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公开(公告)号：CN117171308A
公开(公告)日：2023-12-05
申请号：CN202310945983.5
申请日：2023-07-28
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 , 上海至本医学检验所有限公司
IPC: G06F16/332 , G06F40/30 , G06F40/205 , G06F16/338 , G16H10/20 , G16H10/60
Abstract: 本发明涉及一种用于生成科研数据分析应答信息的方法、设备和介质。该方法包括：基于历史数据集合和/或与用户相关联的数据集合，构建参考数据集合；针对用户输入的问询记录，生成调整后的问询语句；将参考数据集合和所生成的问询语句进行匹配，以便确定与问询语句匹配的参考数据集合的候选项目标识；将所生成的调整后的问询语句匹配到目标应答信息输出类型，以便基于目标应答信息输出类型和候选项目标识而生成条件关键词和问题关键词；以及基于目标需求类型、条件关键词和问题关键词，生成关于问询记录的应答信息。本发明能够高效率、高质量、自动化地实现针对科研数据分析问询问题的应答结果输出合。
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公开(公告)号：CN114974412B
公开(公告)日：2023-02-10
申请号：CN202210794329.4
申请日：2022-07-05
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 , 上海至本医学检验所有限公司
Abstract: 本发明涉及一种生成目标对象的肿瘤检测报告数据的方法、设备和介质。该方法包括：获取关于多个目标对象的临床信息和关于多个目标对象的待测样本的测序下机数据，用以生成比对结果数据；基于比对结果数据，生成关于待测样本的多种变异的阳性结果信息；基于多种变异的阳性结果信息和所获取的对照关系数据，生成关于待测样本的变异结果的临床注释信息表，临床注释信息表包括多个字段；以及基于所生成的临床注释信息表、检测报告模板和关于检测报告模板的操作信息，生成目标对象的肿瘤检测报告数据，检测报告模板至少包括多个注释标识和对应变量值。本发明能够灵活兼容不同测序仪器对输出数据的固有差异化设置而实现肿瘤检测数据的按需生成。
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公开(公告)号：CN114974412A
公开(公告)日：2022-08-30
申请号：CN202210794329.4
申请日：2022-07-05
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 , 上海至本医学检验所有限公司
Abstract: 本发明涉及一种生成目标对象的肿瘤检测报告数据的方法、设备和介质。该方法包括：获取关于多个目标对象的临床信息和关于多个目标对象的待测样本的测序下机数据，用以生成比对结果数据；基于比对结果数据，生成关于待测样本的多种变异的阳性结果信息；基于多种变异的阳性结果信息和所获取的对照关系数据，生成关于待测样本的变异结果的临床注释信息表，临床注释信息表包括多个字段；以及基于所生成的临床注释信息表、检测报告模板和关于检测报告模板的操作信息，生成目标对象的肿瘤检测报告数据，检测报告模板至少包括多个注释标识和对应变量值。本发明能够灵活兼容不同测序仪器对输出数据的固有差异化设置而实现肿瘤检测数据的按需生成。
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公开(公告)号：CN116312797B
公开(公告)日：2024-02-20
申请号：CN202310136782.0
申请日：2023-02-17
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 , 上海至本医学检验所有限公司
Abstract: 本发明涉及一种用于针对基因结构重排预测功能融合的方法、设备和介质。该方法包括：基于测序数据计算基因结构重排的断点；获取基因结构重排的断点所对应的转录的边缘剩余密码子，以便计算断点重接处的密码子三联状态信息；确定基因结构重排所涉基因是否包括激酶结构域；响应于确定基因结构重排所涉基因包括激酶结构域，获得对应激酶结构域的基因组范围，以便确定关于基因结构重排所形成的新嵌合转录本包含激酶结构域的包含状态信息；基于包含状态信息和/或断点重接处的密码子三联状态信息，针对基因结构重排预测功能融合状态。本发明能够实现针对NGS所检测出的基因结构重排准确预测功能融合。
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公开(公告)号：CN116312797A
公开(公告)日：2023-06-23
申请号：CN202310136782.0
申请日：2023-02-17
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 , 上海至本医学检验所有限公司
Abstract: 本发明涉及一种用于针对基因结构重排预测功能融合的方法、设备和介质。该方法包括：基于测序数据计算基因结构重排的断点；获取基因结构重排的断点所对应的转录的边缘剩余密码子，以便计算断点重接处的密码子三联状态信息；确定基因结构重排所涉基因是否包括激酶结构域；响应于确定基因结构重排所涉基因包括激酶结构域，获得对应激酶结构域的基因组范围，以便确定关于基因结构重排所形成的新嵌合转录本包含激酶结构域的包含状态信息；基于包含状态信息和/或断点重接处的密码子三联状态信息，针对基因结构重排预测功能融合状态。本发明能够实现针对NGS所检测出的基因结构重排准确预测功能融合。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114822700A
