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公开(公告)号:CN104805178A
公开(公告)日:2015-07-29
申请号:CN201410213969.7
申请日:2014-05-20
CPC分类号: C12Q1/6886 , C12Q2600/156
摘要: 本发明TACC3-FGFR3融合基因序列、其检测方法以及其在检测膀胱癌中的应用,属于分子生物学基因检测技术领域。包括下述步骤:(1)、制备mRNA-seq测序文库;(2)、对步骤(1)中提取的两种RNA进行RNA测序;(3)、对步骤(2)的测序结果进行测序后软件分析;(4)、对于所得融合基因进行验证。本发明具有公开了TACC3-FGFR3融合基因突变与膀胱癌高患病风险相关并且可以作为膀胱癌诊断的辅助基因诊断方式;同时公开了TACC3-FGFR3融合基因突变可以作为潜在的靶向治疗靶点的优点。
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公开(公告)号:CN104059966A
公开(公告)日:2014-09-24
申请号:CN201410213970.X
申请日:2014-05-20
CPC分类号: C12Q1/6886 , C12Q1/6869 , C12Q2600/118 , C12Q2600/156 , C12Q2535/122 , C12Q2537/165
摘要: 本发明STAG2基因突变序列、其检测方法以及STAG2基因突变在检测膀胱癌中的应用,属于分子生物学基因检测技术领域。包括下述步骤:(1)、从膀胱癌患者的肿瘤组织和外周血中分别提取肿瘤组织DNA和外周血DNA;(2)、对步骤(1)中提取的两种DNA分别进行全基因组测序和全外显子测序;(3)、对步骤(2)的测序结果进行全外显子组序列比对与体细胞突变检测,得到突变基因;(4)、采用Sanger测序来验证步骤(3)所得突变基因的体细胞替换和插入与缺失;(5)、突变基因为显著突变基因的鉴定。本发明具有确立了STAG2的突变是膀胱癌预后差的指标之一,也可以作为治疗膀胱癌的一个新的作用靶点的优点。
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公开(公告)号:CN104968804A
公开(公告)日:2015-10-07
申请号:CN201480000040.4
申请日:2014-01-28
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6883 , C12Q1/683 , C12Q2600/156 , C12Q2531/113 , C12Q2565/125
摘要: 本发明从尿液样品中检测TERT单核苷酸多态性的方法,属于分子检测技术领域。该方法包括:从样本的尿液和正常组织中分别提取DNA;以引物对P为引物,以从样本尿液和正常组织中提取的DNA为模板,分别进行PCR扩增;对扩增产物分别用Nli387/71限制性内切酶进行酶切,酶切后产物用0.5μg/ml溴化乙锭的琼脂糖凝胶进行水平电泳。本发明的方法通过设计特定的PCR引物扩增片段,用特定的限制性内切酶对扩增片段进行酶切,使突变位点可以通过凝胶电泳进行检测,具有简单、快速、成本低、精确的检测其单核苷酸的多态性的优点。
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公开(公告)号:CN104141009A
公开(公告)日:2014-11-12
申请号:CN201410310846.5
申请日:2014-07-01
IPC分类号: C12Q1/68
摘要: 本发明早期膀胱癌的多靶标检测方法,属于生物检测技术领域。包括下述步骤:(1)提取患者尿液中所含的DNA;(2)对步骤(1)获得的DNA进行亚硫酸氢盐转化处理;(3)通过甲基化特异性荧光定量PCR对EOMES、GDF15、NID2、PCDH17、POU4F2、TCF21、ZNF154这七个标志物基因进行检测,以ALU-C4作为内参基因;(4)以步骤(3)中的CT值来判定患者是否为早期膀胱癌。本发明具有以下优点:采用多个生物标志物基因联合检测,在每个标志物的特异性都比较高的前提下,使用多个标志物联用的方式来提高检测的敏感性和特异性;根据多个生物标志物基因设计了特异性引物。
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公开(公告)号:CN103923976A
公开(公告)日:2014-07-16
申请号:CN201410042839.1
申请日:2014-01-28
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6858 , C12Q2531/113 , C12Q2561/101
