异性和/或高敏感性地监测多发性骨髓瘤微小残留病。本发明提供了计算机装置，其包括存储器、处理器及存储在存储器上的计算机程序，所述处理器执行所述计算机程序以实现如下步骤：S1、接收待测多发性骨髓瘤患者50个靶基因的TSS相对覆盖度数据；S2、将所述数据输入多发性骨髓瘤微小残留病监测模型；S3、通过所述模型输出多发性骨髓瘤微小残留病的概率值；再基于概率值得出待测多发性骨髓瘤患者的MRD状况。本发明用于多发性骨髓瘤微小残留病的监测。
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公开(公告)号：CN115792238A
公开(公告)日：2023-03-14
申请号：CN202210209696.3
申请日：2022-03-04
Applicant: 清华大学
IPC: G01N33/68 , C07K14/725 , C12N1/19 , C12Q1/6869 , C12R1/865
Abstract: 本发明涉及一种筛选并确定与特定抗原相互作用的TCR及其与特定抗原相互作用强度的方法，本发明的方法是一种利用酵母展示和酵母交配系统实现筛选并确定与特定抗原相互作用的TCR及其与特定抗原相互作用强度，根据本发明的方法，将TCR和pMHC分别展示到不同交配型酵母表面，然后进行酵母交配实验，进而通过酵母交配系统中TCR与pMHC互相作用形成的二倍体酵母细胞来筛选并确定TCR及其与特定抗原相互作用强度。同时通过计算所述筛选并确定出的每种TCR序列的差异倍数(fold change)值，由此确定出与特定抗原相互作用的TCR及其与特定抗原相互作用强度。
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公开(公告)号：CN115786439A
公开(公告)日：2023-03-14
申请号：CN202210137336.7
申请日：2022-02-15
Applicant: 清华大学
Abstract: 本发明涉及的是一种确定TCR和抗原相互作用强度的方法。根据本发明的方法，通过将酵母与T细胞共培养，并检测激活表达T细胞活化标志物的T细胞数目比例或者检测所述共培养中所有T细胞的T细胞活化标志物的平均表达量。根据本发明可以无需纯化蛋白，在更短的时间内以更低的成本快速地确定感兴趣的TCR和抗原的相互作用强度。
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