公开(公告)日：2022-07-29
申请号：CN202210443269.1
申请日：2022-04-25
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 , 上海至本医学检验所有限公司
Abstract: 本发明涉及一种用于呈现重排或融合结构亚型的方法、设备和介质。该方法包括：生成包括有基因结构注释信息的基因注释文件，基因结构注释信息至少指示：外显子或内含子编号、基因名称、每个基因使用的NM号、基因转录方向和外显子的总数目；基于待测样本的成对序列的双末端测序数据与参考基因组序列的比对结果数据，确定基因融合对的融合支持序列，以用于生成含有融合支持序列的对比结果文件；将对比结果文件和所生成的注释文件加载入基因组浏览器；以及获取断点所在基因位置，以便经由基因组浏览器生成图像数据，以用于基于所生成的图像数据确定重排或融合结构亚型。本发明能够通过可视化方法来读取重排断点所在的基因结构和重排后形成的亚型结构。
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公开(公告)号：CN114496087A
公开(公告)日：2022-05-13
申请号：CN202210073366.6
申请日：2022-01-21
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 , 上海至本医学检验所有限公司
Abstract: 本公开涉及一种用于确定阳性断点的方法、计算设备和计算机存储介质。该方法包括：获取跨同一断点的、一端比对上第一基因组并且另一端未比对上第二基因组的所有支持读长，以便在支持读长中确定符合错配序列一致性条件的读长；记录符合预定错配序列一致性条件的读长中的每一读长的错配序列长度，以便确定与预定错配序列相匹配的读长，预定错配序列是基于所记录的错配序列长度而确定的；基于错配序列长度，针对与预定错配序列相匹配的读长进行排序，以便计算关于同一断点的斜率；以及基于所计算的斜率和与预定错配序列相匹配的读长的数量，确定阳性断点。本公开有助于对假阳性的快速正确识别，能够自动并准确地判断断点的真假。
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公开(公告)号：CN108229100A
公开(公告)日：2018-06-29
申请号：CN201810497054.1
申请日：2018-05-22
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司
Abstract: 本发明提供了一种DNA重排区域及相应RNA产物检测方法、设备以及存储介质，其中的DNA重排区域检测方法，包括以下步骤：接收待测样本的比对信息；获取聚类得到多个小簇；按成对的两个映射对应的两个小簇相同的关系分别进行合并得到各个大簇判断各个大簇是否满足预定对数；分别判断各个对数满足预定对数的大簇是否满足预定比对特异性条件；分别对满足比对特异性条件的大簇中按对应的小簇相同的所有映射为一组分别对每组进行预定过滤；判定两个组被预定过滤后都留下的大簇中的所有映射对应的区域为待测样本的一个实际的DNA重排区域在该参考基因组上的映射区域，相应的大簇为支持该DNA重排区域的支持大簇。
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公开(公告)号：CN117171309B
公开(公告)日：2024-11-22
申请号：CN202310948615.6
申请日：2023-07-28
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 , 上海至本医学检验所有限公司
IPC: G06F16/332 , G06N5/022 , G06N5/04 , G06N20/00
Abstract: 本发明涉及一种用于针对医学问询提供应答信息的方法、设备和介质。该方法包括：针对所获取的用户的医学问询信息提取特征，以便至少基于所提取特征，生成具有预定自然语言格式的问询问题特征信息；将问询问题特征信息与预定数据集合进行文本嵌入搜索，以便获得搜索结果字段；以及至少基于问询问题特征信息和所获得的搜索结果字段构建提示语，以输入经训练的语言模型，以用于至少基于语言模型的输出而生成针对医学问询信息的应答信息。本发明能够有效实现针对医学问询问题的精准应答。
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公开(公告)号：CN117171308B
公开(公告)日：2024-09-17
申请号：CN202310945983.5
申请日：2023-07-28
Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 , 上海至本医学检验所有限公司
IPC: G06F16/332 , G06F40/30 , G06F40/205 , G06F16/338 , G16H10/20 , G16H10/60
Abstract: 本发明涉及一种用于生成科研数据分析应答信息的方法、设备和介质。该方法包括：基于历史数据集合和/或与用户相关联的数据集合，构建参考数据集合；针对用户输入的问询记录，生成调整后的问询语句；将参考数据集合和所生成的问询语句进行匹配，以便确定与问询语句匹配的参考数据集合的候选项目标识；将所生成的调整后的问询语句匹配到目标应答信息输出类型，以便基于目标应答信息输出类型和候选项目标识而生成条件关键词和问题关键词；以及基于目标需求类型、条件关键词和问题关键词，生成关于问询记录的应答信息。本发明能够高效率、高质量、自动化地实现针对科研数据分析问询问题的应答结果输出合。
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