摘要: 本发明一种检测TERT单核苷酸多态性的方法,属于生物技术分子检测技术领域。该方法包括下述步骤:(1)、从样本的尿液和正常组织中分别提取DNA;(2)、针对需要检测的突变位点的不同,以从样本尿液和正常组织中提取的DNA为模板,分别以与突变位点相对应的引物对P1、P2或P3为引物,进行TaqMan Probe Real time PCR扩增;(3)、确定△Ctu与△Ctn之间的大小,当△Ctu-△Ctn
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公开(公告)号:CN104164482B
公开(公告)日:2016-08-24
申请号:CN201410212369.9
申请日:2014-05-20
IPC分类号: C12Q1/68
摘要: 本发明DHFR在检测膀胱癌中的应用,属于分子生物学基因检测技术领域。包括下述步骤:(1)、从样本的膀胱组织和外周血中分别提取DNA,得到DNA模板;(2)、以引物对P为引物,分别以从样本的膀胱组织和外周血提取的DNA为模板,分别进行实时定量PCR扩增;(3)、根据ΔΔCt来计算每个样本的log2比值,并将其与全基因组测序数据得到的拷贝数改变情况进行比较,当拷贝数变化超过2.5或小于1.5时或者当用GISTIC算法得到G分数>0.08或者G分数
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公开(公告)号:CN104164482A
公开(公告)日:2014-11-26
申请号:CN201410212369.9
申请日:2014-05-20
IPC分类号: C12Q1/68
CPC分类号: C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , C12Q2600/118 , C12Q2600/156 , C12Q2531/113 , C12Q2537/16 , C12Q2561/113
摘要: 本发明DHFR在检测膀胱癌中的应用,属于分子生物学基因检测技术领域。包括下述步骤:(1)从样本的膀胱组织和外周血中分别提取DNA,得到DNA模板;(2)以引物对P为引物,分别以从样本的膀胱组织和外周血提取的DNA为模板,分别进行实时定量PCR扩增;(3)根据ΔΔCt来计算每个样本的log2比值,并将其与全基因组测序数据得到的拷贝数改变情况进行比较,当拷贝数变化超过2.5或小于1.5时或者当用GISTIC算法得到G分数>0.08或者G分数
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公开(公告)号:CN103031276A
公开(公告)日:2013-04-10
申请号:CN201210344231.5
申请日:2012-09-17
IPC分类号: C12N5/09
CPC分类号: C12N5/0087 , C12N5/0693 , G01N33/574
摘要: 本发明公开了一种获取循环肿瘤单细胞的方法,包括如下步骤:a)富集体液样本中的循环肿瘤细胞;b)识别出所述循环肿瘤细胞;c)分离出单个循环肿瘤细胞。通过将体液样本中的循环肿瘤细胞一个个单独分离出来,从而便于后续的检测和科学研究。
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公开(公告)号:CN104141009B
公开(公告)日:2016-11-16
申请号:CN201410310846.5
申请日:2014-07-01
IPC分类号: C12Q1/68
摘要: 本发明早期膀胱癌的多靶标检测方法,属于生物检测技术领域。包括下述步骤:(1)、提取患者尿液中所含的DNA;(2)、对步骤(1)获得的DNA进行亚硫酸氢盐转化处理;(3)、通过甲基化特异性荧光定量PCR对EOMES、GDF15、NID2、PCDH17、POU4F2、TCF21、ZNF154这七个标志物基因进行检测,以ALU‑C4作为内参基因;(4)、以步骤(3)中的CT值来判定患者是否为早期膀胱癌。本发明具有以下优点:采用多个生物标志物基因联合检测,在每个标志物的特异性都比较高的前提下,使用多个标志物联用的方式来提高检测的敏感性和特异性;根据多个生物标志物基因设计了特异性引物。
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公开(公告)号:CN103776836A
公开(公告)日:2014-05-07
申请号:CN201210417286.4
申请日:2012-10-26
IPC分类号: G01N21/85
摘要: 本发明公开了一种基于尿液的早期膀胱癌检查方法及系统,包括如下步骤:a)制作尿液的病理玻片;b)通过具有显微镜头的图像获取机构获取病理玻片的图像;c)获取所述图像中各细胞的细胞核细胞质的面积比K;d)比较所述面积比K和预设的面积比范围,根据比较结果检查出疑似癌变细胞。该方法和系统能够对所获取的细胞信息进行全检、比对,快速得到癌变细胞的检查结果,为医生后续进行癌变细胞确认提供了精准的一手数据。
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