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公开(公告)号:CN109715817A
公开(公告)日:2019-05-03
申请号:CN201780048037.3
申请日:2017-04-19
Applicant: 科德克希思公司
Inventor: 约瓦娜·纳佐尔 , 罗伯特·奥斯本 , 杰克·梁 , 乔纳森·弗罗姆 , 张希云 , 大卫·恩特韦斯特尔 , 拉玛·沃兰德里 , 拉维·大卫·加西亚 , 杰弗里·C·穆尔 , 谢恩·格罗瑟 , 波吉特·科斯耶克 , 马修·特鲁波
Abstract: 本发明提供了用于产生羟基化化合物的工程化脯氨酸羟化酶多肽、编码该工程化脯氨酸羟化酶的多核苷酸、能够表达该工程化脯氨酸羟化酶的宿主细胞、以及使用该工程化脯氨酸羟化酶制备在产生活性药剂中有用的化合物的方法。
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公开(公告)号:CN105814573B
公开(公告)日:2019-03-29
申请号:CN201480065176.3
申请日:2014-09-26
Applicant: 科德克希思公司
Inventor: 拉塞尔·贾维尼亚·萨米恩托 , 唐纳德·斯科特·巴斯克维尔 , 张希云
IPC: G16B15/20
Abstract: 公开了用于参考结构数据构建序列活性模型的方法,该模型可被用于引导具有有益特性的蛋白的定向进化。一些实施方案采用遗传算法和结构数据来过滤掉不提供信息的数据。一些实施方案使用支持向量机来训练序列活性模型。过滤方法和训练方法可产生具有比传统建模方法高的预测力的序列活性模型。还提供了实现该方法的系统和计算机程序产品。
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公开(公告)号:CN102341494B
公开(公告)日:2014-10-15
申请号:CN201080010926.9
申请日:2010-01-08
Applicant: 科德克希思公司
IPC: C12N9/10 , C12N15/63 , C12P41/00 , C07K14/195
CPC classification number: C12N9/1096 , C12P13/001 , C12P41/006 , C12Y206/01 , C12Y206/01018 , Y02P20/52
Abstract: 本公开内容提供与天然存在的野生型转氨酶相比具有改进的性质的工程转氨酶。还提供了编码所述工程转氨酶的多核苷酸,能够表达所述工程转氨酶的宿主细胞和使用所述工程转氨酶合成多种手性化合物的方法。
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公开(公告)号:CN109486803A
公开(公告)日:2019-03-19
申请号:CN201811343013.3
申请日:2014-04-17
Applicant: 科德克希思公司
Inventor: 吉伽特·W·哈思曼 , 尼古拉斯·J·阿加德 , 本杰明·米杰茨 , 乔纳森·弗罗姆 , 张希云
IPC: C12N9/88
Abstract: 本申请涉及工程化苯丙氨酸解氨酶多肽。特别地,本申请提供了工程化苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL)多肽及其组合物,以及编码工程化苯丙氨酸解氨酶(PAL)多肽的多核苷酸。在一些实施方案中,工程化PLA多肽被优化以提供增强的催化活性、以及降低的对蛋白水解的敏感性和增加的对酸性pH水平的耐受性。在一些实施方案中,工程化PLA多肽被去免疫化(deimmunized)。本申请还涉及包含工程化PAL多肽的组合物用于治疗和工业目的的用途。
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公开(公告)号:CN108271374A
公开(公告)日:2018-07-10
申请号:CN201680040014.3
申请日:2016-06-02
Applicant: 科德克希思公司
CPC classification number: C12N9/0071 , C12N1/16 , C12N1/20 , C12N9/0042 , C12N15/52 , C12N15/63 , C12Y106/02004 , C12Y114/14001
Abstract: 本发明提供了具有改进的活性的改进的P450-BM3变体。在一些实施方案中,P450-BM3变体对宽范围的底物表现出改进的活性。
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公开(公告)号:CN105765592A
公开(公告)日:2016-07-13
申请号:CN201480065215.X
申请日:2014-09-26
Applicant: 科德克希思公司
Inventor: 张希云 , 拉塞尔·贾维尼亚·萨米恩托 , 唐纳德·斯科特·巴斯克维尔 , 耶伊特·W·胡伊斯曼
Abstract: 公开了用于从复杂的生物分子文库或此类文库的组中鉴定具有期望特性(或最适合于一轮定向进化)的生物分子的方法。本公开内容的一些实施方案提供了用于虚拟筛选蛋白的有利特征的方法。本公开内容的一些实施方案提供了虚拟筛选酶的期望活性和/或选择性用于为牵涉特定底物的催化反应的方法。一些实施方案结合筛选和定向进化,以设计并开发具有期望的特性的蛋白和酶。还提供了实施所述方法的系统和计算机程序产品。
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公开(公告)号:CN105324483A
公开(公告)日:2016-02-10
申请号:CN201480035201.3
申请日:2014-04-17
Applicant: 科德克希思公司
Inventor: 吉伽特·W·哈思曼 , 尼古拉斯·J·阿加德 , 本杰明·米杰茨 , 乔纳森·弗罗姆 , 张希云
IPC: C12N9/88
CPC classification number: C12N9/88 , A61K38/00 , C12Y403/01005 , C12Y403/01024
Abstract: 本发明提供了工程化苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL)多肽及其组合物,以及编码工程化苯丙氨酸解氨酶(PAL)多肽的多核苷酸。在一些实施方案中,工程化PLA多肽被优化以提供增强的催化活性、以及降低的对蛋白水解的敏感性和增加的对酸性pH水平的耐受性。在一些实施方案中,工程化PLA多肽被去免疫化(deimmunized)。本发明还涉及包含工程化PAL多肽的组合物用于治疗和工业目的的用途。
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公开(公告)号:CN105765592B
公开(公告)日:2019-12-17
申请号:CN201480065215.X
申请日:2014-09-26
Applicant: 科德克希思公司
Inventor: 张希云 , 拉塞尔·贾维尼亚·萨米恩托 , 唐纳德·斯科特·巴斯克维尔 , 耶伊特·W·胡伊斯曼
Abstract: 公开了用于从复杂的生物分子文库或此类文库的组中鉴定具有期望特性(或最适合于一轮定向进化)的生物分子的方法。本公开内容的一些实施方案提供了用于虚拟筛选蛋白的有利特征的方法。本公开内容的一些实施方案提供了虚拟筛选酶的期望活性和/或选择性用于牵涉特定底物的催化反应的方法。一些实施方案结合筛选和定向进化,以设计并开发具有期望的特性的蛋白和酶。还提供了实施所述方法的系统和计算机程序产品。
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公开(公告)号:CN109872771A
公开(公告)日:2019-06-11
申请号:CN201910165028.3
申请日:2014-09-26
Applicant: 科德克希思公司
Inventor: 拉塞尔·贾维尼亚·萨米恩托 , 唐纳德·斯科特·巴斯克维尔 , 张希云
IPC: G16B15/20
Abstract: 本申请涉及基于定向进化的方法、装置和系统。公开了用于参考结构数据构建序列活性模型的方法,该模型可被用于引导具有有益特性的蛋白的定向进化。一些实施方案采用遗传算法和结构数据来过滤掉不提供信息的数据。一些实施方案使用支持向量机来训练序列活性模型。过滤方法和训练方法可产生具有比传统建模方法高的预测力的序列活性模型。还提供了实现该方法的系统和计算机程序产品。
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公开(公告)号:CN102341494A
公开(公告)日:2012-02-01
申请号:CN201080010926.9
申请日:2010-01-08
Applicant: 科德克希思公司
IPC: C12N9/10 , C12N15/63 , C12P41/00 , C07K14/195
CPC classification number: C12N9/1096 , C12P13/001 , C12P41/006 , C12Y206/01 , C12Y206/01018 , Y02P20/52
Abstract: 本公开内容提供与天然存在的野生型转氨酶相比具有改进的性质的工程转氨酶。还提供了编码所述工程转氨酶的多核苷酸,能够表达所述工程转氨酶的宿主细胞和使用所述工程转氨酶合成多种手性化合物的方法。
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